CSPG4 (chondroitin sulfate proteoglycan 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CSPG4
locus group:
protein-coding gene
location:
15q24.2
gene_family:
Proteoglycans - ungrouped
alias symbol:
MCSPG|MEL-CSPG|MSK16|NG2|MCSP|HMW-MAA|CSPG4A
alias name:
melanoma-associated chondroitin su…
entrez id:
1464
ensembl gene id:
ENSG00000173546
ucsc gene id:
uc002baw.3
refseq accession:
NM_001897
hgnc_id:
HGNC:2466
approved reserved:
1997-11-28

基因染色体位置

基因染色体位置

15q24.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

A human melanoma-associated chondroitin sulfate proteoglycan plays a role in stabilizing cell-substratum interactions during early events of melanoma cell spreading on endothelial basement membranes. CSPG4 represents an integral membrane chondroitin sulfate proteoglycan expressed by human malignant melanoma cells. [provided by RefSeq, Jul 2008]

A人类黑色素瘤相关硫酸软骨素蛋白多糖起到期间内皮基底膜蔓延黑色素瘤细胞的早期事件稳定细胞基质相互作用的作用。 CSPG4表示由人恶性黑色素瘤细胞中表达的一种完整的膜硫酸软骨素蛋白多糖。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CSPG4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1127646       rs1127647       rs1127648       rs1127649       rs1127650       rs1127652       rs4077529       rs4283203       rs4293340       rs4293341       rs4414463       rs4573902       rs4592617       rs4886454       rs4886730       rs4886731       rs4886732      

基因表达

基因表达

CSPG4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGGAAGAACAAAGGTCTCTG
59
AAGAGATTGGAGGCATCCA
58
TGGAAGAACAAAGGTCTCTG
58
CAAGAGATTGGAGGCATCC
58
CTGGAAGAACAAAGGTCTCTG
59
AAGAGATTGGAGGCATCCAG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CSPG4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CSPG4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000187
Q6UVK1 (UniProtKB)
IEA
GO:0001525
Q6UVK1 (UniProtKB)
IEA
GO:0004871
Q6UVK1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
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Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005796
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005925
Q6UVK1 (UniProtKB)
IDA
GO:0007169
Q6UVK1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008283
Q6UVK1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008347
Q6UVK1 (UniProtKB)
IEA
GO:0009986
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0009986
Q6UVK1 (UniProtKB)
IDA
GO:0016324
Q6UVK1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016477
Q6UVK1 (UniProtKB)
IBA
GO:0019901
Q6UVK1 (UniProtKB)
IPI
GO:0030203
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0030206
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0030207
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0030208
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0031258
Q6UVK1 (UniProtKB)
IEA
GO:0035556
Q6UVK1 (UniProtKB)
IDA
GO:0043202
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0043202
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0043202
Q6UVK1 (UniProtKB)
TAS
GO:0048771
Q6UVK1 (UniProtKB)
IEA
GO:0050731
Q6UVK1 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q6UVK1 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q6UVK1 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CSPG4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Experimental Autoimmune Encephalomyelitis 0.08 1 0 RGD
Brain Ischemia 0.08 1 0 RGD
Reperfusion Injury 0.08 1 0 RGD
Cerebrovascular accident 0.08 1 0 RGD
melanoma 0.00979177 17 1 BeFree_LHGDN
Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia Lymphoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Angiomyolipoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Sarcoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Alzheimer's Disease 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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