CRY1 (cryptochrome circadian regulator 1)

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CRY1
locus group:
protein-coding gene
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12q23.3
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None
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None
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1407
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ENSG00000008405
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uc001tmi.5
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NM_004075
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HGNC:2384
approved reserved:
1996-10-26
12q23.3
基因染色体位置图

CRY1(Cryptochrome 1)是一种光敏蛋白基因,属于隐花色素(Cryptochrome)基因家族,该家族还包括CRY2。隐花色素家族成员主要参与调控生物钟(昼夜节律)和光信号传导,在哺乳动物中,CRY1和CRY2通过与CLOCK和BMAL1蛋白形成复合物来抑制自身的转录,从而维持24小时的生物钟周期。CRY1主要在视网膜、大脑和许多外周组织中表达,其表达产物是一种蓝光敏感的蛋白质,能够感知环境光信号并调节生理节律。CRY1的生物学功能包括参与DNA修复、细胞周期调控以及抑制某些转录因子的活性。突变或异常表达CRY1会对生物钟功能产生显著影响,例如某些CRY1突变会导致家族性睡眠相位延迟综合征(FASPS),表现为入睡和觉醒时间显著延迟。此外,CRY1的异常表达还与抑郁症、代谢紊乱(如肥胖和糖尿病)以及某些癌症的发生有关。当CRY1过表达时,会过度抑制CLOCK-BMAL1复合物的活性,导致生物钟周期延长,影响睡眠-觉醒周期和代谢功能;而降低CRY1表达则可能导致生物钟紊乱,表现为昼夜节律失调和代谢异常。CRY1还与其他基因如PER1、PER2相互作用,共同维持生物钟的稳定性。隐花色素基因家族的共性在于它们都含有黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)结合域,能够感知蓝光并参与光依赖性信号通路,同时在进化上高度保守,从植物到动物都发挥重要的生理功能。

This gene encodes a flavin adenine dinucleotide-binding protein that is a key component of the circadian core oscillator complex, which regulates the circadian clock. This gene is upregulated by CLOCK/ARNTL heterodimers but then represses this upregulation in a feedback loop using PER/CRY heterodimers to interact with CLOCK/ARNTL. Polymorphisms in this gene have been associated with altered sleep patterns. The encoded protein is widely conserved across plants and animals. Loss of the related gene in mouse results in a shortened circadian cycle in complete darkness. [provided by RefSeq, Jan 2014]

这个基因编码黄素腺嘌呤二核苷酸结合蛋白是这样的昼夜芯振荡器复杂,其调节生物钟的一个关键组成部分。该基因是由时钟/ ARNTL异上调但随后压制这种上调使用PER / CRY异与时钟/ ARNTL互动反馈环路。在这个基因多态性已与改变睡眠模式有关。所编码的蛋白质被跨越的植物和动物广泛保守的。在完全黑暗缩短昼夜周期中的鼠标结果相关基因的缺失。 [由RefSeq的,2014年1月提供]

CRY1基因的碱基序列:[NCBI]
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CRY1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1017168       rs1056554       rs1056555       rs1056556       rs1056560       rs1345361       rs1420399       rs1628141       rs1861591       rs1882208       rs1882209       rs1921126       rs1921130       rs1921135       rs2078074       rs2300448       rs2300449      

CRY1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTCACTGGAAGAGCTAGGT
58
CTTCAGTTTCTCCACCTGG
57
ACTATATCAGGCGTTATTTGCC
59
TACCTTCTGGTGCATTCCA
59
AGGTGGCGAATTTACATTGAC
59
GTAGTGTTGGAATAACTGGCC
59
GACCAAACACCAGGAAAGG
59
AGACTAAGATGCAACTGAACC
58
TATGGAGTCCCTTCACTGGA
60
ACACTGCAGAGGATAAGCC
60
GAAGCAAGGAAGAAGCTCC
59
GACTTTAGGACCAATACTCTGTG
59
CCTAATGGGAATGGAGGCT
58
CCCTTGAGAGCAACTTCCA
59
TGAAGCAAGGAAGAAGCTC
58
ACTTTAGGACCAATACTCTGTG
58
AAACACCAGGAAAGGAAGC
58
TCTGAGACTAAGATGCAACTG
58
TCCTAATGGGAATGGAGGC
58
CCTTGAGAGCAACTTCCAC
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
ARNTL
CRY1
Activation
ARNTL
CRY1
Unknown
CLOCK
CRY1
Activation
CLOCK
CRY1
Unknown
NPAS2
CRY1
Unknown

CRY1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CRY1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000122
Q16526 (UniProtKB)
IDA
GO:0000122
Q16526 (UniProtKB)
IDA
GO:0000122
Q16526 (UniProtKB)
IDA
GO:0000166
Q16526 (UniProtKB)
IEA
GO:0000989
Q16526 (UniProtKB)
IDA
GO:0001046
Q16526 (UniProtKB)
IEA
GO:0001047
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0003677
Q16526 (UniProtKB)
TAS
GO:0003690
Q16526 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q16526 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16526 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16526 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16526 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16526 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16526 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0005739
Q16526 (UniProtKB)
IEA
GO:0006094
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0006351
Q16526 (UniProtKB)
IEA
GO:0006975
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0008134
Q16526 (UniProtKB)
IEA
GO:0009785
Q16526 (UniProtKB)
NAS
GO:0009882
Q16526 (UniProtKB)
NAS
GO:0018298
Q16526 (UniProtKB)
IEA
GO:0019901
Q16526 (UniProtKB)
IEA
GO:0019902
Q16526 (UniProtKB)
IPI
GO:0019915
Q16526 (UniProtKB)
IEA
GO:0031397
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0032868
Q16526 (UniProtKB)
IEA
GO:0032922
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0033762
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0035257
Q16526 (UniProtKB)
IPI
GO:0042593
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0042752
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0042754
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0042826
Q16526 (UniProtKB)
IEA
GO:0043130
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0043153
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0045744
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0045892
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:0045892
Q16526 (UniProtKB)
IDA
GO:0045892
Q16526 (UniProtKB)
IDA
GO:2000001
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:2000323
Q16526 (UniProtKB)
ISS
GO:2000850
Q16526 (UniProtKB)
IEA
GO:0003904
Q16526 (UniProtKB)
IDA
GO:0003914
Q16526 (UniProtKB)
IDA

可能调控 CRY1基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Myeloid Leukemia, Chronic 0.12 1 0 CTD_human
Bipolar Disorder 0.005276948 3 0 BeFree_GAD
Schizophrenia 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Mental Depression 0.002909916 3 0 BeFree_GAD
Malignant neoplasm of prostate 0.002638474 1 12 BeFree_GAD
Heroin Dependence 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Sleep Disorders 0.002367032 1 0 GAD
Albuminuria 0.002367032 1 1 GAD
Creatinine finding 0.002367032 1 1 GAD

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