CPSF4 (cleavage and polyadenylation specific factor 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CPSF4
locus group:
protein-coding gene
location:
7q22.1
gene_family:
alias symbol:
NAR|CPSF30
alias name:
None
entrez id:
10898
ensembl gene id:
ENSG00000160917
ucsc gene id:
uc003uqj.4
refseq accession:
NM_001081559
hgnc_id:
HGNC:2327
approved reserved:
2000-05-31

基因染色体位置

基因染色体位置

7q22.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CPSF4（Cleavage and Polyadenylation Specificity Factor Subunit 4）是切割与多聚腺苷酸化特异性因子（CPSF）复合体的一个关键亚基，属于CPSF基因家族。该家族成员共同参与真核生物mRNA的3'端加工过程，尤其是前体mRNA的切割和多聚腺苷酸化，这是基因表达调控的重要步骤。CPSF4在识别多聚腺苷酸化信号（AAUAAA）和招募其他加工因子中起核心作用，确保mRNA的稳定性和翻译效率。CPSF4主要在细胞核内发挥作用，其表达水平影响多种生理过程，如细胞周期调控、发育和免疫应答。突变或异常表达可能导致mRNA加工缺陷，进而引发疾病。例如，CPSF4的突变与神经发育障碍、癌症（如白血病和实体瘤）相关，因其错误调控会破坏关键基因的表达平衡。过表达CPSF4可能增强某些致癌基因的mRNA稳定性，促进肿瘤生长；而表达降低则可能导致重要基因（如抑癌基因）的mRNA加工异常，引发细胞凋亡或功能紊乱。此外，CPSF4与其他CPSF成员（如CPSF1、CPSF2）协同工作，家族共性在于均含有保守的蛋白互作结构域（如WD40重复序列），共同维持复合体的稳定性与功能。研究还发现CPSF4与病毒感染有关，某些病毒（如HIV）会劫持宿主CPSF复合体以完成自身RNA加工。因此，CPSF4不仅是基础分子生物学研究的重点，也是潜在的治疗靶点。

Inhibition of the nuclear export of poly(A)-containing mRNAs caused by the influenza A virus NS1 protein requires its effector domain. The NS1 effector domain functionally interacts with the cellular 30 kDa subunit of cleavage and polyadenylation specific factor 4, an essential component of the 3' end processing machinery of cellular pre-mRNAs. In influenza virus-infected cells, the NS1 protein is physically associated with cleavage and polyadenylation specific factor 4, 30kD subunit. Binding of the NS1 protein to the 30 kDa protein in vitro prevents CPSF binding to the RNA substrate and inhibits 3' end cleavage and polyadenylation of host pre-mRNAs. Thus the NS1 protein selectively inhibits the nuclear export of cellular, and not viral, mRNAs. Multiple alternatively spliced transcript variants that encode different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

引起流感的poly（A）的核出口的抑制mRNA的含病毒NS1蛋白需要其效应结构域。所述NS1效应物结构域在功能上与切割和多腺苷酸化特定因子4，蜂窝预mRNA的3‘末端的加工机械的一个基本组成部分的蜂窝30kDa的亚基相互作用。在流感病毒感染的细胞中，NS1蛋白物理上与切割和聚腺苷酸化特定因子4，30KD亚基相关联。 NS1蛋白在体外的30 kDa蛋白的结合可防止CPSF结合到RNA底物，并抑制3‘末端切割和主机预mRNA的聚腺苷酸化。从而NS1蛋白选择性地抑制细胞的核出口，而不是病毒，的mRNA。编码不同同种型的多个可变剪接转录物变体已被用于这个基因说明。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CPSF4基因的介绍     Wikipedia数据库中对CPSF4基因的介绍

基因序列

基因序列

CPSF4基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

CPSF4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs8794       rs11931       rs883403       rs940334       rs1043466       rs2280600       rs2404487       rs2404488       rs3779354       rs3823813       rs4729538       rs6955891       rs10215854       rs11539770       rs11773891       rs12535424       rs13227522      

基因表达

基因表达

CPSF4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CACCTGTTACAAGTGTGGC
59
TCACTGTCCACTGAGAAAGG
59
GATTTGAACTGCCCATGGG
59
GATTGTTACTTTGCTTTGCTGG
59
GATTTGAACTGCCCATGGG
59
GATTGTTACTTTGCTTTGCTGG
59
CACCTGTTACAAGTGTGGC
59
TCACTGTCCACTGAGAAAGG
59
CACCTGTTACAAGTGTGGC
59
TCACTGTCCACTGAGAAAGG
59
TGTCCTTGGTATGACCGTG
59
AGTTCAAATCGAGGGTGCA
59
TGTAAATTCATGCACCCTCG
59
ACTTCCTTCCTACCGAGGA
59
TCTACTCCAAGTTCGGTCC
58
CATGAATTTACACGAGGGCC
59
CACCTGTTACAAGTGTGGC
59
TCACTGTCCACTGAGAAAGG
59
GTATGACATGACCAAGATGCC
59
ATTCCTTGTTGCTGCACTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CPSF4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CPSF4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003676
B7Z7B0 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
B7Z7B0 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
C9JEV9 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
C9JEV9 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
C9K0K2 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
H7C016 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
H7C419 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
O95639 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
O95639 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O95639 (UniProtKB)
TAS
GO:0005847
O95639 (UniProtKB)
IDA
GO:0006388
O95639 (UniProtKB)
TAS
GO:0006397
O95639 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
O95639 (UniProtKB)
IEA
GO:0044822
O95639 (UniProtKB)
IDA
GO:0046778
O95639 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CPSF4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Adenocarcinoma of lung (disorder) 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Adenocarcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系地址

山东省济南市章丘区文博路2号

齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号

大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。


商务邮箱

E-mail: product@genelibs.com

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备20007159号-2