CPNE5 (copine 5)

symbol:
CPNE5
locus group:
protein-coding gene
location:
6p21.2
gene_family:
Copines
alias symbol:
CPN5|COPN5|KIAA1599
alias name:
None
entrez id:
57699
ensembl gene id:
ENSG00000124772
ucsc gene id:
uc003omr.2
refseq accession:
NM_020939
hgnc_id:
HGNC:2318
approved reserved:
1999-02-09
6p21.2
基因染色体位置图

CPNE5(Copine V)属于Copine基因家族,该家族由9个成员(CPNE1-9)组成,是一类钙离子依赖性磷脂结合蛋白,广泛参与细胞信号转导、膜运输和细胞黏附等过程。CPNE5主要在神经系统高表达,尤其在神经元中富集,其表达产物是一种多功能蛋白,通过钙离子结合域和两个C2结构域与细胞膜相互作用,参与突触可塑性、神经发育和神经保护等生物学功能。CPNE5的特点在于其独特的组织分布模式,相比其他家族成员更局限于脑组织,尤其在杏仁核、海马和大脑皮层中表达显著。该基因通过调控钙信号通路影响神经元活动,并与突触小泡的运输和神经递质释放过程相关。CPNE5基因突变可能导致其钙结合能力受损,与神经发育障碍和精神疾病(如精神分裂症和自闭症谱系障碍)存在潜在关联。研究发现CPNE5过表达会增强神经元突触形成和神经突生长,可能通过激活Rac1信号通路促进神经再生;而敲低表达则导致突触功能异常和认知行为缺陷,在动物模型中表现为学习记忆障碍。Copine家族共性在于均含有N端双C2结构域和C端von Willebrand因子A结构域,通过钙依赖方式介导膜结合与蛋白相互作用,但各成员在组织分布和功能上存在差异。CPNE5与家族其他成员相比,其神经系统特异性更高,且可能具有独特的底物结合特性。最新研究还发现CPNE5与阿尔茨海默病的病理进程相关,其表达水平在患者脑组织中异常变化,可能通过影响β-淀粉样蛋白代谢参与神经退行性变过程。

Calcium-dependent membrane-binding proteins may regulate molecular events at the interface of the cell membrane and cytoplasm. This gene is one of several genes that encode a calcium-dependent protein containing two N-terminal type II C2 domains and an integrin A domain-like sequence in the C-terminus. Sequence analysis identified multiple alternatively spliced transcript variants but their full-length natures could not be determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

钙依赖的膜结合蛋白可以调节在细胞膜和细胞质的界面的分子事件。该基因是编码含有两个二C 2 N-末端型结构域的钙依赖性蛋白几个基因中的一个和一个整合在C末端A结构域样序列。序列分析鉴定多个可变剪接转录物变体,但它们的全长性质无法确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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CPNE5基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3259       rs86707       rs110033       rs171032       rs171033       rs171034       rs180500       rs186890       rs236356       rs236357       rs236358       rs236359       rs236360       rs236361       rs236362       rs236363       rs236364      

CPNE5基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGCAACTGTAGGGATGTC
57
TTCTGTAGAATACCAAGAAGGG
57
CACGGTAAAGATCAGCTGAC
58
GTTTACCACCTCCTGTGCT
59
CGACAGTGACAAGATGTTCC
59
TCTCCTGGTTGCCATTCAG
59
ACAGTGACAAGATGTTCCCT
59
TCTCCTGGTTGCCATTCAG
59
GTAAAGATCAGCTGACGGC
58
GTTTACCACCTCCTGTGCT
59
TTCGAGGAGAAGCAGAACC
59
CCCAGGAAATCGTGTTTGG
59
GTGACAAGATGTTCCCTGC
58
TCTCCTGGTTGCCATTCAG
59
CGAGGAGAAGCAGAACCTC
59
CCCAGGAAATCGTGTTTGG
59
TAAAGATCAGCTGACGGCC
59
GTTTACCACCTCCTGTGCT
59
      尚未收录相关数据

CPNE5基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CPNE5基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003674
Q9HCH3 (UniProtKB)
ND
GO:0043005
Q9HCH3 (UniProtKB)
IEA
GO:0043204
Q9HCH3 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q9HCH3 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q9HCH3 (UniProtKB)
IDA
GO:1903861
Q9HCH3 (UniProtKB)
IDA

可能调控 CPNE5基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

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