COMMD3-BMI1 (COMMD3-BMI1 readthrough)

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COMMD3-BMI1
locus group:
other
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10p12.2
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ENSG00000269897
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NM_001204062
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HGNC:48326
approved reserved:
2013-05-08
10p12.2
基因染色体位置图

COMMD3-BMI1是一个融合基因,由COMMD3基因和BMI1基因通过染色体易位形成。BMI1基因属于多梳抑制复合物1(PRC1)基因家族,该家族成员主要参与表观遗传调控,通过抑制靶基因表达来维持干细胞自我更新和细胞命运决定。PRC1家族基因的共同特点是含有RING finger结构域,能够催化组蛋白H2A的泛素化,从而沉默发育相关基因。BMI1本身是一种重要的原癌基因,其正常功能包括维持干细胞干性、抑制细胞衰老和凋亡。BMI1过表达常见于多种癌症(如白血病、神经胶质瘤、乳腺癌等),会导致细胞增殖失控和分化阻滞。相反,BMI1表达降低会诱发干细胞耗竭和早衰现象。COMMD3基因编码的蛋白参与铜代谢和NF-κB信号通路调控。当形成COMMD3-BMI1融合基因后,通常会保留BMI1的RING结构域和大部分功能区域,导致BMI1功能异常增强。这种融合基因在部分B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)病例中被发现,可能通过异常激活PRC1复合物功能来促进白血病发生。融合基因的产生会使BMI1脱离正常调控,造成靶基因(如INK4a/ARF肿瘤抑制基因座)的持续抑制,从而促进细胞恶性转化。目前针对BMI1过表达的治疗策略包括小分子抑制剂(如PTC-209)和基因沉默技术,但针对COMMD3-BMI1融合基因的特异性疗法仍在研究中。该融合基因的检测可作为某些血液恶性肿瘤的分子标志物。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring COMM domain-containing protein 3 and polycomb complex protein BMI-1 genes on chromosome 10. The read-through transcript produces a fusion protein that shares sequence identity with each individual gene product. [provided by RefSeq, Feb 2011]

此轨迹表示天然存在的相邻结构域的COMM蛋白3和聚硫复合蛋白之间通读转录BMI-1基因的染色体10上的读通过转录产生共享序列同一性与每个独立的融合蛋白基因产物。 [由RefSeq的,2011年2月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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COMMD3-BMI1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs10146       rs1042059       rs1042099       rs1125094       rs1170546       rs7080076       rs7915645       rs7919132       rs11012946       rs11012947       rs12269392       rs12269472       rs12412271       rs12569429       rs28364739       rs41277396       rs60234884      

COMMD3-BMI1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAACATATCGACCCAGTGG
59
CAGTCTTCTAGATAAGTGCTTAGAG
59
GGCCGTGTTAGATCATCCA
59
ATGTAAGTTGCAGCTGCTG
58
TCCTACTGGGAAGTATAGGCA
60
CTGTACATCCTATGAAGTTGATTGG
60
AGGTTGCAGATGAAGATAAGAG
58
CGATCCAATCTGTTCTGGT
57
ATGAGGAGGAACCTTTAAAGG
57
GAAGTGGACCATTCCTTCTC
58
CTTGGCGCTTGGAATATCAG
60
GGGAATCAGTGTTCTGTACAC
59
GGCCGTGTTAGATCATCCA
60
ATGTAAGTTGCAGCTGCTG
59
CAGCAATGACTGTGATGCA
59
CCTCATACATGACATCAATCTGG
59
AAACATATCGACCCAGTGGT
59
CAGTCTTCTAGATAAGTGCTTAGAG
59
TTGGCGCTTGGAATATCAG
58
GGGAATCAGTGTTCTGTACAC
59
      尚未收录相关数据

COMMD3-BMI1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

COMMD3-BMI1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008270
R4GMX3 (UniProtKB)
IEA

可能调控 COMMD3-BMI1基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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