CNOT9 (CCR4-NOT transcription complex subunit 9)

symbol:
CNOT9
locus group:
protein-coding gene
location:
2q35
gene_family:
alias symbol:
RCD1|RCD1+|CT129|CAF40
alias name:
cancer/testis antigen 129
entrez id:
9125
ensembl gene id:
ENSG00000144580
ucsc gene id:
uc010zkh.4
refseq accession:
NM_005444
hgnc_id:
HGNC:10445
approved reserved:
1999-11-22
2q35
基因染色体位置图

CNOT9(CCR4-NOT转录复合物亚基9)是CCR4-NOT基因家族的核心成员之一,该家族在真核生物中高度保守,主要参与转录调控、mRNA降解和翻译抑制等过程。CCR4-NOT复合物由多个亚基组成(如CNOT1-11),其共性是通过去腺苷酸化(即移除mRNA的poly(A)尾巴,一种稳定mRNA的结构)调控基因表达,从而影响细胞代谢、发育和应激反应。CNOT9作为复合物的关键亚基,直接结合RNA和其他蛋白质,协助复合物靶向特定mRNA。其生物学功能包括调控胚胎发育、维持干细胞多能性(干细胞分化为多种细胞类型的能力)以及参与昼夜节律调节。在作用位点上,CNOT9通过与其他亚基(如CNOT1、CNOT7/8)相互作用,在细胞质和细胞核中发挥作用,影响mRNA的稳定性和翻译效率。若CNOT9发生功能丧失性突变(失去正常功能的突变),可能导致mRNA降解异常,引发胚胎致死或发育缺陷;某些错义突变(单个氨基酸改变的突变)则与智力障碍或癌症相关,例如乳腺癌中CNOT9表达异常可能促进肿瘤转移。过表达CNOT9可能破坏mRNA稳态,导致细胞周期紊乱或凋亡(程序性细胞死亡)抑制,而低表达会削弱CCR4-NOT复合物功能,影响全局基因表达谱,例如降低抗病毒反应相关基因的表达。在疾病方面,CNOT9异常与神经退行性疾病、代谢综合征和多种癌症相关,其机制涉及对关键信号通路(如Wnt/β-catenin)的间接调控。该基因家族成员均含有保守的NOT结构域,但CNOT9独特之处在于其RNA结合能力更强,且对复合物的组装至关重要。

This gene encodes a member of the highly conserved RCD1 protein family. The encoded protein is a transcriptional cofactor and a core protein of the CCR4-NOT complex. It may be involved in signal transduction as well as retinoic acid-regulated cell differentiation and development. Alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2012]

该基因编码高度保守的RCD1蛋白家族的一个成员。所编码的蛋白质是转录辅助因子和的CCR4-NOT复合物的核心蛋白。它可能参与信号转导,以及视黄酸调节细胞分化和发育。可变剪接转录物变体已被用于这个基因说明。 [由RefSeq的,2012年10月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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CNOT9基因的碱基突变:           仅显示部分snp

CNOT9基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

CNOT9基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CNOT9基因的本体(GO)信息:

可能调控 CNOT9基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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