CNOT2 (CCR4-NOT transcription complex subunit 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CNOT2
locus group:
protein-coding gene
location:
12q15
gene_family:
alias symbol:
CDC36|NOT2H
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CC chemokine receptor 4-negative r…
entrez id:
4848
ensembl gene id:
ENSG00000111596
ucsc gene id:
uc001svv.4
refseq accession:
NM_001199302
hgnc_id:
HGNC:7878
approved reserved:
1996-07-19

基因染色体位置

基因染色体位置

12q15
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CNOT2（CCR4-NOT转录复合物亚基2）是CCR4-NOT复合物的核心组成部分，该复合物是一个高度保守的多蛋白复合物，在真核生物中广泛存在，主要参与基因表达的转录后调控，包括mRNA降解、翻译抑制和转录调控。CNOT2作为支架蛋白，帮助维持复合物的结构完整性，并与其他亚基（如CNOT1、CNOT3、CNOT6/6L等）协同作用。CNOT2通过其N端与CNOT1结合，C端与NOT模块相互作用，从而介导复合物的组装和功能。在生物学功能上，CNOT2参与调控细胞周期、增殖、分化及应激反应，尤其在胚胎发育和免疫系统中发挥关键作用。其表达产物通过降解特定mRNA（如细胞周期相关基因或炎症因子mRNA）来精细调控这些过程。若CNOT2发生功能丧失性突变，可能导致mRNA降解异常，造成基因表达紊乱，与发育缺陷、智力障碍或癌症（如白血病、乳腺癌）相关。例如，CNOT2缺失会破坏CCR4-NOT复合物的稳定性，影响靶mRNA的脱腺苷酸化过程，导致促癌基因（如MYC）的异常积累。过表达CNOT2可能增强mRNA降解活性，抑制特定通路（如Wnt/β-catenin），但也可因过度抑制必需基因而引发细胞凋亡；反之，低表达会削弱复合物功能，使促炎或促增殖mRNA稳定性增加，加剧炎症或肿瘤发生。CNOT2属于CCR4-NOT基因家族，该家族成员均参与转录调控和mRNA代谢，其共性包括：（1）含有NOT结构域介导蛋白互作；（2）通过脱腺苷酸酶（如CNOT6/6L）或RNA结合蛋白（如TNRC6）招募靶RNA；（3）响应细胞信号（如缺氧、DNA损伤）动态调节基因网络。在进化上，该家族从酵母到人类高度保守，凸显其基础调控地位。研究还发现CNOT2与病毒感染（如HIV）相关，因其可调控病毒RNA稳定性，成为潜在治疗靶点。

This gene encodes a subunit of the multi-component CCR4-NOT complex. The CCR4-NOT complex regulates mRNA synthesis and degradation and is also thought to be involved in mRNA splicing, transport and localization. The encoded protein interacts with histone deacetylases and functions as a repressor of polymerase II transcription. Alternatively spliced transcript variants have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2010]

该基因编码的多组分CCR4-NOT复合物的亚基。的CCR4-NOT复合物调控mRNA的合成和降解，也被认为是参与mRNA剪接，运输和定位。所编码的蛋白质与组蛋白脱乙酰并且用作聚合酶??II转录的阻抑相互作用。可变剪接转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的，2010年12月提供]

OMIM数据库中对CNOT2基因的介绍     Wikipedia数据库中对CNOT2基因的介绍

基因序列

基因序列

CNOT2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CNOT2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs717956       rs720653       rs788375       rs788376       rs788377       rs788378       rs788379       rs940429       rs1062308       rs1404123       rs1404124       rs1404125       rs1433370       rs1464738       rs1469730       rs1524245       rs1524246      

基因表达

基因表达

CNOT2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGAAGTTGCACAGACGTG
59
GAATCACTTGAACTTGGGAGG
59
ACATTAGGGATAAGCTGGCT
59
GTCTCCTCCATTCATGTAATAGAG
58
AAGGCACTCAGTTACCGAG
59
ATCCAGACATACTGCTTGGAG
60
GGCAACAAAGTGCACTAGG
60
GAGTGCCTTGTGATAAGCTG
59
GAAACTACCAGGTGACAAACAG
60
TCGTCATGGTAGTCACTGTC
59
GGAAAGTAGCTAAGGAGTTCC
58
GGTTGTAGTTGAAGGTGGA
57
GTCAGCTGTCTCAGTTTGG
59
GAAAGGTCCAATCCTGTCAC
59
GGAAAGTAGCTAAGGAGTTCC
58
GGTTGTAGTTGAAGGTGGA
57
GGAAAGTAGCTAAGGAGTTCC
58
GGTTGTAGTTGAAGGTGGA
57
TTTGGAATGAACAGGAATCAGG
59
TTTCACTTCCGTCTGTTCCA
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CNOT2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CNOT2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
F8VV52 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
F8VV52 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
H0YH84 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
H0YH84 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
H0YHT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
H0YHT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
H0YI11 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
H0YI11 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
H0YI80 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
H0YI80 (UniProtKB)
IEA
GO:0000122
Q9NZN8 (UniProtKB)
IDA
GO:0000122
Q9NZN8 (UniProtKB)
IDA
GO:0000288
Q9NZN8 (UniProtKB)
IBA
GO:0000289
Q9NZN8 (UniProtKB)
TAS
GO:0000932
Q9NZN8 (UniProtKB)
IBA
GO:0001104
Q9NZN8 (UniProtKB)
TAS
GO:0001226
Q9NZN8 (UniProtKB)
IDA
GO:0001829
Q9NZN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9NZN8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NZN8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NZN8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NZN8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NZN8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NZN8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NZN8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NZN8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NZN8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NZN8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NZN8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9NZN8 (UniProtKB)
NAS
GO:0005737
Q9NZN8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q9NZN8 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9NZN8 (UniProtKB)
TAS
GO:0006351
Q9NZN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
Q9NZN8 (UniProtKB)
NAS
GO:0006977
Q9NZN8 (UniProtKB)
TAS
GO:0010606
Q9NZN8 (UniProtKB)
IMP
GO:0016020
Q9NZN8 (UniProtKB)
IDA
GO:0017148
Q9NZN8 (UniProtKB)
IBA
GO:0030014
Q9NZN8 (UniProtKB)
IDA
GO:0030015
Q9NZN8 (UniProtKB)
IBA
GO:0031047
Q9NZN8 (UniProtKB)
IEA
GO:0033147
Q9NZN8 (UniProtKB)
IMP
GO:0090503
Q9NZN8 (UniProtKB)
IEA
GO:2000036
Q9NZN8 (UniProtKB)
IMP
GO:0004535
Q9NZN8 (UniProtKB)
IMP

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CNOT2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Coronary Artery Disease 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant tumor of colon 0.000271442 1 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Optic Neuritis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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