CNN3 (calponin 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CNN3
locus group:
protein-coding gene
location:
1p21.3
gene_family:
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None
alias name:
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1266
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ENSG00000117519
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uc001dqz.6
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NM_001839
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HGNC:2157
approved reserved:
1996-08-16

基因染色体位置

基因染色体位置

1p21.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CNN3（Calponin 3）是一种肌动蛋白结合蛋白，属于钙调蛋白（Calponin）基因家族，该家族还包括CNN1和CNN2。钙调蛋白家族成员主要参与调节平滑肌和非肌肉细胞的收缩功能，通过与肌动蛋白和原肌球蛋白相互作用来调控细胞骨架的动态变化。CNN3在多种组织中表达，包括平滑肌、大脑、胎盘和肺等，其功能不仅限于肌肉收缩，还涉及细胞迁移、粘附和形态维持等过程。CNN3通过其N端的钙调蛋白同源结构域和C端的重复序列与肌动蛋白结合，从而影响细胞骨架的重排和力学特性。CNN3的突变或表达异常可能导致细胞运动功能障碍，与多种疾病相关，例如癌症转移、心血管疾病和神经系统疾病。研究表明，CNN3在某些肿瘤中过表达可能促进癌细胞的侵袭和迁移能力，而在其他情况下，CNN3表达降低可能与平滑肌功能紊乱或血管异常有关。CNN3还与炎症反应和纤维化过程相关，其表达水平的变化可能影响组织修复和病理重塑。在基因家族中，CNN1主要存在于平滑肌中，CNN2分布更广泛，而CNN3则表现出更复杂的表达模式，可能在非肌肉细胞中发挥独特作用。总体而言，CNN3通过调控细胞骨架动力学参与多种生理和病理过程，其表达水平的异常可能对疾病发展产生重要影响。

This gene encodes a protein with a markedly acidic C terminus; the basic N-terminus is highly homologous to the N-terminus of a related gene, CNN1. Members of the CNN gene family all contain similar tandemly repeated motifs. This encoded protein is associated with the cytoskeleton but is not involved in contraction. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基??因编码具有明显的酸性C端的蛋白质;基本N-末端是高度同源的相关基因，CNN1的N末端。 CNN的基因家族的所有成员包含类似的串联重复图案。这个编码的蛋白与细胞骨架有关，但不参与收缩。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CNN3基因的介绍     Wikipedia数据库中对CNN3基因的介绍

基因序列

基因序列

CNN3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CNN3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1132       rs10803       rs859040       rs859041       rs859042       rs859043       rs859044       rs859045       rs859046       rs859047       rs859048       rs859049       rs859050       rs859051       rs859052       rs859053       rs859054      

基因表达

基因表达

CNN3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTATAAACAAGCTACAGCCAGG
59
TGCCAATATTCTCCAACTGAG
58
TTATAAACAAGCTACAGCCAGG
58
TGCCAATATTCTCCAACTGAG
58
CAGACTTATAAACAAGCTACAGCC
60
ATATTCTCCAACTGAGGCCAG
60
AAATAGCCATGTTTGCTAGGC
59
GGAAGCAATCTTTCACCCG
59
TAATTGGTCTGCAGATGGG
57
CATAAAGATGCCTCCTAGTCC
58
GTCAAGAACAAGATTGCTTCCA
60
CAATGCTCATGCCTGTCAC
60
TTATAAACAAGCTACAGCCAGG
59
TGCCAATATTCTCCAACTGAG
58
TAATTGGTCTGCAGATGGG
57
CATAAAGATGCCTCCTAGTCC
57
GTCAAGAACAAGATTGCTTCCA
60
CAATGCTCATGCCTGTCAC
60
ATAGCCATGTTTGCTAGGC
58
TGGAAGCAATCTTTCACCC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CNN3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CNN3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003779
E9PDU6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005516
E9PDU6 (UniProtKB)
IEA
GO:0031032
E9PDU6 (UniProtKB)
IEA
GO:0003779
Q15417 (UniProtKB)
IEA
GO:0005516
Q15417 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q15417 (UniProtKB)
IDA
GO:0005925
Q15417 (UniProtKB)
IDA
GO:0008017
Q15417 (UniProtKB)
IEA
GO:0014069
Q15417 (UniProtKB)
IEA
GO:0015629
Q15417 (UniProtKB)
IDA
GO:0030855
Q15417 (UniProtKB)
IEP
GO:0031032
Q15417 (UniProtKB)
IEA
GO:0032780
Q15417 (UniProtKB)
IEA
GO:0043025
Q15417 (UniProtKB)
IEA
GO:0043197
Q15417 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CNN3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Animal Mammary Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Mammary Neoplasms, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Prostatic Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Mucosa-Associated Lymphoid Tissue Lymphoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Patent ductus arteriosus 0.000271442 1 0 BeFree
Epilepsy 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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