CLMP (CXADR like membrane protein)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CLMP
locus group:
protein-coding gene
location:
11q24.1
gene_family:
I-set domain containing|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
ASAM|FLJ22415|ACAM
alias name:
adipocyte-specific adhesion molecu…
entrez id:
79827
ensembl gene id:
ENSG00000166250
ucsc gene id:
uc001pyt.4
refseq accession:
NM_024769
hgnc_id:
HGNC:24039
approved reserved:
2011-01-27

基因染色体位置

基因染色体位置

11q24.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CLMP（CXADR-like membrane protein）是一种跨膜蛋白，属于免疫球蛋白超家族（IgSF）的成员，与柯萨奇病毒和腺病毒受体（CXADR）具有结构相似性。它主要在肠道、睾丸和胎盘等组织中表达，尤其在紧密连接（tight junction）中发挥重要作用。CLMP通过其胞外免疫球蛋白样结构域参与细胞间黏附，维持上皮屏障的完整性，并调节细胞极性。该基因的突变可能导致先天性短肠综合征（CSBS），这是一种罕见的肠道发育异常疾病，表现为肠道长度缩短和吸收功能障碍。CLMP突变会破坏紧密连接的结构，影响肠道上皮细胞的排列和屏障功能，导致营养吸收障碍和严重腹泻。此外，CLMP的表达异常还与炎症性肠病（IBD）和肠道感染有关，因为屏障功能受损会增加病原体入侵的风险。如果CLMP过表达，可能增强细胞间黏附并改善上皮屏障功能，但过度表达也可能干扰其他紧密连接蛋白（如occludin和claudins）的正常功能，导致细胞信号传导异常。反之，CLMP表达降低会削弱紧密连接，增加肠道通透性，引发炎症反应或代谢紊乱。CLMP属于CXADR相关蛋白家族，该家族成员通常具有免疫球蛋白样结构域，参与细胞间相互作用和信号转导。家族共性包括在组织发育和屏障功能中发挥作用，并与病毒感染或免疫调节相关。研究CLMP有助于理解肠道疾病机制，并为治疗屏障功能障碍提供潜在靶点。

The CTX (see VSIG2, MIM 606011) family of proteins, including ASAM, are type I transmembrane proteins within the Ig superfamily that localize to junctional complexes between endothelial and epithelial cells and may play a role in cell-cell adhesion (Raschperger et al., 2004 [PubMed 14573622]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

的CTX（见VSIG2，MIM 606011）家族蛋白质，包括ASAM的，被I型跨膜该定位于内皮细胞和上皮细胞之间连接复合并可能在细胞 - 细胞粘附作用（在免疫球蛋白超家族中的蛋白质Raschperger。等，2004年[搜索PubMed 14573622]）。[由OMIM，2008年3月提供的]

OMIM数据库中对CLMP基因的介绍     Wikipedia数据库中对CLMP基因的介绍

基因序列

基因序列

CLMP基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CLMP基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs476911       rs478164       rs481594       rs486800       rs489637       rs494809       rs519179       rs520220       rs520223       rs520264       rs523168       rs524206       rs525702       rs539232       rs541982       rs564741       rs568735      

基因表达

基因表达

CLMP基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACTGTACAGTGAGCAGTGAC
60
CTTTCCTTCGGATTAGCAGC
59
ATTGTGTATTACTGGCAGCG
59
GGTTGTAGTCAATCCTAGATTTGG
59
TAGGATTGACTACAACCACCC
59
GTACAGTTACTCGCACCAC
58
TCCTACTCTGGACTGTACCA
59
GCCGATGCTTTGTACATACTG
60
AAGTCTTAGTGAGACCATCCA
58
CTCACACTGCAAAGTCAGG
59
CTACTATGTTGGAACCTTGGG
58
CTGGAGTAAGTGATCACCAC
58
CTGTACAGTGAGCAGTGAC
58
TCTTTCCTTCGGATTAGCAG
57
AAAGTCTTAGTGAGACCATCCA
59
CACACTGCAAAGTCAGGTC
59
CCAAATCTAGGATTGACTACAACC
59
GCACTGGTACAGTCCAGAG
60
CTACTCTGGACTGTACCAGTG
59
GCCGATGCTTTGTACATACTG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CLMP基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLMP基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005881
Q9H6B4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q9H6B4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005923
Q9H6B4 (UniProtKB)
IDA
GO:0009986
Q9H6B4 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q9H6B4 (UniProtKB)
IEA
GO:0048565
Q9H6B4 (UniProtKB)
IMP
GO:0070062
Q9H6B4 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CLMP基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Intestinal Pseudo-Obstruction 0.240542884 2 4 BeFree_CLINVAR_UNIPROT
Lymphoma, Follicular 0.002367032 1 1 GAD
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.002367032 1 1 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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