CLMN (calmin)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CLMN
locus group:
protein-coding gene
location:
14q32.13
gene_family:
alias symbol:
FLJ12383|KIAA1188|KIAA0500
alias name:
None
entrez id:
79789
ensembl gene id:
ENSG00000165959
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uc001yef.3
refseq accession:
NM_024734
hgnc_id:
HGNC:19972
approved reserved:
2002-12-09

基因染色体位置

基因染色体位置

14q32.13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CLMN（Calmin）是一种编码钙调蛋白样蛋白的基因，属于钙调蛋白（Calmodulin）相关基因家族。该家族成员通常具有钙离子结合能力，参与调控细胞内的钙信号通路，影响细胞骨架动态、细胞迁移和神经发育等过程。CLMN基因表达的蛋白质含有多个EF-hand结构域，这是钙离子结合的特征性模体，使其能够响应细胞内钙离子浓度变化并参与信号转导。CLMN在神经系统、生殖系统和免疫系统中均有表达，尤其在神经元发育和突触可塑性中发挥重要作用。研究表明，CLMN通过与微管和肌动蛋白相互作用，调节细胞形态和运动，可能影响神经元的极性建立和轴突导向。若CLMN发生功能丧失性突变，可能导致神经元迁移障碍或突触功能异常，与某些神经发育疾病（如智力障碍或自闭症谱系障碍）的发病机制相关。相反，CLMN过表达可能破坏钙信号平衡，导致细胞骨架过度稳定化，抑制神经突起的生长和分支，影响神经网络的形成。在癌症中，CLMN的异常表达可能与肿瘤细胞侵袭性增强有关，因其调控细胞迁移能力。此外，CLMN与家族成员如Calmodulin（CALM）和Calmodulin-like（CALML）基因具有相似的钙结合特性，但各成员在组织分布和功能细节上存在差异。该基因家族共性包括：依赖钙离子信号、参与细胞运动与形态调控、影响酶活性（如激酶或磷酸酶）及膜运输过程。研究CLMN有助于理解钙依赖性细胞行为的分子机制，并为相关疾病提供潜在治疗靶点。

None

无

OMIM数据库中对CLMN基因的介绍     Wikipedia数据库中对CLMN基因的介绍

基因序列

基因序列

CLMN基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CLMN基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs717902       rs721403       rs874910       rs941567       rs941569       rs941570       rs945455       rs945456       rs945457       rs1054195       rs1054196       rs1124242       rs1128468       rs1187600       rs1187601       rs1187602       rs1187603      

基因表达

基因表达

CLMN基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CGAATATTAACCAGGAAGGCC
59
CTGTGTCAGGGAGTCACTC
59
CGAATATTAACCAGGTACAGTACTC
59
TCCCTCTTCATGTCTGCTC
59
CAGAACCTGCAAGTTGAGAG
59
CTTCTAGAGGTGGGTTGCA
59
CTATGAAAGCCAACAGCTCAG
59
ATACATCATATCCGGCTGCT
59
AAATAGCAGATGGCAACCCT
60
CTGTGAGCTCCTTAATCTGGA
59
AGCAGAAATAGCAGATGGCA
60
AGCTCCTTAATCTGGAAGAAGAG
60
GCTATGTTCAGTTGAGGAACG
59
TAAGCTTCTGAGTACTGTACCTG
60
CCGAATATTAACCAGGAAGGC
59
GTGTCAGGGAGTCACTCTG
59
GAACCTGCAAGTTGAGAGG
59
ACTTCTAGAGGTGGGTTGC
59
TCTATGAAAGCCAACAGCTC
58
TACATCATATCCGGCTGCT
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CLMN基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLMN基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
G3V5E0 (UniProtKB)
IEA
GO:0003779
Q96JQ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q96JQ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0008285
Q96JQ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q96JQ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0031175
Q96JQ2 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CLMN基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Alzheimer's Disease 0.12 1 1 GWASCAT
Inflammation 0.002367032 1 0 GAD
Central neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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