CLK4 (CDC like kinase 4)

symbol:
CLK4
locus group:
protein-coding gene
location:
5q35.3
gene_family:
CDC-like kinases
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
57396
ensembl gene id:
ENSG00000113240
ucsc gene id:
uc003mjf.2
refseq accession:
NM_020666
hgnc_id:
HGNC:13659
approved reserved:
2001-11-28
5q35.3
基因染色体位置图

CLK4(CDC-like kinase 4)是CDC2样激酶(CDC-like kinase,CLK)家族成员之一,该家族包括CLK1、CLK2、CLK3和CLK4四个成员,均属于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine/threonine kinase),主要参与调控RNA剪接(RNA splicing)过程。CLK家族激酶通过磷酸化(phosphorylation)SR蛋白(富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子)调控其活性,从而影响前体mRNA(pre-mRNA)的剪接效率,进而影响基因表达。CLK4在多种组织中表达,尤其在脑、心脏和骨骼肌中表达较高。CLK4的生物学功能主要与细胞增殖、分化和发育相关,其异常表达或突变可能导致剪接失调(splicing dysregulation),进而影响细胞功能。研究表明,CLK4在某些癌症(如乳腺癌、结直肠癌)中过表达,可能通过促进肿瘤细胞增殖和转移发挥作用。此外,CLK4还与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)相关,可能通过影响tau蛋白(一种与神经纤维缠结相关的蛋白)的剪接导致病理变化。CLK4基因突变可能影响其激酶活性,导致剪接调控异常,进而引发疾病。过表达CLK4可能增强SR蛋白的磷酸化,导致异常剪接事件增加,促进肿瘤发生或神经退行性病变;而降低CLK4表达可能影响正常剪接过程,导致细胞功能紊乱。CLK家族成员的共性是均具有激酶活性,参与RNA剪接调控,并在细胞周期、分化及疾病中发挥重要作用。目前针对CLK4的研究仍在深入,其具体机制及作为治疗靶点的潜力有待进一步探索。

The protein encoded by this gene belongs to the CDC2-like protein kinase (CLK) family. This protein kinase can interact with and phosphorylate the serine- and arginine-rich (SR) proteins, which are known to play an important role in the formation of spliceosomes, and thus may be involved in the regulation of alternative splicing. Studies in the Israeli sand rat Psammomys obesus suggested that the ubiquitin-like 5 (UBL5/BEACON), a highly conserved ubiquitin-like protein, may interact with and regulate the activity of this kinase. Multiple alternatively spliced transcript variants have been observed, but the full-length natures of which have not yet been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质属于CDC2样蛋白激酶(CLK)家族。这种蛋白激酶可以交互和磷酸化的丝氨酸和富含精氨酸的(SR)蛋白,其已知在剪接体的形成中发挥重要的作用,并且因此可能参与剪接的调节。在以色列沙鼠肥沙鼠属金枪鱼研究表明,该泛素样5(UBL5 /信标),一个高度保守的泛素样蛋白,可以与相互作用并调节该激酶的活性。多个可变剪接转录物变体已被观察到的,但其中的全长性质尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
CLK4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs501721       rs543862       rs555706       rs555794       rs560842       rs576097       rs584415       rs602451       rs649585       rs752043       rs775700       rs1472457       rs2335442       rs3065240       rs4077796       rs4557432       rs5873624      

CLK4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTTTCACAGTCTTTCAGACTC
59
TGTGTTGTGGTATGGGTCC
60
AGTGTCTTCCGATGTGTCC
59
CTAAGTCCCAGTAGTTCAAACAC
59
GAAGAGGAGATCTCATAGTAGCA
59
GCACATGGAGCACAATCAG
60
CATCAGTCACGTTCGAAGAG
59
TTTGACAGATCAGGTGACCC
60
AGTAAATCTTCAGTCCGCAG
58
CGATTTCATCGAACGTGAC
57
TGTGAAGTCTGACTATGTAGTC
57
GCTCTTTACTATCATGAGTCCA
58
AGGAGATCTCATAGTAGCACAC
59
GTCCCAATGGAACATCAATCAG
60
GAAGAGGAGATCTCATAGTAGCA
59
GCACATGGAGCACAATCAG
60
GCATTGTAAACCACATCACC
58
CTCATTCAAGGACCTTGCT
57
TAAGTGAAATGCGGCATTCC
59
TTCCACGATAGCTTTCATGTC
59
      尚未收录相关数据

CLK4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLK4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004674
A0A087WX74 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
A0A087WX74 (UniProtKB)
IEA
GO:0006468
A0A087WX74 (UniProtKB)
IEA
GO:0004674
B7ZL31 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
B7ZL31 (UniProtKB)
IEA
GO:0006468
B7ZL31 (UniProtKB)
IEA
GO:0004674
Q9HAZ1 (UniProtKB)
ISS
GO:0004712
Q9HAZ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0004713
Q9HAZ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9HAZ1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9HAZ1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9HAZ1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9HAZ1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q9HAZ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q9HAZ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0018108
Q9HAZ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0043484
Q9HAZ1 (UniProtKB)
IMP
GO:0046777
Q9HAZ1 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CLK4基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。