CLIC6 (chloride intracellular channel 6)

symbol:
CLIC6
locus group:
protein-coding gene
location:
21q22.12
gene_family:
Chloride intracellular channels
alias symbol:
CLIC5
alias name:
None
entrez id:
54102
ensembl gene id:
ENSG00000159212
ucsc gene id:
uc002yuf.2
refseq accession:
NM_001317009
hgnc_id:
HGNC:2065
approved reserved:
2000-05-23
21q22.12
基因染色体位置图

CLIC6(氯离子细胞内通道6)是CLIC基因家族的一员,该家族编码一类具有双重功能的蛋白质,既可作为可溶性蛋白存在,也可插入细胞膜形成离子通道。CLIC家族成员(如CLIC1、CLIC4等)的共同特点是参与调节细胞内氯离子浓度和细胞体积,并在膜运输、细胞凋亡和氧化应激反应中发挥作用。CLIC6主要在内质网和高尔基体中表达,其功能与细胞内氯离子稳态和细胞器酸化有关,可能影响蛋白质加工和分泌途径。研究表明,CLIC6在神经元和内分泌细胞中表达较高,暗示其可能参与神经递质释放或激素分泌调控。突变或表达异常可能导致细胞器功能障碍,例如影响溶酶体酸化和自噬过程,与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)和某些代谢紊乱有关。过表达CLIC6可能扰乱细胞内离子平衡,导致内质网应激或异常蛋白质聚集;而表达降低可能损害细胞器间的通信,影响分泌途径效率。CLIC6还与癌症相关,在某些肿瘤中表达上调,可能通过促进细胞增殖或抑制凋亡参与肿瘤进展。该基因的功能机制仍在研究中,但其在细胞内膜系统动态平衡中的作用使其成为潜在的治疗靶点。

This gene encodes a member of the chloride intracellular channel family of proteins. The gene is part of a large triplicated region found on chromosomes 1, 6, and 21. An alternatively spliced transcript variant has been described, but its biological validity has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的蛋白质的氯离子通道家族的一个成员。该基因是在6个染色体1,发现了大量的三重区的一部分,和21.一??种可变剪接转录变体进行了说明,但其生物有效性尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CLIC6基因的碱基序列:[NCBI]
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CLIC6基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs717578       rs717579       rs733014       rs762244       rs1009925       rs1013559       rs1055224       rs1075704       rs1557271       rs2014474       rs2070367       rs2070368       rs2154443       rs2154444       rs2154446       rs2154447       rs2186287      

CLIC6基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTAGAGGAGAAATTAGCTCCC
58
AGATTCGGGATGTTGGGTC
60
AAGAAATACCTGAGAGCTGGT
59
CCAGAGAATCATAAAGAGACGC
59
GATTGTGGCCAAGAAGTACAG
59
CAAGTATCTCCAGATGCCAG
57
GATTGTGGCCAAGAAGTACAG
59
AAGTATCTCCAGATGCCAGTC
59
AAAGAAATACCTGAGAGCTGG
58
CAGAGAATCATAAAGAGACGCT
58
TGACTGCAACCTCTTACCC
59
ATCTCTGTACTTCTTGGCCAC
60
GATTGTGGCCAAGAAGTACAG
59
AGTATCTCCAGATGCCAGTC
58
CTGACTGCAACCTCTTACC
58
TCTCTGTACTTCTTGGCCAC
60
TAAAGAAATACCTGAGAGCTGG
58
AGAGAATCATAAAGAGACGCTG
58
      尚未收录相关数据

CLIC6基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLIC6基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005244
Q96NY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005254
Q96NY7 (UniProtKB)
IBA
GO:0005737
Q96NY7 (UniProtKB)
IBA
GO:0005886
Q96NY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0034707
Q96NY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0034765
Q96NY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0050780
Q96NY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q96NY7 (UniProtKB)
IDA
GO:1902476
Q96NY7 (UniProtKB)
IBA
GO:0004364
Q96NY7 (UniProtKB)
IBA
GO:0005634
Q96NY7 (UniProtKB)
IBA
GO:0006749
Q96NY7 (UniProtKB)
IBA

可能调控 CLIC6基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Down Syndrome 0.12 1 0 CTD_human
Muscle Weakness 0.12 1 0 CTD_human
Idiopathic erosive/hemorrhagic gastritis 0.000271442 1 0 BeFree
Acute gastric mucosal erosion 0.000271442 1 0 BeFree

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