CLIC1 (chloride intracellular channel 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CLIC1
locus group:
protein-coding gene
location:
6p21.33
gene_family:
Chloride intracellular channels
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NCC27|p64CLCP|G6|CLCNL1
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None
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1192
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HGNC:2062
approved reserved:
1997-07-01

基因染色体位置

基因染色体位置

6p21.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CLIC1（氯离子细胞内通道1）属于CLIC基因家族，该家族成员编码的蛋白质具有独特的特性，能够在可溶性和膜结合形式之间转换，主要参与细胞内氯离子通道的调节。CLIC1在多种细胞类型中表达，包括神经元、上皮细胞和免疫细胞，其功能涉及细胞体积调节、pH平衡、膜电位维持以及细胞增殖和凋亡的调控。CLIC1的异常表达与多种疾病相关，例如在肿瘤中过表达可能促进癌细胞迁移和侵袭，与胶质瘤、乳腺癌和结肠癌的进展密切相关。此外，CLIC1在神经退行性疾病如阿尔茨海默病中也显示出异常表达模式，可能通过影响神经元兴奋性和突触功能参与疾病进程。CLIC1的突变可能导致其通道功能异常，进而影响细胞稳态，例如某些突变会增强通道活性，导致细胞过度凋亡或异常增殖。降低CLIC1表达可能抑制肿瘤生长但同时也可能影响正常细胞的离子平衡，而过度表达则可能加剧病理过程如炎症或癌症转移。CLIC基因家族的共性在于其成员均含有高度保守的谷胱甘肽S-转移酶（GST）样结构域，并表现出依赖氧化还原状态的通道活性调节。该家族蛋白在多种生理和病理过程中发挥关键作用，尤其在细胞应激响应和离子动态平衡中具有重要意义。研究CLIC1不仅有助于理解其在疾病中的作用机制，还可能为开发针对相关疾病的新型治疗策略提供分子靶点。

Chloride channels are a diverse group of proteins that regulate fundamental cellular processes including stabilization of cell membrane potential, transepithelial transport, maintenance of intracellular pH, and regulation of cell volume. Chloride intracellular channel 1 is a member of the p64 family; the protein localizes principally to the cell nucleus and exhibits both nuclear and plasma membrane chloride ion channel activity. [provided by RefSeq, Jul 2008]

氯离子通道是调节基本细胞过程，包括细胞的膜电位的稳定，跨膜运输，细胞内pH的维护和细胞体积的调控蛋白的一个多元化的群体。氯离子通道1是P64家族中的一员;该蛋白主要定位于细胞核，并表现出两个核和细胞膜的氯离子通道的活性。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CLIC1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CLIC1基因的介绍

基因序列

基因序列

CLIC1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CLIC1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3237       rs377749       rs378538       rs396369       rs400502       rs400547       rs805304       rs2272592       rs2293852       rs2736154       rs2736194       rs3101018       rs3131383       rs7451018       rs9267551       rs9267553       rs9281564      

基因表达

基因表达

CLIC1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
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59
AGTCCCTTCTCCAGATTGTC
59
CTGGGCTGGACATATTTGC
59
AGTCCCTTCTCCAGATTGTC
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59
AGTCCCTTCTCCAGATTGTC
59
CTGGGCTGGACATATTTGC
59
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59
AGTCCCTTCTCCAGATTGTC
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60
TACACATAGTACAGGTGGTGTG
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60
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60
TACACATAGTACAGGTGGTGTG
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TCAAGTACCGATGCACTCC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CLIC1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLIC1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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O00299 (UniProtKB)
IEA
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O00299 (UniProtKB)
IDA
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O00299 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O00299 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
O00299 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
O00299 (UniProtKB)
TAS
GO:0005634
O00299 (UniProtKB)
IDA
GO:0005635
O00299 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
O00299 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
O00299 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
O00299 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
O00299 (UniProtKB)
IEA
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O00299 (UniProtKB)
TAS
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IDA
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O00299 (UniProtKB)
TAS
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O00299 (UniProtKB)
IDA
GO:0031965
O00299 (UniProtKB)
IEA
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IDA
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IEA
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IDA
GO:0051726
O00299 (UniProtKB)
IEA
GO:0051881
O00299 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
O00299 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O00299 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O00299 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O00299 (UniProtKB)
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GO:0070062
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O00299 (UniProtKB)
IEA
GO:0004364
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IBA
GO:0006749
O00299 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CLIC1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neoplasm Metastasis 0.121085767 5 0 BeFree_CTD_human
Mammary Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Squamous cell carcinoma of esophagus 0.12 1 0 CTD_human
HIV Infections 0.12 1 0 CTD_human
Keloid 0.12 1 0 CTD_human
Degenerative polyarthritis 0.12 1 0 CTD_human
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.004734064 2 0 GAD
Colonic Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Spontaneous abortion 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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