CLECL1P (C-type lectin like 1, pseudogene)

symbol:
CLECL1P
locus group:
pseudogene
location:
12p13.31
gene_family:
alias symbol:
DCAL1
alias name:
dendritic cell associated lectin 1
entrez id:
160365
ensembl gene id:
ENSG00000184293
ucsc gene id:
uc001qwj.4
refseq accession:
NR_172485
hgnc_id:
HGNC:24462
approved reserved:
2007-06-21
12p13.31
基因染色体位置图

CLECL1P(C-Type Lectin Domain Family 1 Member P)是一个假基因,属于C型凝集素(C-type lectin)基因家族。C型凝集素家族是一类广泛存在于动物体内的蛋白质,其共同特点是含有保守的C型凝集素样结构域(CTLD),能够识别并结合特定的糖类结构,参与免疫调节、细胞黏附、病原体识别等多种生物学过程。CLECL1P位于人类染色体12q24.31区域,由于在进化过程中积累突变而失去功能,因此不编码功能性蛋白。假基因通常由功能基因复制或逆转录转座产生,可能保留部分序列相似性,但缺乏完整的开放阅读框或调控元件。尽管CLECL1P不表达功能性蛋白,但它可能通过调控附近基因的表达或作为非编码RNA发挥作用。目前关于CLECL1P的研究较少,其具体生物学意义尚不明确。由于它是假基因,突变或表达水平变化对机体的直接影响可能有限,但假基因有时会通过竞争性结合miRNA或转录因子间接影响其他基因的表达。C型凝集素家族成员在免疫系统中尤为重要,例如CLEC7A(Dectin-1)参与真菌识别,CLEC4C(BDCA-2)在浆细胞样树突状细胞中发挥作用。CLECL1P的存在可能反映了该基因家族在进化过程中的动态变化,为研究基因家族演化和功能丧失提供了线索。

This gene encodes a type II transmembrane, C-type lectin-like protein that is highly expressed on dendritic and B cells. This protein may act as a T-cell costimulatory molecule that enhances interleukin-4 production, and maybe involved in the regulation of the immune response. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2011]

这个基因编码II型跨膜,即对树突状细胞和B细胞中高表达的C型凝集素样蛋白质。这种蛋白质可以充当增强白细胞介素-4的生产,并可能参与免疫应答的调节的T细胞共刺激分子。已发现该基因编码不同亚型选择性剪接转录变异体。 [由RefSeq的,2011年12月提供]

CLECL1P基因的碱基序列:[NCBI]
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CLECL1P基因的碱基突变:           仅显示部分snp

CLECL1P基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

CLECL1P基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLECL1P基因的本体(GO)信息:

可能调控 CLECL1P基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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