CLEC4E (C-type lectin domain family 4 member E)

symbol:
CLEC4E
locus group:
protein-coding gene
location:
12p13.31
gene_family:
C-type lectin domain family
alias symbol:
MINCLE
alias name:
Macrophage-inducible C-type lectin
entrez id:
26253
ensembl gene id:
ENSG00000166523
ucsc gene id:
uc001quo.2
refseq accession:
NM_014358
hgnc_id:
HGNC:14555
approved reserved:
2001-02-01
12p13.31
基因染色体位置图

CLEC4E(C-type lectin domain family 4 member E),也称为巨噬细胞诱导的C型凝集素(Macrophage-inducible C-type lectin, MINCLE),是一种由CLEC4E基因编码的C型凝集素受体(C-type lectin receptor, CLR),属于C型凝集素家族(C-type lectin family)。该家族成员通常含有保守的碳水化合物识别结构域(carbohydrate recognition domain, CRD),能够识别并结合特定的糖类分子,参与免疫识别、病原体防御和炎症反应等过程。CLEC4E主要在巨噬细胞、树突细胞和中性粒细胞等免疫细胞中表达,其功能是通过识别病原体相关分子模式(pathogen-associated molecular patterns, PAMPs)或损伤相关分子模式(damage-associated molecular patterns, DAMPs)来激活免疫应答。CLEC4E的配体包括真菌细胞壁成分(如α-甘露聚糖)和坏死细胞释放的 SAP130(spliceosome-associated protein 130)等。当CLEC4E与配体结合后,会通过其胞内段的免疫受体酪氨酸激活基序(immunoreceptor tyrosine-based activation motif, ITAM)或与适配蛋白(如FcRγ)结合,激活下游信号通路(如Syk激酶和NF-κB通路),促进促炎细胞因子(如TNF-α、IL-6和IL-1β)的释放,从而增强机体对感染或组织损伤的防御能力。CLEC4E的突变可能导致其功能异常,例如配体结合能力下降或信号传导障碍,进而影响免疫应答的强度或特异性。研究表明,CLEC4E的功能异常与多种疾病相关,如真菌感染易感性增加、自身免疫性疾病(如类风湿性关节炎)和慢性炎症性疾病(如动脉粥样硬化)。此外,CLEC4E在肿瘤微环境中也可能通过调节巨噬细胞的极化(即M1型促炎或M2型抗炎表型)影响肿瘤进展。当CLEC4E过表达时,可能过度激活免疫反应,导致炎症性疾病或自身免疫反应的加剧;而降低表达则可能削弱对病原体的识别能力,增加感染风险。CLEC4E属于CLEC4基因家族,该家族成员(如CLEC4D、CLEC4F等)均具有类似的C型凝集素结构域,并在先天免疫中发挥模式识别受体(pattern recognition receptor, PRR)的作用,但各自识别的配体和生物学功能可能存在差异。

This gene encodes a member of the C-type lectin/C-type lectin-like domain (CTL/CTLD) superfamily. Members of this family share a common protein fold and have diverse functions, such as cell adhesion, cell-cell signalling, glycoprotein turnover, and roles in inflammation and immune response. The encoded type II transmembrane protein is a downstream target of CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta (CEBPB) and may play a role in inflammation. Alternative splice variants have been described but their full-length sequence has not been determined. This gene is closely linked to other CTL/CTLD superfamily members on chromosome 12p13 in the natural killer gene complex region. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码超家族的C-型凝集素/ C-型凝集素样结构域(CTL / CTLD)的成员。这家人共享一个共同的蛋白折叠,并有不同的功能,例如细胞粘附,细胞 - 细胞信号传导,糖蛋白周转和角色在炎症和免疫反应的成员。所编码的II型跨膜蛋白是CCAAT /增强子结合蛋白(C / EBP),β(CEBPB)的下游靶标和在炎症中起一定作用。备选剪接变体已被描述,但是它们的全长序列尚未确定。该基因在天然杀伤基因复杂区域紧扣其他的CTL / CTLD超家族成员12p13染色体。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CLEC4E基因的碱基序列:[NCBI]
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CLEC4E基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4242896       rs4551822       rs4562874       rs4620776       rs4883166       rs4883167       rs4883168       rs5014225       rs6487242       rs7132177       rs7139227       rs7306903       rs7307228       rs10605488       rs10770845       rs10841845       rs10841846      

CLEC4E基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTACAATTATGGATCAGGTTCAGTC
59
CTTAACGCCCAGGAAATGG
58
TCACCAGATGTGTTGTGAC
57
GCTCTGTGAAATTCTCAGGT
57
TCTTATGGACTGTTGCTGGG
59
AGATGCGAAATGTCACAACAC
59
GCTACAATTATGGATCAGGTTCAG
59
TTAACGCCCAGGAAATGGT
59
TTCTTATGGACTGTTGCTGG
57
GATGCGAAATGTCACAACAC
58
CTACAATTATGGATCAGGTTCAGTC
59
TTAACGCCCAGGAAATGGT
59
      尚未收录相关数据

CLEC4E基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLEC4E基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
F5H5X7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8WFA1 (UniProtKB)
IEA
GO:0002223
Q9ULY5 (UniProtKB)
TAS
GO:0002292
Q9ULY5 (UniProtKB)
IEA
GO:0004872
Q9ULY5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9ULY5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9ULY5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9ULY5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9ULY5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9ULY5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9ULY5 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q9ULY5 (UniProtKB)
IEA
GO:0030246
Q9ULY5 (UniProtKB)
IEA
GO:0038094
Q9ULY5 (UniProtKB)
IEA
GO:0042742
Q9ULY5 (UniProtKB)
IEA
GO:0045087
Q9ULY5 (UniProtKB)
IEA
GO:0050715
Q9ULY5 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CLEC4E基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Lung diseases 0.12 1 0 CTD_human
Lupus Nephritis 0.000271442 1 0 BeFree
Obesity 0.000271442 1 0 BeFree
Tuberculosis 0.000271442 1 0 BeFree

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