CLEC4A (C-type lectin domain family 4 member A)

symbol:
CLEC4A
locus group:
protein-coding gene
location:
12p13.31
gene_family:
C-type lectin domain family
alias symbol:
DCIR|DDB27|CD367|hDCIR
alias name:
None
entrez id:
50856
ensembl gene id:
ENSG00000111729
ucsc gene id:
uc001qtz.1
refseq accession:
NM_194450
hgnc_id:
HGNC:13257
approved reserved:
2001-02-01
12p13.31
基因染色体位置图

CLEC4A(C型凝集素结构域家族4成员A,C-type lectin domain family 4 member A)是一种编码C型凝集素受体的基因,属于CLEC(C-type lectin)基因家族。该家族的特点是含有保守的C型凝集素样结构域(CTLD),能够识别并结合糖类分子(如甘露糖、岩藻糖等),参与免疫识别、病原体防御和细胞间信号传递。CLEC4A主要在树突状细胞(DCs)和巨噬细胞等免疫细胞表面表达,其编码的蛋白作为模式识别受体(PRR),可识别病原体表面的糖结构,触发免疫应答或免疫耐受信号。该基因的突变可能导致免疫功能异常,如识别病原体能力下降或自身免疫反应失调。研究发现,CLEC4A在某些病毒感染(如HIV)中可能作为病毒进入细胞的辅助受体,而其表达水平变化与自身免疫性疾病(如系统性红斑狼疮)或过敏性疾病相关。若CLEC4A过表达,可能增强免疫抑制功能,导致抗病原体反应减弱;而低表达可能引发过度炎症反应。CLEC基因家族的共性包括:通过CTLD结构域介导糖结合活性,参与先天免疫调控,部分成员(如CLEC7A/Dectin-1)还能激活下游信号通路(如Syk激酶通路)。目前针对CLEC4A的研究仍在深入,其精确机制及临床关联需进一步验证。

This gene encodes a member of the C-type lectin/C-type lectin-like domain (CTL/CTLD) superfamily. Members of this family share a common protein fold and have diverse functions, such as cell adhesion, cell-cell signalling, glycoprotein turnover, and roles in inflammation and immune response. The encoded type 2 transmembrane protein may play a role in inflammatory and immune response. Multiple transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. This gene is closely linked to other CTL/CTLD superfamily members on chromosome 12p13 in the natural killer gene complex region. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基??因编码超家族的C-型凝集素/ C-型凝集素样结构域(CTL / CTLD)的成员。这家人共享一个共同的蛋白折叠,并有不同的功能,例如细胞粘附,细胞 - 细胞信号传导,糖蛋白周转和角色在炎症和免疫反应的成员。所编码的2型跨膜蛋白可能在炎症和免疫反应的作用。编码不同亚型的多个变种成绩单已经确定了这个基因。该基因在天然杀伤基因复杂区域紧扣其他的CTL / CTLD超家族成员12p13染色体。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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CLEC4A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1133103       rs1133104       rs1990476       rs2015596       rs2024301       rs2377422       rs2889630       rs4264221       rs4322489       rs4322490       rs4424738       rs4573763       rs4882913       rs4883072       rs4883073       rs5000742       rs5796306      

CLEC4A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATATGCCCGTGGAAGAGAC
59
ACTGTCTTGCCAAGATGCT
60
TCCTCAGGCATCAACACAG
60
CAGATTCTGGAAGATGAAATCTGAC
60
TGGCAAGACAGTGAGAAGG
60
GATGAAATCCTGCTCTTCTTGAG
60
CTTCCAAGGAGAGGACTGC
59
CAGATTCTGGAAGATGAAATCTGAC
60
ATATGCCCGTGGAAGAGAC
59
ACTGTCTTGCCAAGATGCT
60
AAAGTTCCACATTCTGGCA
57
GACAATTAACATCATTCCAGCC
58
TTGTCAAGACAGCCTGGAG
60
CTGGAAGATGAAATCCTGCTC
59
TTTGTCAAGACAGCCTGGA
59
GATGAAATCCTGCTCTTCTTGAG
60
ATATGCCCGTGGAAGAGAC
59
CTGTCTTGCCAAGATGCTG
59
CAGCTTCCAAGGAGAGGAC
59
CAGATTCTGGAAGATGAAATCTGAC
60
      尚未收录相关数据

CLEC4A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLEC4A基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
H0YGF9 (UniProtKB)
IEA
GO:0002223
Q9UMR7 (UniProtKB)
TAS
GO:0002250
Q9UMR7 (UniProtKB)
IEA
GO:0004888
Q9UMR7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9UMR7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q9UMR7 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
Q9UMR7 (UniProtKB)
TAS
GO:0007166
Q9UMR7 (UniProtKB)
TAS
GO:0030246
Q9UMR7 (UniProtKB)
IEA
GO:0045087
Q9UMR7 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CLEC4A基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hypersensitivity 0.12 1 0 CTD_human
Rheumatoid Arthritis 0.00408156 5 3 BeFree_LHGDN
Autoimmune Diseases 0.000814326 3 0 BeFree
HIV Infections 0.000542884 2 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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