CLEC2D (C-type lectin domain family 2 member D)

symbol:
CLEC2D
locus group:
protein-coding gene
location:
12p13.31
gene_family:
C-type lectin domain family
alias symbol:
LLT1|CLAX|OCIL
alias name:
C-type lectin related f|lectin-lik…
entrez id:
29121
ensembl gene id:
ENSG00000069493
ucsc gene id:
uc001qwg.4
refseq accession:
NM_013269
hgnc_id:
HGNC:14351
approved reserved:
2005-02-09
12p13.31
基因染色体位置图

CLEC2D(C-type lectin domain family 2 member D)属于C型凝集素家族(C-type lectin family),这是一类能够识别并结合糖类分子的蛋白质,通常参与免疫调节、细胞间识别和病原体防御等过程。CLEC2D基因编码的蛋白质是一种跨膜受体,主要在免疫细胞(如自然杀伤细胞NK细胞、树突状细胞和T细胞)表面表达,其功能涉及免疫应答的调控。CLEC2D通过与其配体(如LLT1,即lectin-like transcript 1)结合,可以抑制NK细胞的杀伤活性,从而在免疫耐受和自身免疫疾病中发挥作用。CLEC2D的突变可能导致免疫系统功能异常,例如过度激活或抑制,进而与某些自身免疫性疾病或感染性疾病相关。如果CLEC2D过表达,可能会过度抑制NK细胞的活性,导致机体对病毒感染或肿瘤细胞的清除能力下降;而降低表达则可能使免疫系统过度激活,增加自身免疫疾病的风险。C型凝集素家族的共性包括具有保守的糖识别结构域(carbohydrate recognition domain, CRD),能够特异性结合糖类分子,并参与细胞粘附、信号传导和病原体识别等生物学过程。CLEC2D作为该家族成员,其功能与其他C型凝集素类似,但在具体配体和调控机制上可能存在差异。目前研究表明,CLEC2D可能与类风湿性关节炎、炎症性肠病等自身免疫性疾病有关,但其具体机制仍需进一步研究。

This gene encodes a member of the natural killer cell receptor C-type lectin family. The encoded protein inhibits osteoclast formation and contains a transmembrane domain near the N-terminus as well as the C-type lectin-like extracellular domain. Several alternatively spliced transcript variants have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2010]

该基因编码的自然杀伤细胞受体C型凝集素家族的一员。所编码的蛋白质抑制破骨细胞形成,并包含N-末端附近的一个跨膜结构域以及C型凝集素样细胞外结构域。几个可变剪接转录物变体已被确定为这个基因。 [由RefSeq的,2010年10月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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CLEC2D基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2894       rs969367       rs1044771       rs1056151       rs1059858       rs1118223       rs1131767       rs1134543       rs1560011       rs2080210       rs2080211       rs2114870       rs2114871       rs2114872       rs2114873       rs2217230       rs2401387      

CLEC2D基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCTTTAAGCGCAATAAGAGCT
60
AAACCAATCCAGCTTTCTGG
59
ATCACTGGATTGGGCTGAG
60
CAGGATAGGAAACTGTCTTGTC
59
GCTTTAAGCGCAATAAGAGCT
60
AAACCAATCCAGCTTTCTGG
59
TCTGAATTGCCTGCAAACC
59
TGCAGACAACAATAATGGTGG
59
ATCACTGGATTGGGCTGAG
60
CAGGATAGGAAACTGTCTTGTC
59
TGGACATCAAGTCAGAGGT
58
GATAGGAAACCAGTTCCTGG
58
ATCACTGGATTGGGCTGAG
60
AGACCCTGTCTTGTCTTGTC
59
CTGGACATCAAGTCAGAGG
57
ATAGGAAACCAGTTCCTGGA
58
TGGACATCAAGTCAGAGGT
58
GATAGGAAACCAGTTCCTGG
58
GCTTTAAGCGCAATAAGAGCT
60
AAACCAATCCAGCTTTCTGG
59
      尚未收录相关数据

CLEC2D基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLEC2D基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A0A0C4DG81 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A0C4DGG4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8WF99 (UniProtKB)
IEA
GO:0004888
Q9UHP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005783
Q9UHP7 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q9UHP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q9UHP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0007166
Q9UHP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0009986
Q9UHP7 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
Q9UHP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0030246
Q9UHP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0050776
Q9UHP7 (UniProtKB)
TAS

可能调控 CLEC2D基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.122367032 1 1 GAD_GWASCAT
Addison Disease 0.002367032 1 0 GAD
Osteoporosis, Postmenopausal 0.002367032 1 0 GAD
Viral respiratory infection 0.000271442 1 0 BeFree
Respiratory syncytial virus (RSV) infection in conditions classified elsewhere and of unspecified site 0.000271442 1 0 BeFree
Glioma 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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