CLEC2B (C-type lectin domain family 2 member B)

symbol:
CLEC2B
locus group:
protein-coding gene
location:
12p13.31
gene_family:
C-type lectin domain family
alias symbol:
AICL|HP10085
alias name:
None
entrez id:
9976
ensembl gene id:
ENSG00000110852
ucsc gene id:
uc001qwn.4
refseq accession:
NM_005127
hgnc_id:
HGNC:2053
approved reserved:
1999-05-07
12p13.31
基因染色体位置图

CLEC2B(C-type lectin domain family 2 member B)属于C型凝集素家族(CLEC家族),这是一类广泛存在于免疫系统中的蛋白质,能够识别并结合糖类结构,参与免疫识别、炎症反应和细胞间相互作用。CLEC2B主要表达于免疫细胞如树突状细胞和自然杀伤(NK)细胞表面,其编码的蛋白质是一种II型跨膜受体,通过识别特定糖基化模式参与病原体识别和免疫调控。CLEC2B的功能特点包括与病原体表面的糖类结构结合,触发免疫细胞的激活或抑制信号,从而调节免疫应答。该基因在病毒感染(如HIV)和肿瘤免疫逃逸中可能发挥作用,因为它能影响NK细胞的杀伤活性。CLEC2B的突变可能导致免疫功能异常,例如某些突变可能削弱其配体结合能力,从而降低抗病毒或抗肿瘤免疫反应。研究发现,CLEC2B的过表达可能增强免疫细胞对病原体的清除能力,但也可能引发过度炎症反应;而表达降低则可能导致免疫监视功能减弱,增加感染或癌症风险。在基因家族层面,C型凝集素家族的成员均含有保守的钙离子依赖性糖识别结构域(CRD),能够识别病原体或自身细胞表面的糖链,参与先天免疫和适应性免疫的交叉调控。CLEC2B与家族其他成员(如CLEC2D)功能相似,但配体偏好和下游信号可能存在差异。目前,CLEC2B与某些自身免疫性疾病和癌症的关联仍在研究中,例如其表达水平变化可能与慢性炎症或肿瘤微环境调控相关。

This gene encodes a member of the C-type lectin/C-type lectin-like domain (CTL/CTLD) superfamily. Members of this family share a common protein fold and have diverse functions, such as cell adhesion, cell-cell signalling, glycoprotein turnover, and roles in inflammation and immune response. The encoded type 2 transmembrane protein may function as a cell activation antigen. An alternative splice variant has been described but its full-length sequence has not been determined. This gene is closely linked to other CTL/CTLD superfamily members on chromosome 12p13 in the natural killer gene complex region. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因编码C-型凝集素/ C-型凝集素样超家族结构域(CTL / CTLD)的成员。这家人共享一个共同的蛋白折叠,并有不同的功能,例如细胞粘附,细胞 - 细胞信号传导,糖蛋白周转和角色在炎症和免疫反应的成员。所编码的2型跨膜蛋白可以起细胞激活抗原的功能。备选剪接变体已被描述,但其全长序列尚未确定。该基因在天然杀伤基因复杂区域紧扣其他的CTL / CTLD超家族成员12p13染色体。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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CLEC2B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs14999       rs33869       rs33870       rs33871       rs33872       rs33873       rs253146       rs253147       rs253148       rs253149       rs253150       rs253151       rs253152       rs253153       rs253154       rs253155       rs253156      

CLEC2B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAGTTTCTGCAAGACATGAC
59
TTTGGTCATCATACCGTGC
58
TACCAAATCGTTTGGCATGAG
59
GTGTAACATCTAGCTGTTGCT
59
AGTTTCTGCAAGACATGACAC
59
TCTCGAGTTAGTTTAACGTGCT
60
ACCAAATCGTTTGGCATGAG
60
GGTGTAACATCTAGCTGTTGC
59
GAGAGTTTCTGCAAGACATGAC
60
TTGGTCATCATACCGTGCT
59
AGTTTCTGCAAGACATGACAC
59
TCTCGAGTTAGTTTAACGTGC
59
GTTTCTGCAAGACATGACAC
58
ATGTTTGGTCATCATACCGT
57
GAGTTTCTGCAAGACATGAC
57
CTCGAGTTAGTTTAACGTGC
57
TACCAAATCGTTTGGCATGAG
59
GTGTAACATCTAGCTGTTGCTG
60
      尚未收录相关数据

CLEC2B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLEC2B基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005886
Q92478 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q92478 (UniProtKB)
TAS
GO:0030246
Q92478 (UniProtKB)
IEA
GO:0050776
Q92478 (UniProtKB)
TAS

可能调控 CLEC2B基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of liver 0.000271442 1 0 BeFree

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电话: 0531-88819269

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