CLEC11A (C-type lectin domain containing 11A)

symbol:
CLEC11A
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.33
gene_family:
C-type lectin domain family
alias symbol:
P47|LSLCL|CLECSF3
alias name:
None
entrez id:
6320
ensembl gene id:
ENSG00000105472
ucsc gene id:
uc002psy.4
refseq accession:
NM_002975
hgnc_id:
HGNC:10576
approved reserved:
1997-10-30
19q13.33
基因染色体位置图

CLEC11A(C型凝集素结构域家族11成员A,原英文C-type lectin domain family 11 member A)是一种编码C型凝集素(一种能结合糖类分子的蛋白质)的基因,属于C型凝集素基因家族。该家族的特点是成员均含有保守的C型凝集素结构域(CTLD),能够识别并结合特定的糖类结构,参与免疫调节、细胞间通讯和病原体防御等过程。CLEC11A主要在骨髓、肝脏和胎盘中表达,其编码的蛋白质是一种分泌型糖蛋白,具有促进造血干细胞增殖和分化的功能,尤其在骨髓造血微环境中起关键作用。该基因的突变可能导致造血功能障碍,例如骨髓衰竭或贫血,并与某些血液系统疾病如骨髓增生异常综合征(MDS)相关。CLEC11A的过表达可能促进造血干细胞的过度增殖,增加白血病等血液肿瘤的风险;而表达降低则可能导致造血功能不足,引发血细胞减少症。此外,CLEC11A还参与骨代谢调控,其异常表达可能与骨质疏松等骨骼疾病有关。C型凝集素基因家族的共性包括通过识别糖链参与免疫应答、炎症反应和细胞黏附等生物学过程。CLEC11A作为该家族成员,其功能与其他C型凝集素类似,但具有更特异的造血调控作用。研究还发现CLEC11A在肿瘤微环境中可能通过调节免疫细胞功能影响肿瘤进展,但其具体机制仍需进一步探索。

This gene encodes a member of the C-type lectin superfamily. The encoded protein is a secreted sulfated glycoprotein and functions as a growth factor for primitive hematopoietic progenitor cells. An alternative splice variant has been described but its biological nature has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因编码C-型凝集素超家族的成员。所编码的蛋白质是一种分泌硫酸化糖蛋白,作为用于原始造血祖细胞的生长因子。备选剪接变体已被描述,但其生物性质尚未确定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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CLEC11A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs13866       rs890863       rs1053020       rs1053022       rs2303688       rs7246075       rs7246355       rs7246389       rs11084024       rs11666008       rs11882862       rs17426175       rs71355166       rs73582909       rs73582910       rs76596672       rs76837811      

CLEC11A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGATGCTGAAGCATCTGC
59
AAGTGACGATGTCCTCAGG
59
CTGATGCTGAAGCATCTGC
59
AAGTGACGATGTCCTCAGG
59
CTGATGCTGAAGCATCTGC
59
AAGTGACGATGTCCTCAGG
59
GATGCTGAAGCATCTGCAG
59
TAAGTGACGATGTCCTCAGG
59
GATGCTGAAGCATCTGCAG
59
TAAGTGACGATGTCCTCAGG
59
GATGCTGAAGCATCTGCAG
59
TAAGTGACGATGTCCTCAGG
59
GATGCTGAAGCATCTGCAG
59
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59
GATGCTGAAGCATCTGCAG
59
AAGTGACGATGTCCTCAGG
59
GATGCTGAAGCATCTGCAG
59
AAGTGACGATGTCCTCAGG
59
      尚未收录相关数据

CLEC11A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLEC11A基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
Q9Y240 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
Q9Y240 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9Y240 (UniProtKB)
IEA
GO:0008083
Q9Y240 (UniProtKB)
IDA
GO:0008284
Q9Y240 (UniProtKB)
IDA
GO:0030246
Q9Y240 (UniProtKB)
NAS
GO:0030246
V9H0X6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CLEC11A基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Vitiligo 0.005005506 2 2 BeFree_GAD
Piebaldism 0.001357209 5 0 BeFree
Anemia 0.000542884 2 0 BeFree
Seminoma 0.000271442 1 0 BeFree
VITILIGO-ASSOCIATED MULTIPLE AUTOIMMUNE DISEASE SUSCEPTIBILITY 1 (finding) 0.000271442 1 2 BeFree
Gastrointestinal Stromal Tumors 0.000271442 1 0 BeFree
Menstrual spotting 0.000271442 1 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Asthma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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