CLEC10A (C-type lectin domain containing 10A)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CLEC10A
locus group:
protein-coding gene
location:
17p13.1
gene_family:
CD molecules|C-type lectin domain family
alias symbol:
HML2|HML|CD301
alias name:
macrophage lectin 2 (calcium depen…
entrez id:
10462
ensembl gene id:
ENSG00000132514
ucsc gene id:
uc002gej.4
refseq accession:
NM_006344
hgnc_id:
HGNC:16916
approved reserved:
2003-08-06

基因染色体位置

基因染色体位置

17p13.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CLEC10A（C型凝集素结构域家族10成员A，C-type lectin domain family 10 member A）是一种属于C型凝集素受体家族的基因，该家族以依赖钙离子的糖类结合能力为特征，主要参与免疫识别和病原体防御。CLEC10A编码的蛋白也称为CD301或巨噬细胞半乳糖型C型凝集素（MGL），是一种跨膜受体，特异性识别末端含有半乳糖或N-乙酰半乳糖胺（Gal/GalNAc）的糖链结构，常见于病原体表面或肿瘤相关糖抗原。其生物学功能包括调控免疫耐受、促进抗原提呈细胞（如树突状细胞和巨噬细胞）的成熟与迁移，并通过与配体结合触发免疫抑制或激活信号。主要作用位点为免疫细胞表面，尤其在肿瘤微环境和感染部位高表达。CLEC10A突变可能导致糖识别能力丧失，影响免疫平衡，与自身免疫病（如类风湿关节炎）或肿瘤免疫逃逸相关。研究发现，CLEC10A在多种癌症（如结直肠癌、黑色素瘤）中表达异常，其高表达可能通过抑制T细胞活性促进肿瘤进展，而低表达可能削弱对病原体的清除能力。该基因属于CLEC（C-type lectin）家族，家族成员均含保守的C型凝集素结构域，功能涉及病原体识别、细胞黏附和免疫调节。过表达CLEC10A可能增强免疫抑制微环境，降低抗肿瘤反应；而敲低表达可能引发过度炎症反应或感染易感性。目前针对CLEC10A的肿瘤免疫治疗研究正在探索中。

This gene encodes a member of the C-type lectin/C-type lectin-like domain (CTL/CTLD) superfamily. Members of this family share a common protein fold and have diverse functions, such as cell adhesion, cell-cell signalling, glycoprotein turnover, and roles in inflammation and immune response. The encoded type 2 transmembrane protein may function as a cell surface antigen. Two transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码超家族的C-型凝集素/ C-型凝集素样结构域（CTL / CTLD）的成员。这家人共享一个共同的蛋白折叠，并有不同的功能，例如细胞粘附，细胞 - 细胞信号传导，糖蛋白周转和角色在炎症和免疫反应的成员。所编码的2型跨膜蛋白可以作为细胞表面抗原的作用。编码不同的两种亚型变种成绩单已经确定了这个基因。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CLEC10A基因的介绍     Wikipedia数据库中对CLEC10A基因的介绍

基因序列

基因序列

CLEC10A基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CLEC10A基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs15623       rs90951       rs188775       rs314228       rs314229       rs314230       rs364569       rs378149       rs379136       rs389947       rs410310       rs415704       rs431391       rs431869       rs444207       rs448797       rs732828      

基因表达

基因表达

CLEC10A基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACAACAATGCCTCCACTG
59
CAGTACTTCTCAGCCTCGG
60
GCTTGGAAGAAACGATAGCA
59
GCATTTCAGAATGAACTGCCT
60
GAATCACACCCTCCAGACC
60
TTGTCACAGCTGAAATGGAG
59
CTCTCACTCTGGGATGTCC
59
CTTCCAGTTCCTGCTCCTC
60
GCTTGGAAGAAACGATAGCA
59
GCATTTCAGAATGAACTGCCT
60
ACAATGGTGAGGAAGCCTC
60
GGACATCCCAGAGTGAGAG
59
GCTTGGAAGAAACGATAGCA
59
GCATTTCAGAATGAACTGCC
58
TCTCACTCTGGGATGTCCT
59
CTTCCAGTTCCTGCTCCTC
60
GCTTGGAAGAAACGATAGCA
59
GCATTTCAGAATGAACTGCC
58
AACAACAATGCCTCCACTG
59
CAGGACATCCCAGAGTGAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CLEC10A基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CLEC10A基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
J3KR22 (UniProtKB)
IEA
GO:0002250
Q8IUN9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q8IUN9 (UniProtKB)
TAS
GO:0006897
Q8IUN9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q8IUN9 (UniProtKB)
IEA
GO:0030246
Q8IUN9 (UniProtKB)
IEA
GO:0045087
Q8IUN9 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CLEC10A基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Myocardial Ischemia 0.12 1 0 CTD_human
HIV Infections 0.002714419 10 0 BeFree
Polyradiculoneuropathy, Chronic Inflammatory Demyelinating 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of breast 0.001085767 4 0 BeFree
Germ cell tumor 0.000814326 3 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Schizophrenia 0.000542884 2 0 BeFree
Lymphoma 0.000542884 2 0 BeFree
Bipolar Disorder 0.000542884 2 0 BeFree
melanoma 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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