CKLF (chemokine like factor)

symbol:
CKLF
locus group:
protein-coding gene
location:
16q21
gene_family:
alias symbol:
UCK-1|CKLF3|CKLF4|HSPC224|C32
alias name:
None
entrez id:
51192
ensembl gene id:
ENSG00000217555
ucsc gene id:
uc002eow.4
refseq accession:
NM_016326
hgnc_id:
HGNC:13253
approved reserved:
2001-08-23
16q21
基因染色体位置图

CKLF(趋化素样因子,Chemokine-like factor)属于CC类趋化因子家族(CC chemokine family),该家族成员通常具有趋化免疫细胞、调控炎症反应的功能。CKLF基因编码的蛋白质是一种分泌型细胞因子,能通过结合细胞表面受体(如CCR4等G蛋白偶联受体)激活下游信号通路,参与白细胞迁移、血管生成和组织修复等过程。其表达产物具有典型的趋化因子结构特征,包含保守的半胱氨酸残基(C-C motif)。CKLF在骨髓、肺、胎盘等组织中高表达,尤其在炎症或损伤状态下表达显著上调。该基因的突变可能导致其趋化功能异常,与哮喘、慢性阻塞性肺病(COPD)等呼吸道炎症性疾病相关,也可能影响肿瘤微环境中免疫细胞的浸润(如促进髓系抑制细胞聚集)。当CKLF过表达时,会增强炎症反应并促进纤维化进程,例如加重肺纤维化或肝纤维化;而敲低其表达可减轻组织损伤后的过度修复反应。CKLF家族还包括CKLFSF(CKLF superfamily)成员如CMTM1-8,这些基因均含有MARVEL结构域(与膜关联和免疫调节相关),共同参与免疫调控和细胞黏附。研究表明CKLF与VEGF(血管内皮生长因子)等基因存在交叉调控,过表达时会协同促进血管新生,可能加速肿瘤转移。在疾病治疗中,靶向抑制CKLF信号通路(例如使用抗体阻断受体结合)显示出缓解纤维化和抑制肿瘤生长的潜力。

The product of this gene is a cytokine. Cytokines are small proteins that have an essential role in the immune and inflammatory responses. This gene is one of several chemokine-like factor genes located in a cluster on chromosome 16. The protein encoded by this gene is a potent chemoattractant for neutrophils, monocytes and lymphocytes. It also can stimulate the proliferation of skeletal muscle cells. This protein may play important roles in inflammation and in the regeneration of skeletal muscle. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. Naturally occurring read-through transcription occurs between this locus and the neighboring locus CMTM1 (CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 1).[provided by RefSeq, Feb 2011]

该基因的产物是细胞因子。细胞因子是在免疫和炎症反应中起重要作用的小蛋白。这种基因是位于群集上染色体16由该基因编码的蛋白质的几个趋化因子样因子基因一个是嗜中性粒细胞,单核细胞和淋巴细胞的有力趋化。它还可以刺激骨骼肌细胞的增殖。这种蛋白可能在炎症和骨骼肌的再生中起重要作用。编码不同同种型的可变剪接转录物变体也已确定。该位点和邻近的轨迹CMTM1(含1 CKLF样MARVEL跨膜结构域)之间发生的自然发生通读转录[由RefSeq的,2011年2月提供]

CKLF基因的碱基序列:[NCBI]
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CKLF基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs14835       rs37178       rs725131       rs1108281       rs1137621       rs2002907       rs2232722       rs2232724       rs2232725       rs2232726       rs2232727       rs2232728       rs2232729       rs3785086       rs3785087       rs3785088       rs6499092      

CKLF基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTGTTGGCACTGATACCA
59
TGTCACAAGTGCAAACACC
59
AGAGTTGAGGGAAAGTGCT
59
GATGTCACAGTTAGTGCCAG
59
GAGTTGAGGGAAAGTGCTG
59
AGACTACCAAGCAATGCAG
58
ACCAGAAACCACAACATTGAC
59
GCATACTGCTGTCACAAGTG
60
AGAGTTGAGGGAAAGTGCT
59
GATGTCACAGTTAGTGCCAG
59
CTTCTGCTTCAGTGTGAAAGG
60
CCAGTGAGTTGATAATATCCAGC
59
CCTTTGCTTGTGTTTGCAC
59
GGATTGAACAGAAGCTTCCG
59
AAGAGTTGAGGGAAAGTGCT
59
TCACAAGTGCAAACACCAG
59
AGAGTTGAGGGAAAGTGCT
59
GATGTCACAGTTAGTGCCAG
59
AAGAGTTGAGGGAAAGTGC
58
ATGTCACAGTTAGTGCCAG
58
      尚未收录相关数据

CKLF基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CKLF基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
Q9UBR5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
Q9UBR5 (UniProtKB)
IEA
GO:0008009
Q9UBR5 (UniProtKB)
IDA
GO:0008283
Q9UBR5 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
Q9UBR5 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q9UBR5 (UniProtKB)
IDA
GO:0030593
Q9UBR5 (UniProtKB)
IDA
GO:0032940
Q9UBR5 (UniProtKB)
IDA
GO:0048246
Q9UBR5 (UniProtKB)
IDA
GO:0048247
Q9UBR5 (UniProtKB)
IDA

可能调控 CKLF基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Asthma 0.000542884 2 0 BeFree
Myeloid Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Eczema 0.000271442 1 0 BeFree
Skin lesion 0.000271442 1 0 BeFree
Dermatitis, Atopic 0.000271442 1 0 BeFree
Multiple Sclerosis 0.000271442 1 0 BeFree

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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