CHST10 (carbohydrate sulfotransferase 10)

symbol:
CHST10
locus group:
protein-coding gene
location:
2q11.2
gene_family:
Sulfotransferases, membrane-bound
alias symbol:
HNK-1ST
alias name:
None
entrez id:
9486
ensembl gene id:
ENSG00000115526
ucsc gene id:
uc002tam.4
refseq accession:
NM_004854
hgnc_id:
HGNC:19650
approved reserved:
2003-03-11
2q11.2
基因染色体位置图

CHST10(碳水化合物磺基转移酶10)是一种编码碳水化合物磺基转移酶的基因,属于碳水化合物磺基转移酶(CHST)基因家族。该家族的主要功能是通过催化硫酸基团转移到碳水化合物分子(如糖胺聚糖)上,参与细胞外基质的修饰和信号传导。CHST10也被称为碳水化合物磺基转移酶3(CHST-3)或GlcNAc6ST-2,其主要作用位点是催化N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)的6位羟基磺酸化,这一修饰对多种生物学过程至关重要,包括细胞黏附、炎症反应和神经发育。CHST10的表达产物在多种组织中存在,尤其在神经系统和免疫系统中发挥重要作用。该基因的突变可能导致其酶活性异常,进而影响糖胺聚糖的硫酸化修饰,与某些神经系统疾病(如精神分裂症和自闭症谱系障碍)以及炎症性疾病(如类风湿性关节炎)的发病机制相关。如果CHST10过表达,可能会增强细胞外基质的硫酸化水平,影响细胞迁移和信号传导,甚至促进肿瘤微环境的形成;而降低表达则可能导致糖胺聚糖硫酸化不足,影响神经可塑性和免疫调节功能。CHST基因家族的共性在于它们都参与糖链的硫酸化修饰,调控细胞与基质的相互作用以及细胞间的通讯。CHST10作为该家族的一员,其功能与其他成员(如CHST1、CHST4)类似,但在底物特异性和组织分布上存在差异。研究CHST10的功能有助于深入理解糖生物学在健康和疾病中的作用,并为相关疾病的治疗提供潜在靶点。

This protein encoded by this gene transfers sulfate to the C-3 hydroxyl of terminal glucuronic acid of protein- and lipid-linked oligosaccharides. This protein was first identified as a sulfotransferase that acts on the human natural killer-1 (HNK-1) glycan; HNK-1 is a carbohydrate involved in neurodevelopment and synaptic plasticity.[provided by RefSeq, Feb 2011]

这种蛋白质由该基因转移硫酸盐蛋白质和脂质连接寡糖的末端葡萄糖醛酸的C-3羟基编码。该蛋白质最初被鉴定为作用在人NK-1(-HNK-1)聚糖一个磺; HNK-1是参与神经发育和突触可塑性碳水化合物。[由RefSeq的,2011年2月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
CHST10基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1057055       rs1057056       rs1057063       rs1057064       rs1370627       rs1465829       rs1530030       rs1530031       rs1811415       rs2099611       rs2241809       rs2241810       rs2241811       rs3748930       rs3748931       rs3748932       rs3748933      

CHST10基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGGAACTGAAGCCAACTG
59
ACGTTTCTGATGAGTTCCAG
58
CACTGAGAAAGGTGTAGATTAAGC
60
TCACCAATAGGGTTGCCTG
60
GGCAACTTGCAGTTATATTCG
58
GGTTCTTGGTTCCTCTTGTC
59
CCAGTAGGTGACAAGAGGA
58
TGATGAACTTGCTAGCCAC
58
ACAAGAGGAACCAAGAACCT
59
GCGACAGTAGGGTCTTCTG
60
ACAAGAGGAACCAAGAACCT
58
CACTGACTCTTCCTTCTGCA
59
GGCAACTTGCAGTTATATTCG
58
TCTTGGTTCCTCTTGTCAC
57
CTGTCATAACGTGACAAGAGG
59
ATGAACTTGCTAGCCACCA
59
AAGACCCAGATGTGTACAGTG
60
TCTCTTCTGGCAACTTCCTC
60
CCAGTAGGTGACAAGAGGA
58
AGAAATTAATGCGACAGTAGGG
58
      尚未收录相关数据

CHST10基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CHST10基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008146
B8ZZ48 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
B8ZZ48 (UniProtKB)
IEA
GO:0016051
B8ZZ48 (UniProtKB)
IEA
GO:0008146
C9J5X0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9J5X0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016051
C9J5X0 (UniProtKB)
IEA
GO:0008146
C9JCK7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JCK7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016051
C9JCK7 (UniProtKB)
IEA
GO:0008146
C9JI33 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JI33 (UniProtKB)
IEA
GO:0016051
C9JI33 (UniProtKB)
IEA
GO:0008146
C9JUE4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JUE4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016051
C9JUE4 (UniProtKB)
IEA
GO:0008146
C9JWY0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
C9JWY0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016051
C9JWY0 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
O43529 (UniProtKB)
TAS
GO:0005794
O43529 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
O43529 (UniProtKB)
TAS
GO:0008146
O43529 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
O43529 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
O43529 (UniProtKB)
IEA
GO:0016051
O43529 (UniProtKB)
IEA
GO:0016232
O43529 (UniProtKB)
TAS

可能调控 CHST10基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Schizophrenia 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
melanoma 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。