CHDH (choline dehydrogenase)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CHDH
locus group:
protein-coding gene
location:
3p21.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
55349
ensembl gene id:
ENSG00000016391
ucsc gene id:
uc003dgz.4
refseq accession:
NM_018397
hgnc_id:
HGNC:24288
approved reserved:
2004-11-24

基因染色体位置

基因染色体位置

3p21.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

The protein encoded by this gene is a choline dehydrogenase that localizes to the mitochondrion. Variations in this gene can affect susceptibility to choline deficiency. A few transcript variants have been found for this gene, but the full-length nature of only one has been characterized to date. [provided by RefSeq, Dec 2010]

由该基因编码的蛋白质是一个胆碱脱氢酶定位于线粒体。在这种基因的变化可能会影响易感性胆碱缺乏。一些转录物变体已被发现对于此基因，但只有一个的全长性质已被表征为最新。 [由RefSeq的，2010年12月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

CHDH基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs9001       rs12676       rs893368       rs920253       rs930366       rs930367       rs2015498       rs2118421       rs2164815       rs2196663       rs2232330       rs2232331       rs2232332       rs2241807       rs2241808       rs2276838       rs2289205      

基因表达

基因表达

CHDH基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATCCAGTTCCATTTCCTGC
59
CACATGTACCTGGTAAGCCT
59
CTGGATGTGAGGGAGAAGTG
59
CATAGCTGTACTCGTCCCG
59
ATCCAGTTCCATTTCCTGC
57
CCACATGTACCTGGTAAGC
57
GGATGTGAGGGAGAAGTGAG
59
ACATAGCTGTACTCGTCCC
58
GGATGTGAGGGAGAAGTGAG
59
CATAGCTGTACTCGTCCCG
59
ATCCAGTTCCATTTCCTGC
57
CACATGTACCTGGTAAGCC
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CHDH基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CHDH基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016614
C9J7D8 (UniProtKB)
IEA
GO:0050660
C9J7D8 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
C9J7D8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016614
C9JYW4 (UniProtKB)
IEA
GO:0050660
C9JYW4 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
C9JYW4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q8NE62 (UniProtKB)
IPI
GO:0005743
Q8NE62 (UniProtKB)
TAS
GO:0008812
Q8NE62 (UniProtKB)
TAS
GO:0019285
Q8NE62 (UniProtKB)
IEA
GO:0042426
Q8NE62 (UniProtKB)
TAS
GO:0050660
Q8NE62 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
Q8NE62 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CHDH基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.0054487 2 0 LHGDN
Coronary heart disease 0.004614512 17 8 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.003181358 3 2 BeFree_GAD
Coronary Artery Disease 0.002638474 1 1 BeFree_GAD
Choline Deficiency 0.002638474 1 2 BeFree_GAD
Congenital Heart Defects 0.002442977 9 1 BeFree
Coronary Arteriosclerosis 0.002442977 9 0 BeFree
Cleft Lip 0.002367032 1 0 GAD
Cleft Palate 0.002367032 1 0 GAD
Cerebrovascular accident 0.001900093 7 1 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备13024435号-2