CGRRF1 (cell growth regulator with ring finger domain 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CGRRF1
locus group:
protein-coding gene
location:
14q22.2
gene_family:
Ring finger proteins
alias symbol:
CGR19|RNF197
alias name:
None
entrez id:
10668
ensembl gene id:
ENSG00000100532
ucsc gene id:
uc001xay.4
refseq accession:
NM_006568
hgnc_id:
HGNC:15528
approved reserved:
2003-09-29

基因染色体位置

基因染色体位置

14q22.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CGRRF1（Cell Growth Regulator with Ring Finger domain 1）是一个含有RING（Really Interesting New Gene）结构域的基因，属于RING finger蛋白家族。这个家族的共性是其成员通常具有E3泛素连接酶活性，参与蛋白质的泛素化修饰，从而调控蛋白质的降解、定位或功能，影响细胞周期、DNA修复、信号传导等重要生物学过程。CGRRF1的生物学功能尚未完全明确，但研究表明它可能在细胞增殖、分化和凋亡中发挥作用。其表达产物可能通过泛素-蛋白酶体系统调控靶蛋白的稳定性，进而影响细胞生长。CGRRF1的主要作用位点可能在细胞核或细胞质中，具体取决于其相互作用的靶蛋白。目前关于CGRRF1突变对其功能或机体影响的研究较少，但RING finger蛋白家族的成员突变常导致蛋白质降解异常，可能与癌症、神经退行性疾病等发病机制相关。如果CGRRF1过表达，可能通过异常调控靶蛋白的降解，干扰正常的细胞增殖或凋亡途径，潜在促进肿瘤发生；而降低表达可能导致某些关键蛋白无法被正常降解，影响细胞稳态。CGRRF1与某些疾病的关系尚在探索中，但RING finger蛋白的异常表达或突变已被报道与多种癌症相关。由于研究有限，CGRRF1的具体作用机制和临床意义仍需进一步阐明。

None

无

OMIM数据库中对CGRRF1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CGRRF1基因的介绍

基因序列

基因序列

CGRRF1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CGRRF1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1130012       rs1130093       rs1954209       rs1954210       rs1959806       rs1959807       rs2298077       rs3759657       rs3759658       rs3759659       rs7141119       rs7156777       rs8009832       rs8022285       rs11555278       rs11555279       rs11555280      

基因表达

基因表达

CGRRF1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTACTCTTGGCTCAAGGTC
58
TCCAACAAACTTCTGTCTGTG
59
AACGCTTTATGAATACTCGCC
59
CAACCAAACCATCCCAATACC
60
CGCTTTATGAATACTCGCCG
60
CAAGGTTATGCCAGCATCC
59
AACGCTTTATGAATACTCGCC
59
CAACCAAACCATCCCAATACC
60
TCAGCTTCAATTACAACTGGC
59
AAACATGCTTCTGCAGAGC
59
AGAACTCCGACTTTCTCTGG
59
ATCCCAACCAAACCAAACG
59
TATTTACTCTTGGCTCAAGGTC
58
GGAATTGTTGGAGGGAGTG
58
AACGCTTTATGAATACTCGCC
59
CAACCAAACCATCCCAATACC
60
AGAACTCCGACTTTCTCTGG
59
ATCCCAACCAAACCAAACG
59
GTTTCACCATGTTGACCAGG
60
TTATGCCAGCTGTAATCCCA
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CGRRF1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CGRRF1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
G3V229 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
G3V2K9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
G3V412 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
Q99675 (UniProtKB)
IDA
GO:0006950
Q99675 (UniProtKB)
TAS
GO:0007050
Q99675 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q99675 (UniProtKB)
IEA
GO:0008285
Q99675 (UniProtKB)
TAS
GO:0043231
Q99675 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CGRRF1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Narcolepsy 0.002367032 1 0 GAD
Endometrial Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of endometrium 0.000271442 1 0 BeFree
Uterine Corpus Cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Obesity 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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