CDKN3 (cyclin dependent kinase inhibitor 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CDKN3
locus group:
protein-coding gene
location:
14q22.2
gene_family:
CDC14 phosphatases
alias symbol:
KAP|CDI1
alias name:
kinase associated phosphatase|cycl…
entrez id:
1033
ensembl gene id:
ENSG00000100526
ucsc gene id:
uc001xap.4
refseq accession:
NM_001130851
hgnc_id:
HGNC:1791
approved reserved:
1994-07-04

基因染色体位置

基因染色体位置

14q22.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CDKN3（Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor 3）是一种细胞周期调控基因，属于CIP/KIP家族（CDK抑制蛋白家族）的成员，该家族还包括p21（CDKN1A）、p27（CDKN1B）和p57（CDKN1C）。这些基因的共同特点是编码蛋白质能够抑制细胞周期蛋白依赖性激酶（CDKs）的活性，从而调控细胞周期的进程，特别是在G1/S和G2/M检查点的过渡中起关键作用。CDKN3的主要功能是通过抑制CDK2和CDK1的活性来阻止细胞周期的异常增殖，维持基因组稳定性。CDKN3的表达产物是一种磷酸酶，能够通过去磷酸化CDK2的Thr160位点使其失活，从而抑制细胞周期进程。CDKN3的突变或表达异常可能导致细胞周期失控，与多种癌症的发生发展密切相关，如肝癌、乳腺癌、肺癌和结直肠癌等。研究发现，CDKN3在某些肿瘤中表达上调，可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡来推动肿瘤进展；而在其他情况下，CDKN3的低表达可能导致细胞周期检查点功能丧失，增加基因组不稳定性。CDKN3的过表达可能抑制正常细胞的增殖，导致细胞衰老或凋亡，而降低表达则可能加速细胞周期进程，增加癌变风险。此外，CDKN3还与其他基因如p53和Rb通路相互作用，共同调控细胞周期和肿瘤抑制功能。CDKN3的表达水平可能作为某些癌症的预后标志物，高表达与不良预后相关。研究还发现，CDKN3在干细胞维持和组织再生中也有一定作用。总体而言，CDKN3在细胞周期调控和肿瘤发生中扮演双重角色，其具体功能可能因细胞类型和微环境的不同而有所差异。

The protein encoded by this gene belongs to the dual specificity protein phosphatase family. It was identified as a cyclin-dependent kinase inhibitor, and has been shown to interact with, and dephosphorylate CDK2 kinase, thus prevent the activation of CDK2 kinase. This gene was reported to be deleted, mutated, or overexpressed in several kinds of cancers. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2008]

由该基因编码的蛋白质属于双重特异性蛋白磷酸酶家族。它被鉴定为细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂，并已被证明与交互，和去磷酸化CDK2激酶，从而防止CDK2激酶的活化。据报道这种基因被删除，突变，或在数种癌症中过表达。已发现该基因编码不同亚型选择性剪接转录变异体。 [由RefSeq的，2008年8月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CDKN3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1007397       rs1803843       rs1884013       rs1884014       rs2103777       rs2143957       rs2143958       rs2179896       rs2235961       rs2239583       rs2239584       rs2268332       rs2268333       rs2300425       rs2884513       rs3783634       rs3886518      

基因表达

基因表达

CDKN3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTAATACACTGCTATGGAGGA
57
GTGATATTGTGTCAGACAGGT
58
ATGTGCTCTTCCAGTAGCT
58
ATCCTCTTAGGTCTCGCAG
58
CCTATTGAAGATGAACAGACTCC
59
TCTTGATGATAGATGTGCAGC
58
CTCGGTTTATGTGCTCTTCC
59
CCACAGCTCTTTAGTTCTTCTG
59
TTAATACACTGCTATGGAGGAC
58
GTGATATTGTGTCAGACAGGT
58
CCTATTGAAGATGAACAGACTCC
59
CTTGATGATAGATGTGCAGCT
58
TCGGTTTATGTGCTCTTCCA
60
CCACAGCTCTTTAGTTCTTCTG
59
TCTTCCAGTAGCTGCTTGTC
60
GGATCCTCTTAGGTCTCGC
59
CCTATTGAAGATGAACAGACTCC
59
TTGATGATAGATGTGCAGCT
57
ACCTTAATACACTGCTATGGAGG
60
TATTGTGTCAGACAGGTATAGTAGG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
YBX1
CDKN3
Activation
20596676

基因本体信息

CDKN3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CDKN3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004725
A0A087WW25 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
A0A087WW25 (UniProtKB)
IEA
GO:0004725
A0A087WWK3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007049
A0A087WWK3 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
A0A087WWK3 (UniProtKB)
IEA
GO:0048471
A0A087WWK3 (UniProtKB)
IEA
GO:0004725
F5H232 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
F5H232 (UniProtKB)
IDA
GO:0035335
F5H232 (UniProtKB)
IEA
GO:0004725
F8WD24 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
F8WD24 (UniProtKB)
IDA
GO:0035335
F8WD24 (UniProtKB)
IEA
GO:0004725
G3V1K6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
G3V1K6 (UniProtKB)
IDA
GO:0035335
G3V1K6 (UniProtKB)
IEA
GO:0004725
G3V2J7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
G3V2J7 (UniProtKB)
IDA
GO:0007049
G3V2J7 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
G3V2J7 (UniProtKB)
IEA
GO:0048471
G3V2J7 (UniProtKB)
IEA
GO:0004725
H7C0S3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
H7C0S3 (UniProtKB)
IDA
GO:0007049
H7C0S3 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
H7C0S3 (UniProtKB)
IEA
GO:0048471
H7C0S3 (UniProtKB)
IEA
GO:0000079
Q16667 (UniProtKB)
TAS
GO:0000082
Q16667 (UniProtKB)
TAS
GO:0004722
Q16667 (UniProtKB)
IDA
GO:0004725
Q16667 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q16667 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16667 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16667 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16667 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16667 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16667 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16667 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q16667 (UniProtKB)
IBA
GO:0005737
Q16667 (UniProtKB)
IDA
GO:0007050
Q16667 (UniProtKB)
IDA
GO:0008138
Q16667 (UniProtKB)
TAS
GO:0008285
Q16667 (UniProtKB)
TAS
GO:0035335
Q16667 (UniProtKB)
IEA
GO:0048471
Q16667 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CDKN3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver carcinoma 0.122442977 9 1 BeFree_UNIPROT
Dental caries 0.12 1 1 GWASCAT
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Malignant neoplasm of breast 0.004071628 15 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.003800186 14 0 BeFree
melanoma 0.003528744 13 0 BeFree
Carcinogenesis 0.002985861 11 0 BeFree
leukemia 0.002442977 9 0 BeFree
Narcolepsy 0.002367032 1 0 GAD
Retinoblastoma 0.002171535 8 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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