CDH9 (cadherin 9)

symbol:
CDH9
locus group:
protein-coding gene
location:
5p14.1
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
1007
ensembl gene id:
ENSG00000113100
ucsc gene id:
uc003jgs.2
refseq accession:
NM_016279
hgnc_id:
HGNC:1768
approved reserved:
1997-02-10
5p14.1
基因染色体位置图

CDH9(Cadherin 9)属于钙黏蛋白(Cadherin)基因家族,这是一类编码钙依赖性细胞黏附分子的基因家族,主要参与细胞间的识别、黏附和信号传导,对组织形态发生和维持细胞极性至关重要。CDH9编码的蛋白是一种典型的钙黏蛋白,具有胞外钙结合重复序列、跨膜结构域和胞内结构域,通过同源结合介导细胞间黏附,尤其在神经系统发育中发挥重要作用。CDH9主要在大脑皮层、海马和小脑等区域表达,与神经元迁移、突触形成及神经回路建立密切相关。研究表明,CDH9基因突变可能导致其黏附功能异常,与自闭症谱系障碍(ASD)和精神分裂症等神经发育疾病相关。某些错义突变可能破坏蛋白结构或钙结合能力,削弱细胞间相互作用,进而影响神经网络的精确组装。CDH9过表达可能增强神经元间的异常连接,扰乱神经信号传递,而表达降低则可能导致突触稳定性下降或迁移缺陷。此外,CDH9与其他钙黏蛋白家族成员(如CDH8、CDH10)功能冗余,但各自具有时空表达特异性,共同调控神经发育的精细过程。该基因家族成员均依赖钙离子维持其胞外结构的刚性,并通过连环蛋白(catenin)与细胞骨架相连,传导机械或化学信号。CDH9的异常表达还可能影响下游Wnt或MAPK通路,间接调控细胞增殖或分化。在癌症中,CDH9的甲基化沉默可能与肿瘤转移抑制功能丧失有关,但具体机制仍需进一步研究。

This gene encodes a type II classical cadherin from the cadherin superfamily, integral membrane proteins that mediate calcium-dependent cell-cell adhesion. Mature cadherin proteins are composed of a large N-terminal extracellular domain, a single membrane-spanning domain, and a small, highly conserved C-terminal cytoplasmic domain. The extracellular domain consists of 5 subdomains, each containing a cadherin motif, and appears to determine the specificity of the protein's homophilic cell adhesion activity. Type II (atypical) cadherins are defined based on their lack of a HAV cell adhesion recognition sequence specific to type I cadherins. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码从钙粘蛋白超家族,介导钙依赖性细胞 - 细胞粘着整合膜蛋白II型经典钙粘蛋白。成熟钙粘蛋白是由一个大的N-末端细胞外结构域,单个跨膜结构域和小的,高度保守的C末端胞质结构域组成。胞外结构域由5子域,每个包含一个钙粘蛋白基序,并显示,以确定该蛋白的同嗜细胞粘附活性的特异性。 II型(非典型)钙黏着蛋白是基于它们缺乏特定I型钙黏着一个HAV细胞粘附识别序列的限定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CDH9基因的碱基序列:[NCBI]
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CDH9基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2087       rs765947       rs765948       rs891030       rs891031       rs919338       rs919339       rs919340       rs919341       rs960503       rs960504       rs980209       rs982396       rs982398       rs982641       rs982763       rs989050      

CDH9基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTAAGCAAGGTCTCATTCTGTC
58
ATTATCTGCAACTTCAGTGGG
58
TAAATGACCATGCTCCGGA
58
GTCTGAATCAACTGCCCAG
58
ATGTAGGCAAGCTTCACAC
58
AACAAATAGACTGCCAGCC
58
ATAAATGACCATGCTCCGGA
59
TCTGAATCAACTGCCCAGG
59
TAAGCAAGGTCTCATTCTGTC
57
CATTATCTGCAACTTCAGTGG
57
GTAGGCAAGCTTCACACTG
58
TAACAAATAGACTGCCAGCC
58
TAAGCAAGGTCTCATTCTGTC
57
ATTATCTGCAACTTCAGTGGG
58
TAAATGACCATGCTCCGGA
58
TCTGAATCAACTGCCCAGG
59
GTAGGCAAGCTTCACACTG
58
AACAAATAGACTGCCAGCC
58
      尚未收录相关数据

CDH9基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CDH9基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
E7EPN0 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
E7EPN0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
E7EPN0 (UniProtKB)
IEA
GO:0003674
Q9ULB4 (UniProtKB)
ND
GO:0005509
Q9ULB4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9ULB4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9ULB4 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
Q9ULB4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q9ULB4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016337
Q9ULB4 (UniProtKB)
NAS
GO:0034332
Q9ULB4 (UniProtKB)
TAS

可能调控 CDH9基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Autistic Disorder 0.122367032 1 1 CTD_human_GAD
Creatinine finding 0.002367032 1 1 GAD
Glomerular filtration rate finding 0.002367032 1 1 GAD
Anorexia Nervosa 0.000271442 1 5 BeFree
Renal Cell Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Osteochondritis Dissecans 0.000271442 1 5 BeFree
Renal fibrosis 0.000271442 1 0 BeFree
Obsessive-Compulsive Disorder 0.000271442 1 5 BeFree

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