CDH8 (cadherin 8)

symbol:
CDH8
locus group:
protein-coding gene
location:
16q21
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
1006
ensembl gene id:
ENSG00000150394
ucsc gene id:
uc002eog.3
refseq accession:
NM_001796
hgnc_id:
HGNC:1767
approved reserved:
1997-02-10
16q21
基因染色体位置图

CDH8(Cadherin 8)属于钙黏蛋白(Cadherin)基因家族,这是一类依赖钙离子的细胞黏附分子,主要参与细胞间的识别与黏附,对组织形成和维持细胞极性至关重要。CDH8编码的蛋白是一种II型经典钙黏蛋白,主要在中枢神经系统表达,尤其在发育中的大脑皮层、海马和小脑中高度活跃,参与神经元迁移、突触形成和神经回路建立。其功能特点包括通过同源亲和性结合介导细胞间黏附,调控神经发育过程中的细胞排列与信号传导。CDH8基因突变可能导致其黏附功能受损,与自闭症谱系障碍(ASD)、智力障碍和精神分裂症等神经发育疾病相关。研究发现,某些ASD患者携带CDH8杂合突变,可能通过影响突触可塑性或神经元连接导致行为异常。若CDH8过表达,可能增强神经元间异常连接,扰乱神经网络的精确组装;而表达降低则可能损害神经迁移或突触稳定性,引发认知或行为缺陷。钙黏蛋白家族的共性包括拥有重复的细胞外钙结合结构域、跨膜区和高度保守的胞内结构域(与连环蛋白结合),共同调控细胞间黏附、形态发生和信号转导。CDH8与其他家族成员(如CDH1、CDH2)协同作用,但其组织分布和发育阶段特异性表达赋予独特功能。研究CDH8有助于理解神经发育障碍的分子机制,并为潜在治疗靶点提供线索。

This gene encodes a type II classical cadherin from the cadherin superfamily, integral membrane proteins that mediate calcium-dependent cell-cell adhesion. Mature cadherin proteins are composed of a large N-terminal extracellular domain, a single membrane-spanning domain, and a small, highly conserved C-terminal cytoplasmic domain. The extracellular domain consists of 5 subdomains, each containing a cadherin motif, and appears to determine the specificity of the protein's homophilic cell adhesion activity. Type II (atypical) cadherins are defined based on their lack of a HAV cell adhesion recognition sequence specific to type I cadherins. This particular cadherin is expressed in brain and is putatively involved in synaptic adhesion, axon outgrowth and guidance. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基??因编码从钙粘蛋白超家族,介导钙依赖性细胞 - 细胞粘着整合膜蛋白II型经典钙粘蛋白。成熟钙粘蛋白是由一个大的N-末端细胞外结构域,单个跨膜结构域和小的,高度保守的C末端胞质结构域组成。胞外结构域由5子域,每个包含一个钙粘蛋白基序,并显示,以确定该蛋白的同嗜细胞粘附活性的特异性。 II型(非典型)钙黏着蛋白是基于它们缺乏特定I型钙黏着一个HAV细胞粘附识别序列的限定。这个特定的钙粘蛋白在脑中表达,并且推定参与突触粘附,轴突生长和指导。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CDH8基因的碱基序列:[NCBI]
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CDH8基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs716776       rs721468       rs747928       rs747929       rs925326       rs934640       rs954015       rs968627       rs974906       rs978587       rs1012010       rs1027907       rs1033039       rs1078279       rs1162202       rs1162203       rs1162204      

CDH8基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGCCCTTGGAATAAAGAGGA
60
CAAGAGCATTTCCGCTAGC
59
TGCACAGAGCCTGTATCAC
60
CCAATATCCTGATCATTGGCC
59
CCCTTGGAATAAAGAGGAGGA
59
ATCCAAGAGCATTTCCGCT
59
GTCAACAATCCGAATTTCACC
58
GTTGAATCCATTATGCTTTGCC
59
AAGATAACGCTGGCAACAC
59
TGACTGTGGTTCCTAATTTCAG
58
CCTGTAATTGCCCAGTGGA
59
AGTTTGAATGACCTTTGTGTCC
59
ATGCCAAGATTACAGAAGAGG
58
GAGTTCATTGAAGCCATGGT
59
GAACCGATTCTTGTTGGCC
60
AGCTCCATCACCTGATAGG
58
GACACTCATAGTTCGCTACAC
59
AAATATGGTCCCAGCTCCA
58
ATTTGGAATCTCCCTGCCTC
60
TACCGTCTATGCACAAGCC
60
      尚未收录相关数据

CDH8基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CDH8基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
J3KRI5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
J3KRI5 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
J3KRI5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
J3KRI5 (UniProtKB)
IEA
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J3KTG8 (UniProtKB)
IEA
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J3KTG8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
J3KTG8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
J3QKW5 (UniProtKB)
IEA
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J3QKW5 (UniProtKB)
IEA
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J3QKW5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
J3QKW5 (UniProtKB)
IEA
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J3QLE6 (UniProtKB)
IEA
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J3QLE6 (UniProtKB)
IEA
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J3QLE6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
J3QLE6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
P55286 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
P55286 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P55286 (UniProtKB)
TAS
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P55286 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
P55286 (UniProtKB)
IEA
GO:0009409
P55286 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
P55286 (UniProtKB)
IEA
GO:0034332
P55286 (UniProtKB)
TAS
GO:0035249
P55286 (UniProtKB)
IEA
GO:0043083
P55286 (UniProtKB)
IEA
GO:0043679
P55286 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
X6R3Y6 (UniProtKB)
IEA
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X6R3Y6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
X6R3Y6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
X6R3Y6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CDH8基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Renal Cell Carcinoma 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Cystic Fibrosis 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Creatinine finding 0.002367032 1 1 GAD
Learning Disabilities 0.000271442 1 0 BeFree
Atrial Septal Defects 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Autistic Disorder 0.000271442 1 0 BeFree

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