CDH6 (cadherin 6)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CDH6
locus group:
protein-coding gene
location:
5p13.3
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
None
alias name:
K-Cadherin
entrez id:
1004
ensembl gene id:
ENSG00000113361
ucsc gene id:
uc003jhe.3
refseq accession:
NM_004932
hgnc_id:
HGNC:1765
approved reserved:
1997-02-10

基因染色体位置

基因染色体位置

5p13.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CDH6（Cadherin-6）属于钙黏蛋白（Cadherin）基因家族，是一类依赖钙离子的细胞黏附分子，主要参与细胞间的识别与黏附。该家族成员具有高度保守的胞外钙结合重复序列（EC结构域），通过同源结合介导细胞间连接，并在胚胎发育、组织形态维持及信号转导中发挥关键作用。CDH6在多种组织中表达，尤其在肾脏、神经系统和某些上皮组织中较为显著，其表达产物通过调控细胞迁移、极性建立和器官形成参与发育过程。在肾脏中，CDH6对肾小管和肾小球的结构形成至关重要，而在神经系统中可能影响神经元迁移和突触连接。突变或表达异常可能导致功能紊乱，例如CDH6的异常表达与肾细胞癌、卵巢癌等肿瘤的侵袭转移相关，其过表达可能增强肿瘤细胞的迁移和侵袭能力，而表达降低则可能破坏组织完整性。此外，CDH6与Wnt/β-catenin等信号通路存在交互，影响下游靶基因的调控。在基因家族中，钙黏蛋白成员（如E-cadherin、N-cadherin）均通过钙依赖性黏附参与细胞间连接，但各自具有组织特异性分布和功能。研究显示，CDH6可能作为癌症诊断或治疗的潜在靶点，但其具体机制仍需进一步探索。

This gene encodes a member of the cadherin superfamily. Cadherins are membrane glycoproteins that mediate homophilic cell-cell adhesion and play critical roles in cell differentiation and morphogenesis. The encoded protein is a type II cadherin and may play a role in kidney development as well as endometrium and placenta formation. Decreased expression of this gene may be associated with tumor growth and metastasis. [provided by RefSeq, May 2011]

该基因编码的钙粘蛋白家族的一个成员。钙黏着蛋白是介导嗜同细胞 - 细胞粘附和在细胞分化和形态发生的关键作用的膜糖蛋白。所编码的蛋白质是一个II型钙粘蛋白和可能在肾脏发育以及子宫内膜和胎盘形成中起作用。该基因的表达降低可能与肿瘤生长和转移相关联。 [由RefSeq的，2011年5月提供]

OMIM数据库中对CDH6基因的介绍     Wikipedia数据库中对CDH6基因的介绍

基因序列

基因序列

CDH6基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CDH6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs509963       rs517167       rs545781       rs626147       rs636712       rs637161       rs639386       rs652549       rs655619       rs867598       rs867987       rs883938       rs1222279       rs1317152       rs1317180       rs1318821       rs1319851      

基因表达

基因表达

CDH6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGATAAACACCACAATAGGCTC
58
GTCGATCTACAGAGTACTTGAC
58
TGATGTCGGTACATTTGTTGTC
59
ACTGTAGACAACTTTAGCACTG
59
AGACAACAAAGACAACACGG
59
AGGCAAGAGATAGGTGCTC
59
GTGATCCTACTAGTGACAGTG
57
CTCTTTGGAAATGATCAAAGGC
58
GAGCAGAGCACAAATGAGG
59
CTGCAACTACTCAGTGTGG
58
CAAGACAACAAAGACAACACG
58
CAAGAGATAGGTGCTCATCTC
57
ATGTGGGCAAGTTACATTCAG
59
GATCTCCTGCTCCATCTCC
59
CGAGCAGAGCACAAATGAG
59
TGCAACTACTCAGTGTGGA
59
CAAGACAACAAAGACAACACG
59
CAAGAGATAGGTGCTCATCTC
58
TGATGTCGGTACATTTGTTGTC
59
GTAGACAACTTTAGCACTGTTCC
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
DNMT3A
CDH6
Repression
19070387

基因本体信息

CDH6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CDH6基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
D6RF86 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
D6RF86 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
D6RF86 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
D6RF86 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
P55285 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
P55285 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P55285 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
P55285 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
P55285 (UniProtKB)
IEA
GO:0007219
P55285 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
P55285 (UniProtKB)
IEA
GO:0034332
P55285 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
P55285 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CDH6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Cachexia 0.12 1 0 CTD_human
Myocardial Infarction 0.002638474 1 1 BeFree_GAD
Renal Cell Carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Renal carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.000271442 1 0 BeFree
Thyroid carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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