CDH26 (cadherin 26)

symbol:
CDH26
locus group:
protein-coding gene
location:
20q13.33
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
VR20
alias name:
None
entrez id:
60437
ensembl gene id:
ENSG00000124215
ucsc gene id:
uc002ybe.4
refseq accession:
NM_177980
hgnc_id:
HGNC:15902
approved reserved:
2001-06-21
20q13.33
基因染色体位置图

CDH26(Cadherin-26)属于钙黏蛋白(Cadherin)基因家族,这是一类依赖钙离子的跨膜糖蛋白,主要介导细胞间黏附,参与组织形态发生和细胞信号传导。该家族成员具有高度保守的胞外钙黏蛋白重复结构域(EC,extracellular cadherin domains),通过同源结合实现细胞选择性黏附。CDH26在人体中主要表达于呼吸道、消化道等上皮组织,其编码蛋白通过维持上皮屏障完整性参与免疫调节。研究发现CDH26能与嗜酸性粒细胞表面整合素αEβ7结合,可能调控过敏性炎症反应(如哮喘)中嗜酸性粒细胞的募集与活化。该基因突变可能导致上皮屏障功能障碍,与嗜酸性食管炎(EoE)、慢性鼻窦炎等Th2型炎症疾病相关。CDH26过表达会增强细胞间黏附并可能抑制上皮-间质转化(EMT),而表达降低则可能破坏组织稳态,促进炎症浸润。在肿瘤中,CDH26表现出双重作用:在头颈鳞癌等恶性肿瘤中常因启动子甲基化而表达沉默,可能促进转移;但在胃肠道间质瘤(GIST)中过表达又与不良预后相关,提示其功能具有组织特异性。CDH26与家族经典成员E-cadherin(CDH1)不同,其胞内结构域较短且缺乏典型β-catenin结合位点,可能通过非经典途径转导信号。目前针对CDH26的干预策略(如单抗阻断)正在过敏性疾病的临床前研究中探索。

Cadherins are a family of adhesion molecules that mediate Ca2+-dependent cell-cell adhesion in all solid tissues and modulate a wide variety of processes, including cell polarization and migration. Cadherin domains occur as repeats in the extracellular region and are thought to contribute to the sorting of heterogeneous cell types and the maintenance of orderly structures such as epithelium. This gene encodes a cadherin domain-containing protein whose specific function has not yet been determined. Alternative splicing occurs at this locus and two transcript variants, encoding distinct proteins, have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

钙粘着糖蛋白是介导在所有固体组织内Ca2 +依赖性细胞 - 细胞粘着和调节各种各样的过程,包括细胞极化和迁移粘附分子的家族。钙粘蛋白结构域发生在细胞外区域的重复,并且被认为有助于异质细胞类型的分类和有序的结构,例如上皮的维护。该基因编码一种钙粘蛋白结构域的蛋白,其特定的功能还没有被确定。选择性剪接发生在此位点和两个转录变异体,编码不同的蛋白质,已经鉴定。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CDH26基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
CDH26基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs168977       rs168978       rs168979       rs168980       rs168981       rs168982       rs171842       rs174269       rs183174       rs183778       rs187750       rs187751       rs194975       rs194976       rs194977       rs194978       rs194979      

CDH26基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TATCCAATGATGAAGGCCAC
58
AACATCTGACCATGTCTGG
57
GTCAGATGTTGAAGGCCAG
59
CTCGAGATCCTTAACTCCCT
58
GTCAGATGTTGAAGGCCAG
59
GCCATAACCCTTAACTCCCT
59
ACTCTACTCCTGCTTACCC
58
TCAATGTCTCTGCCATCCT
58
CAGATGCCACAATGCACAG
60
TTGGCAACATGGAGTTTCTG
59
TGACCACAAGGAAGATGAGG
60
TCATTTCTCAGCTGCATAACC
59
GTCAGATGTTGAAGGCCAG
59
GCCATAACCCTTAACTCCCT
59
TTACCCAGGAGAACTATAAGGT
58
CTCGATCTTGAACCAGGAG
57
GGAGTTAAGGCTTACCCAG
57
ATTCAATGTCTCTGCCATCC
58
TCTAGAGGGAAGTATAAGGTTCAG
59
ATCTCGATCTTGAACCAGGAG
59
      尚未收录相关数据

CDH26基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CDH26基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
H7BY79 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
H7BY79 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
H7BY79 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H7BY79 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q8IXH8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q8IXH8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
Q8IXH8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q8IXH8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CDH26基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Immediate hypersensitivity 0.002367032 1 0 GAD
Asthma 0.002367032 1 0 GAD
Systemic arterial pressure 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Blood pressure finding 0.002367032 1 1 GAD

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。