CDH20 (cadherin 20)

symbol:
CDH20
locus group:
protein-coding gene
location:
18q21.33
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
CDH7L3|Cdh7
alias name:
None
entrez id:
28316
ensembl gene id:
ENSG00000101542
ucsc gene id:
uc002lif.3
refseq accession:
NM_031891
hgnc_id:
HGNC:1760
approved reserved:
1998-11-18
18q21.33
基因染色体位置图

CDH20(Cadherin-20)属于钙黏蛋白(Cadherin)基因家族,这是一类依赖钙离子的细胞黏附分子,主要参与细胞间的识别与连接,对组织形成和维持细胞极性至关重要。CDH20在神经系统中高度表达,尤其在胚胎发育阶段,它通过介导同型细胞间的黏附作用,调控神经嵴细胞的迁移和轴突导向,对神经系统发育具有关键影响。其表达产物是一种跨膜糖蛋白,胞外段含有重复的钙结合结构域,负责细胞间特异性识别;胞内段则与连环蛋白(Catenin)结合,连接细胞骨架,传递机械力和信号。若CDH20发生功能丧失性突变,可能导致神经嵴细胞迁移异常,与先天性神经管缺陷或颅面发育障碍相关。相反,过表达可能增强细胞聚集,抑制侵袭性,但某些癌症中其异常高表达可能与转移抑制相关。CDH20的表达水平变化还可能影响Wnt/β-catenin等信号通路,干扰细胞增殖或分化平衡。钙黏蛋白家族的共性包括依赖钙离子维持结构稳定性、通过同亲性结合介导选择性细胞黏附,并在胚胎发育、组织稳态及癌症中发挥双重作用(抑癌或促转移)。研究提示CDH20可能作为某些神经内分泌肿瘤的生物标志物,但其具体机制仍需深入探索。

This gene is a type II classical cadherin from the cadherin superfamily and one of three cadherin 7-like genes located in a cluster on chromosome 18. The encoded membrane protein is a calcium dependent cell-cell adhesion glycoprotein comprised of five extracellular cadherin repeats, a transmembrane region and a highly conserved cytoplasmic tail. Type II (atypical) cadherins are defined based on their lack of a HAV cell adhesion recognition sequence specific to type I cadherins. Since disturbance of intracellular adhesion is a prerequisite for invasion and metastasis of tumor cells, cadherins are considered prime candidates for tumor suppressor genes. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因是从钙粘蛋白家族II型经典钙粘蛋白和位于一个簇号染色体上的18 3钙粘蛋白7样基因一项所述的编码膜蛋白钙依赖性细胞 - 细胞粘着的糖蛋白由五个细胞外的钙粘蛋白重复,跨膜区和一个高度保守的胞质尾区。 II型(非典型)钙黏着蛋白是基于它们缺乏特定I型钙黏着一个HAV细胞粘附识别序列的限定。由于细胞间粘附的干扰为侵入和肿瘤细胞的转移的前提条件,钙黏着蛋白被认为是肿瘤抑制基因的主要候选。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CDH20基因的碱基序列:[NCBI]
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CDH20基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs123577       rs474087       rs482937       rs484989       rs486782       rs487823       rs489423       rs492160       rs492260       rs497686       rs502927       rs511931       rs514204       rs516154       rs518103       rs519170       rs519174      

CDH20基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCTACATGCTCCCAGTCAG
60
CAACACCAGCACTAAGAGGA
60
CCTACATGCTCCCAGTCAG
60
AACACCAGCACTAAGAGGAC
60
CCTACATGCTCCCAGTCAG
60
ACACCAGCACTAAGAGGAC
59
      尚未收录相关数据

CDH20基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CDH20基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
Q9HBT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9HBT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
Q9HBT6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q9HBT6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CDH20基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Diabetic Nephropathy 0.002367032 1 0 GAD
Major Depressive Disorder 0.000271442 1 0 BeFree
Adenoma 0.000271442 1 0 BeFree
Congenital Abnormality 0.000271442 1 0 BeFree
Unipolar Depression 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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