CDH19 (cadherin 19)

symbol:
CDH19
locus group:
protein-coding gene
location:
18q22.1
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
CDH7
alias name:
None
entrez id:
28513
ensembl gene id:
ENSG00000071991
ucsc gene id:
uc002lkc.3
refseq accession:
NM_021153
hgnc_id:
HGNC:1758
approved reserved:
1998-11-18
18q22.1
基因染色体位置图

CDH19(Cadherin 19)属于钙黏蛋白(Cadherin)基因家族,这是一类依赖钙离子的细胞黏附分子,主要参与细胞间的识别、黏附和信号传导。钙黏蛋白家族的共性包括含有多个细胞外钙结合重复序列(EC结构域)、一个跨膜区和一个高度保守的细胞内结构域,通常与连环蛋白(catenin)结合以连接细胞骨架。CDH19在神经发育中起关键作用,尤其在神经嵴细胞的迁移、轴突导向和突触形成中表现突出。其表达产物通过同亲性结合(相同分子间相互作用)介导细胞黏附,影响神经网络的组装。CDH19的突变可能导致黏附功能异常,与神经发育障碍如癫痫、自闭症谱系障碍(ASD)和智力残疾相关。某些研究还发现CDH19在黑色素瘤中过表达,可能通过促进肿瘤细胞侵袭和转移参与癌症进展。若CDH19表达降低,可能破坏神经嵴细胞的定向迁移,导致周围神经系统发育缺陷(如先天性巨结肠);而过表达可能增强细胞黏附的异常聚集,或通过激活下游信号通路(如Wnt/β-catenin)促进肿瘤恶性行为。此外,CDH19与家族成员(如CDH2、CDH12)功能部分冗余,但具有组织特异性表达模式。其调控异常可能间接影响其他黏附分子(如整合素)或神经导向因子(如Netrin)的活性,进一步扰乱发育或疾病进程。

This gene is one of three related type II cadherin genes situated in a cluster on chromosome 18. The encoded protein is a calcium dependent cell-cell adhesion glycoprotein containing five extracellular cadherin repeats. Loss of cadherins may be associated with cancer formation. Alternative splicing results in multiple transcript variants for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2012]

该基因是位于一个簇号染色体上的18编码的蛋白质是包含五个细胞外钙粘蛋白重复钙依赖性细胞 - 细胞粘着的糖蛋白的三个相关的II型钙粘蛋白的基因之一。钙黏着蛋白的损失可以与癌症形成相关联。选择性剪接结果在该基因转录的多个变种。 [由RefSeq的,2012年8月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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CDH19基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs472455       rs473858       rs474115       rs474961       rs478087       rs479452       rs482015       rs483267       rs487514       rs489253       rs495748       rs497810       rs497894       rs500289       rs502223       rs503730       rs508987      

CDH19基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTACAAAGGACTTCCACAGC
58
ACATTTCCCTTGAGAACTGG
58
ACATCAATGATCATGCTCCTG
59
AAATAAACCCTGACCAGAGC
58
GATCATGCTCCTGAGTTCTC
58
GATAGTCTGAATTACCTGACCAG
58
TGGTAATAATGCTCGTCTCCT
59
CTTATGACTCCTGTTGTTGGT
58
GATCATGCTCCTGAGTTCTC
58
GATAGTCTGAATTACCTGACCAG
58
TGGTAATAATGCTCGTCTCCT
58
CTTATGACTCCTGTTGTTGGT
58
TGGTAATAATGCTCGTCTCC
57
CTTATGACTCCTGTTGTTGGT
58
TTACAAAGGACTTCCACAGC
58
CATTTCCCTTGAGAACTGGA
58
TGGTAATAATGCTCGTCTCC
57
CTTATGACTCCTGTTGTTGGT
58
ACATCAATGATCATGCTCCT
57
AAATAAACCCTGACCAGAGC
58
      尚未收录相关数据

CDH19基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CDH19基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
F8VVI9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
F8VVI9 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
F8VVI9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
J3KTP3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
J3KTP3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
J3KTP3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
J3KTP3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q9H159 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9H159 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
Q9H159 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q9H159 (UniProtKB)
IEA

可能调控 CDH19基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Congenital Abnormality 0.000271442 1 0 BeFree
Unipolar Depression 0.000271442 1 0 BeFree
Glioblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Major Depressive Disorder 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

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