CDH12 (cadherin 12)

symbol:
CDH12
locus group:
protein-coding gene
location:
5p14.3
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
Br-cadherin|CDHB
alias name:
None
entrez id:
1010
ensembl gene id:
ENSG00000154162
ucsc gene id:
uc063cos.1
refseq accession:
NM_004061
hgnc_id:
HGNC:1751
approved reserved:
1995-07-14
5p14.3
基因染色体位置图

CDH12(Cadherin-12,钙黏蛋白12)属于钙黏蛋白超家族(Cadherin superfamily),是一类依赖钙离子的细胞黏附分子,主要参与细胞间连接和组织结构的维持。该基因家族(Classical cadherins)的共性是通过其胞外结构域(EC,extracellular domain)的重复序列介导同型黏附(homophilic binding),即相同类型的钙黏蛋白相互结合,而胞内结构域则与连环蛋白(catenin)结合,连接到细胞骨架(如肌动蛋白),从而调控细胞极性、迁移和组织形态发生。CDH12在神经系统中高表达,尤其在胚胎发育阶段,对神经元迁移、轴突导向和突触形成起关键作用。其表达产物通过调控细胞间信号传导(如Wnt/β-catenin通路)影响神经回路建立。突变可能导致CDH12功能丧失,破坏细胞黏附,与神经发育障碍(如自闭症谱系障碍ASD)和精神分裂症相关。某些错义突变(missense mutation,单个氨基酸改变)可能削弱其与钙离子或结合蛋白的相互作用,而截短突变(truncating mutation)则直接导致蛋白功能缺失。过表达CDH12可能增强细胞聚集并抑制迁移,在癌症中可能促进肿瘤细胞间黏附而抑制转移,但某些情况下异常高表达可能干扰正常组织架构。低表达则可能削弱细胞连接,增加组织脆弱性,在神经系统中可能引发突触可塑性异常或轴突导向缺陷。CDH12与其他钙黏蛋白(如CDH1、CDH2)功能部分冗余,但其特异性表达模式决定其在特定组织(如大脑皮层)中的不可替代性。目前研究还发现CDH12与阿尔茨海默病(AD)的病理进程相关,可能通过影响β-淀粉样蛋白(Aβ)的细胞间扩散。术语解释:同型黏附指相同分子间的特异性结合;错义突变是DNA序列改变导致蛋白质中一个氨基酸被替换;截短突变指蛋白质合成提前终止。

This gene encodes a type II classical cadherin from the cadherin superfamily of integral membrane proteins that mediate calcium-dependent cell-cell adhesion. Mature cadherin proteins are composed of a large N-terminal extracellular domain, a single membrane-spanning domain, and a small, highly conserved C-terminal cytoplasmic domain. Type II (atypical) cadherins are defined based on their lack of a HAV cell adhesion recognition sequence specific to type I cadherins. This particular cadherin appears to be expressed specifically in the brain and its temporal pattern of expression would be consistent with a role during a critical period of neuronal development, perhaps specifically during synaptogenesis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码从介导钙依赖性细胞 - 细胞粘着的整合膜蛋白的钙粘蛋白家族II型经典钙粘蛋白。成熟钙粘蛋白是由一个大的N-末端细胞外结构域,单个跨膜结构域和小的,高度保守的C末端胞质结构域组成。 II型(非典型)钙黏着蛋白是基于它们缺乏特定I型钙黏着一个HAV细胞粘附识别序列的限定。这个特定的钙粘蛋白似乎在脑中特异性表达的,并且在突触中神经元发育,也许特别的关键时期表达的其时间模式将与一个作用是一致的。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CDH12基因的碱基序列:[NCBI]
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CDH12基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs958614       rs2119887       rs2165669       rs2920107       rs2963423       rs2963424       rs4256315       rs4345275       rs4345276       rs4351108       rs4538578       rs4591708       rs4701299       rs4701300       rs6861317       rs6888309       rs6892744      

CDH12基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGACTTCAGAAACAACACAGC
59
GGGAGGAAATACAACTCTTGC
59
ACTGATGGCATGGAAAGCT
60
CATATGCACCTAAAGAAGCCTC
59
TCTCACCTCGTTCACAGAG
59
TTGGCTGAAACTTTGTAGCA
58
TCTATTTGGAGGGTTGTGCA
59
ATGATGCAGGCATTAATCCT
57
AATCAAGTTACTGTGGAGGTC
58
CGACTTATACAAGTTAGAGGCA
58
GACATAGAAACCAGAAAGCCC
59
TACATATGCACCCACAGGA
58
GACATAGAAACCAGAAAGCCC
59
TACATATGCACCCACAGGA
58
AAAGCTTTGATGTCCAGTGC
60
CATTCGACTTATACAAGTTAGAGGC
60
ACATAGAAACCAGAAAGCCC
58
TTCTAATAACACCCACAGGAG
57
GACATAGAAACCAGAAAGCCC
59
TACATATGCACCCACAGGA
58
      尚未收录相关数据

CDH12基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CDH12基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
P55289 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
P55289 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P55289 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
P55289 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
P55289 (UniProtKB)
IEA
GO:0034332
P55289 (UniProtKB)
TAS

可能调控 CDH12基因的相关microRNA:     

Reactome

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Multiple Myeloma 0.12 1 1 GWASCAT
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Bipolar Disorder 0.002367032 1 0 GAD

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