CDH11 (cadherin 11)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CDH11
locus group:
protein-coding gene
location:
16q21
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
OB|CAD11
alias name:
OB-Cadherin
entrez id:
1009
ensembl gene id:
ENSG00000140937
ucsc gene id:
uc002eoi.4
refseq accession:
NM_033664
hgnc_id:
HGNC:1750
approved reserved:
1995-03-30

基因染色体位置

基因染色体位置

16q21
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CDH11（Cadherin-11）是一种钙依赖性细胞黏附分子，属于钙黏蛋白（Cadherin）基因家族。该家族成员通过钙离子介导的细胞间黏附参与组织形成和维持，其共性包括具有重复的细胞外钙结合结构域（EC）、跨膜区和高度保守的细胞内结构域，后者与连环蛋白（catenin）相互作用连接细胞骨架。CDH11主要在间充质细胞（如成骨细胞、成纤维细胞和软骨细胞）中表达，调控细胞迁移、组织形态发生和伤口愈合等过程。其表达产物通过同源二聚化介导细胞间识别与黏附，影响胚胎发育（如神经嵴细胞迁移）和成骨分化（促进骨形成）。突变可能导致功能丧失，与颅骨发育异常（如颅缝早闭）或关节炎相关，而过度表达与纤维化疾病（如肺纤维化）、肿瘤侵袭转移（尤其骨转移性癌症）和慢性炎症（如类风湿关节炎）密切相关。CDH11过表达会增强细胞迁移能力，激活TGF-β等促纤维化通路，同时上调MMPs（基质金属蛋白酶）促进细胞外基质降解；低表达则可能破坏组织完整性，影响骨愈合或导致胚胎发育缺陷。在疾病中，CDH11通过调控EMT（上皮-间质转化，指上皮细胞获得迁移特性的过程）和炎症微环境参与病理进程，目前是骨代谢疾病和纤维化治疗的潜在靶点。

This gene encodes a type II classical cadherin from the cadherin superfamily, integral membrane proteins that mediate calcium-dependent cell-cell adhesion. Mature cadherin proteins are composed of a large N-terminal extracellular domain, a single membrane-spanning domain, and a small, highly conserved C-terminal cytoplasmic domain. Type II (atypical) cadherins are defined based on their lack of a HAV cell adhesion recognition sequence specific to type I cadherins. Expression of this particular cadherin in osteoblastic cell lines, and its upregulation during differentiation, suggests a specific function in bone development and maintenance. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码从钙粘蛋白超家族，介导钙依赖性细胞 - 细胞粘着整合膜蛋白II型经典钙粘蛋白。成熟钙粘蛋白是由一个大的N-末端细胞外结构域，单个跨膜结构域和小的，高度保守的C末端胞质结构域组成。 II型（非典型）钙黏着蛋白是基于它们缺乏特定I型钙黏着一个HAV细胞粘附识别序列的限定。在成骨细胞系中此特定钙粘蛋白，和分化过程中的上调的表达表明在骨骼发育和维持一个特定的功能。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CDH11基因的介绍     Wikipedia数据库中对CDH11基因的介绍

基因序列

基因序列

CDH11基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CDH11基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs28216       rs35139       rs35140       rs35141       rs35142       rs35143       rs35144       rs35145       rs35146       rs35147       rs35148       rs35149       rs35150       rs35151       rs35152       rs35153       rs35154      

基因表达

基因表达

CDH11基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGGCCTACATTCTGAACG
58
ACAATACTACAATGACCAGGAG
58
CTTTATCTGGGCTTCCAGC
58
CTACAATGACGTAAGTGTGGT
58
GAGGCCTACATTCTGAACG
58
ACAATACTACAATGACCAGGAG
58
CAGCAGAAATCCACAATCGG
60
CTTGGGAGCATTATCGTTGAC
60
GTGACAGAGGCATCCTCTC
60
AACACAGTGATTTCCTCTTCG
59
TGTTTAATCCTGGCTCCAG
57
CAGTGATTTCTTTCCTTCACC
57
CCCAGGTGAGAAATCACTG
58
CCCATCTGATTGGTCACTC
58
ATGGGTGAAGAAGGTTGCT
59
TTTCTCCAAGATGCGAATTGAG
59
CCGAAGAGGAAATCACTGTG
59
CACCCATCTGATTGGTCAC
58
TTGTTGATGGAGATGGTATGGA
59
CCCTCCTGTGTTTCATAGTC
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
AR
CDH11
Unknown
20191612

基因本体信息

CDH11基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CDH11基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
A0A087X227 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
A0A087X227 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
A0A087X227 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
H3BQH2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
H3BQH2 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
H3BQH2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
H3BUU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
H3BUU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
H3BUU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H3BUU9 (UniProtKB)
IEA
GO:0001501
P55287 (UniProtKB)
TAS
GO:0001503
P55287 (UniProtKB)
NAS
GO:0005509
P55287 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
P55287 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
P55287 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P55287 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
P55287 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
P55287 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
P55287 (UniProtKB)
IEA
GO:0021957
P55287 (UniProtKB)
IEA
GO:0034332
P55287 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
P55287 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P55287 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CDH11基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neoplasm Metastasis 0.006524536 14 0 BeFree_LHGDN
Mammary Neoplasms 0.005720142 3 0 BeFree_LHGDN
Bone Cysts, Aneurysmal 0.003538676 3 0 BeFree_LHGDN
Retinoblastoma 0.003538676 3 0 BeFree_LHGDN
Osteosarcoma 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Prostatic Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Mixed Salivary Gland Tumor 0.00272435 1 0 LHGDN
Systemic arterial pressure 0.002367032 1 1 GAD
Laryngeal neoplasm 0.002367032 1 0 GAD
Mouth Neoplasms 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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