CDH10 (cadherin 10)

symbol:
CDH10
locus group:
protein-coding gene
location:
5p14.2-p14.1
gene_family:
Major cadherins
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
1008
ensembl gene id:
ENSG00000040731
ucsc gene id:
uc003jgr.3
refseq accession:
NM_006727
hgnc_id:
HGNC:1749
approved reserved:
1997-02-10
5p14.2-p14.1
基因染色体位置图

CDH10(钙黏蛋白10,Cadherin-10)属于钙黏蛋白(Cadherin)基因家族,这是一类依赖钙离子的细胞黏附分子,主要介导细胞间的识别与结合,参与组织形成和信号传导。该家族成员具有高度保守的胞外钙结合重复序列(EC结构域),通过同源结合(即相同类型钙黏蛋白相互结合)调控细胞极性、迁移及胚胎发育。CDH10在中枢神经系统(如大脑皮层、海马体)高表达,尤其在神经元突触形成和神经回路建立中起关键作用,影响认知功能和神经发育。其表达产物通过调控Wnt/β-catenin等信号通路参与神经细胞分化和突触可塑性。突变可能导致CDH10功能丧失,破坏细胞黏附或信号传递,与自闭症谱系障碍(ASD)、精神分裂症等神经精神疾病相关。全基因组关联研究(GWAS)发现其基因座与ASD风险显著相关,推测突变可能影响神经元连接精度。过表达CDH10可能增强神经元间异常黏附,干扰神经网络平衡;而表达降低则可能导致突触稳定性下降或迁移缺陷。此外,CDH10在癌症中表现双重角色:某些肿瘤中表达下调(如胶质瘤)可能促进侵袭转移,而过表达(如乳腺癌)可能与不良预后相关,具体机制涉及上皮-间质转化(EMT)调控。该基因家族共性包括:依赖钙离子的同型细胞黏附、参与形态发生和组织稳态维持,并在癌症中常表现异常甲基化或突变。

This gene encodes a type II classical cadherin from the cadherin superfamily, integral membrane proteins that mediate calcium-dependent cell-cell adhesion. Mature cadherin proteins are composed of a large N-terminal extracellular domain, a single membrane-spanning domain, and a small, highly conserved C-terminal cytoplasmic domain. The extracellular domain consists of 5 subdomains, each containing a cadherin motif, and appears to determine the specificity of the protein's homophilic cell adhesion activity. Type II (atypical) cadherins are defined based on their lack of a HAV cell adhesion recognition sequence specific to type I cadherins. This particular cadherin is predominantly expressed in brain and is putatively involved in synaptic adhesions, axon outgrowth and guidance. [provided by RefSeq, Jan 2011]

该基因编码从钙粘蛋白超家族,介导钙依赖性细胞 - 细胞粘着整合膜蛋白II型经典钙粘蛋白。成熟钙粘蛋白是由一个大的N-末端细胞外结构域,单个跨膜结构域和小的,高度保守的C末端胞质结构域组成。胞外结构域由5子域,每个包含一个钙粘蛋白基序,并显示,以确定该蛋白的同嗜细胞粘附活性的特异性。 II型(非典型)钙黏着蛋白是基于它们缺乏特定I型钙黏着一个HAV细胞粘附识别序列的限定。这种特殊的钙粘蛋白是大脑中主要表达和被推定参与突触粘连,轴突生长和指导。 [由RefSeq的,2011年1月提供]

CDH10基因的碱基序列:[NCBI]
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CDH10基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs167964       rs332005       rs332006       rs332007       rs332008       rs332009       rs332010       rs332011       rs332012       rs906000       rs952168       rs961122       rs962677       rs975269       rs975270       rs976968       rs983446      

CDH10基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAGGCAACATGCAATCCT
59
CTGCAAACAGTACTACTATAACCAG
59
AAGGCAACATGCAATCCTG
59
CTGCAAACAGTACTACTATAACCAG
59
AACATGCAATCCTGCAGTG
59
CTGCAAACAGTACTACTATAACCAG
59
      尚未收录相关数据

CDH10基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CDH10基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
D6RJG0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
D6RJG0 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
D6RJG0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
D6RJG0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q9Y6N8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9Y6N8 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9Y6N8 (UniProtKB)
TAS
GO:0007156
Q9Y6N8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q9Y6N8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016337
Q9Y6N8 (UniProtKB)
NAS
GO:0034332
Q9Y6N8 (UniProtKB)
TAS

可能调控 CDH10基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Autistic Disorder 0.124734064 2 2 CTD_human_GAD
Fibrinogen Adverse Event 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.002367032 1 1 GAD
Colorectal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000542884 2 0 BeFree

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