CDC42P1 (cell division cycle 42 pseudogene 1)

symbol:
CDC42P1
locus group:
pseudogene
location:
20q11.22
gene_family:
alias symbol:
bK3216D2.3
alias name:
None
entrez id:
170503
ensembl gene id:
ENSG00000234933
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refseq accession:
NG_023206
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HGNC:16339
approved reserved:
2001-09-17
20q11.22
基因染色体位置图

CDC42P1(也称为CDC42EP1)是CDC42效应蛋白(CDC42 effector protein,CEP)家族的一员,属于Rho GTP酶效应蛋白家族。该基因编码的蛋白通过与CDC42(一种调控细胞骨架和信号转导的小GTP酶)结合,参与细胞形态维持、细胞极性建立、细胞迁移及细胞间连接的调控。其生物学功能依赖于CDC42的激活状态,通过调控肌动蛋白(actin)细胞骨架的重排影响细胞运动。主要作用位点包括细胞膜和细胞质,尤其在细胞边缘的膜突起(如片状伪足和丝状伪足)中富集。若CDC42P1发生功能丧失性突变,可能导致细胞迁移障碍或极性缺陷;而增益性突变可能过度激活下游通路,与肿瘤侵袭转移相关。该基因家族(CDC42EP1-5)的共性是通过保守的CDC42/Rho相互作用结构域(CRIB)与CDC42结合,并共享对细胞骨架动态的调控功能。过表达CDC42P1会增强细胞运动能力,可能促进癌症转移,同时干扰其他CEP家族成员的功能平衡;而低表达可能导致组织发育异常或伤口愈合延迟。研究发现CDC42P1在乳腺癌、结肠癌中异常高表达,与不良预后相关,其机制涉及上皮-间质转化(EMT)的促进。专业术语解释:GTP酶(Guanosine Triphosphatase)是一种水解GTP的酶,参与细胞信号传导;上皮-间质转化(Epithelial-Mesenchymal Transition, EMT)是上皮细胞获得迁移能力的生物学过程。目前中文术语"效应蛋白"(effector protein)存在争议,部分文献译为"效应子蛋白"。

None

CDC42P1基因的碱基序列:[NCBI]
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CDC42P1基因的碱基突变:           仅显示部分snp

CDC42P1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAACAGAAGCCTATCACTCC
57
GACAGTCTTCAGGTCATGG
58
AGCCTATCACTCCAGAGAC
58
CGTACTTGACAGTCTTCAGG
58
CAAACAGAAGCCTATCACTCC
59
ACAGTCTTCAGGTCATGGG
59
      尚未收录相关数据

CDC42P1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CDC42P1基因的本体(GO)信息:

可能调控 CDC42P1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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