CD96 (CD96 molecule)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CD96
locus group:
protein-coding gene
location:
3q13.13-q13.2
gene_family:
CD molecules|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
TACTILE
alias name:
T-cell surface protein tactile|T c…
entrez id:
10225
ensembl gene id:
ENSG00000153283
ucsc gene id:
uc003dxw.4
refseq accession:
NM_001318889
hgnc_id:
HGNC:16892
approved reserved:
2003-01-22

基因染色体位置

基因染色体位置

3q13.13-q13.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

The protein encoded by this gene belongs to the immunoglobulin superfamily. It is a type I membrane protein. The protein may play a role in the adhesive interactions of activated T and NK cells during the late phase of the immune response. It may also function in antigen presentation. Alternative splicing occurs at this locus and two transcript variants encoding distinct isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质属于免疫球蛋白超家族。它是一个I型膜蛋白。该蛋白可能在免疫反应的后期阶段发挥活化T细胞和NK细胞的粘附相互作用的作用。它也可起到在抗原呈递。选择性剪接发生在此位点和两个转录物变体编码不同同种型也已确定。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CD96基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs721335       rs721336       rs883113       rs924262       rs938213       rs968910       rs1282090       rs1297243       rs1298487       rs1299314       rs1391356       rs1391357       rs1398748       rs1398750       rs1464061       rs1467127       rs1472429      

基因表达

基因表达

CD96基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTCGGTGGAGGATAATGG
60
GTCTGTAGTCTGTACCAAGCT
59
CTTCTTTCTAAGGGTATAAAGGAGG
59
AATGTGGAATTGCTGATGAGG
59
TTTGTCAAGGGAGTTTGGGA
59
AGGTCAGGTTGACATCAGAG
59
AAGAAATGCTGGTGTAAGGTG
58
GGATGATGTAATAGACAGCACAG
59
GTATGCTTGTTCTGTATCCAGAG
59
ATTCATCTGCTGTAACGTGTG
59
TCAGTTTCACGGATACCTAGTG
60
GACCACAATACCAGTGATATGG
59
AGAAACTCCTGAGAATGGGT
58
CATCTGCTGTAACTTCCACTG
59
TCCTGAATAAGAGACTCTTTGG
57
GGATGATGTAATAGACAGCACAG
59
TATCTCCTGCAAGATATCCAGC
60
GTTGAGGAGTGGTGTTTGG
59
GGTCGGTGGAGGATAATGG
60
TAGTCTGTACCAAGCTTGACTC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CD96基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CD96基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
E9PEJ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
P40200 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
P40200 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
P40200 (UniProtKB)
TAS
GO:0005912
P40200 (UniProtKB)
IDA
GO:0006955
P40200 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
P40200 (UniProtKB)
TAS
GO:0007160
P40200 (UniProtKB)
IDA
GO:0050776
P40200 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CD96基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Opitz trigonocephaly syndrome 0.480271442 1 1 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET_UNIPROT
Bohring syndrome 0.120271442 1 1 BeFree_CTD_human
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Congenital Abnormality 0.002367032 1 0 GAD
Chromosomal translocation 0.002367032 1 0 GAD
Craniofacial Abnormalities 0.002367032 1 0 GAD
Glomerular filtration rate finding 0.002367032 1 1 GAD
Ki-1+ Anaplastic Large Cell Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Undifferentiated leukemia 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

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