CD27 (CD27 molecule)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CD27
locus group:
protein-coding gene
location:
12p13.31
gene_family:
CD molecules|Tumor necrosis factor receptor superfamily
alias symbol:
S152|Tp55
alias name:
CD27 antigen|T-cell activation ant…
entrez id:
939
ensembl gene id:
ENSG00000139193
ucsc gene id:
uc001qod.4
refseq accession:
NM_001242
hgnc_id:
HGNC:11922
approved reserved:
1992-06-10

基因染色体位置

基因染色体位置

12p13.31
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

The protein encoded by this gene is a member of the TNF-receptor superfamily. This receptor is required for generation and long-term maintenance of T cell immunity. It binds to ligand CD70, and plays a key role in regulating B-cell activation and immunoglobulin synthesis. This receptor transduces signals that lead to the activation of NF-kappaB and MAPK8/JNK. Adaptor proteins TRAF2 and TRAF5 have been shown to mediate the signaling process of this receptor. CD27-binding protein (SIVA), a proapoptotic protein, can bind to this receptor and is thought to play an important role in the apoptosis induced by this receptor. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是TNF受体超家族的成员。这种受体是必需的用于产生和长期维持T细胞免疫的。其结合到配体CD70，和在调节B细胞活化和免疫球蛋白合成的关键作用。这种受体转导，导致NF-κB和MAPK8 / JNK的活化信号。适配器蛋白TRAF2和TRAF5已经显示介导此受体的信号传导过程。 CD27结合蛋白（SIVA），促凋亡蛋白，可以结合到该受体，并认为在由该受体诱导的凋亡中起重要作用。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CD27基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs25680       rs1059501       rs2250246       rs2253610       rs2267965       rs2267966       rs2286596       rs2286597       rs2286598       rs2532502       rs2532503       rs2532504       rs2532507       rs2532508       rs2532509       rs2532510       rs2532511      

基因表达

基因表达

CD27基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGTGATCCTTGCATACCG
58
ACGAGAAGACCAGAGTTACAG
59
GTGTGATCCTTGCATACCG
59
ACGAGAAGACCAGAGTTACAG
59
TGAGCCAGGAACATTCCTC
59
CAGTTGCGAACGAGAAGAC
59
AGTGTGATCCTTGCATACC
57
CGAGAAGACCAGAGTTACAG
57
GTGAGCCAGGAACATTCCT
60
AGAGTTACAGTGCCGACAG
60
AGTGTGATCCTTGCATACC
57
CGAGAAGACCAGAGTTACAG
58
TGAGCCAGGAACATTCCTC
59
AGAGTTACAGTGCCGACAG
60
TGTGATCCTTGCATACCGG
60
ACGAGAAGACCAGAGTTACAG
59
TGTGATCCTTGCATACCGG
59
ACGAGAAGACCAGAGTTACAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CD27基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CD27基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004888
P26842 (UniProtKB)
NAS
GO:0005031
P26842 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
P26842 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P26842 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P26842 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P26842 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P26842 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
P26842 (UniProtKB)
NAS
GO:0005634
P26842 (UniProtKB)
IBA
GO:0005886
P26842 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
P26842 (UniProtKB)
IBA
GO:0005887
P26842 (UniProtKB)
NAS
GO:0006954
P26842 (UniProtKB)
IBA
GO:0006955
P26842 (UniProtKB)
IBA
GO:0007166
P26842 (UniProtKB)
NAS
GO:0007420
P26842 (UniProtKB)
IBA
GO:0008588
P26842 (UniProtKB)
NAS
GO:0008625
P26842 (UniProtKB)
IBA
GO:0009897
P26842 (UniProtKB)
IEA
GO:0016064
P26842 (UniProtKB)
NAS
GO:0032496
P26842 (UniProtKB)
IBA
GO:0033209
P26842 (UniProtKB)
TAS
GO:0042127
P26842 (UniProtKB)
IBA
GO:0043005
P26842 (UniProtKB)
IBA
GO:0043027
P26842 (UniProtKB)
IDA
GO:0043066
P26842 (UniProtKB)
IDA
GO:0043154
P26842 (UniProtKB)
IEA
GO:0043410
P26842 (UniProtKB)
IBA
GO:0045471
P26842 (UniProtKB)
IEA
GO:0045579
P26842 (UniProtKB)
NAS
GO:0046330
P26842 (UniProtKB)
ISS
GO:0070062
P26842 (UniProtKB)
IDA
GO:0070233
P26842 (UniProtKB)
IEA
GO:0097191
P26842 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CD27基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
LYMPHOPROLIFERATIVE SYNDROME 2 0.120271442 2 0 BeFree_UNIPROT
Peripheral Neuropathy 0.12 1 0 CTD_human
Cachexia 0.12 1 0 CTD_human
Alcoholic Liver Diseases 0.08 1 0 RGD
HIV Infections 0.008153188 21 0 BeFree_LHGDN
Lymphoma 0.007077352 7 0 BeFree_LHGDN
Lupus Erythematosus, Systemic 0.006534468 5 0 BeFree_LHGDN
Waldenstrom Macroglobulinemia 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Multiple Myeloma 0.002909916 3 0 BeFree_GAD
Asthma 0.002909916 3 0 BeFree_GAD

基因相关服务

基因相关服务

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山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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