CCNL2 (cyclin L2)

symbol:
CCNL2
locus group:
protein-coding gene
location:
1p36.33
gene_family:
Cyclins
alias symbol:
ania-6b|PCEE|SB138|HLA-ISO|CCNS
alias name:
cyclin S
entrez id:
81669
ensembl gene id:
ENSG00000221978
ucsc gene id:
uc001afi.3
refseq accession:
NM_030937
hgnc_id:
HGNC:20570
approved reserved:
2003-03-07
1p36.33
基因染色体位置图

CCNL2(Cyclin L2)属于细胞周期蛋白(Cyclin)家族,该家族成员通过结合并激活周期蛋白依赖性激酶(CDK)调控细胞周期进程。CCNL2主要在细胞周期G1/S期转换中发挥作用,参与转录调控和RNA剪接过程。其表达产物通过与CDK11形成复合物,影响RNA聚合酶II的磷酸化状态,从而调节基因转录延伸和mRNA加工。CCNL2在多种组织中广泛表达,尤其在增殖活跃的细胞中表达较高。该基因突变可能导致细胞周期紊乱,与肿瘤发生发展相关,例如在乳腺癌和肺癌中观察到CCNL2表达异常。CCNL2过表达可能促进细胞增殖并抑制凋亡,而降低表达则可能导致细胞周期阻滞或异常转录调控。Cyclin家族共性包括含有保守的周期蛋白盒结构域,通过CDK相互作用调控细胞周期不同阶段。CCNL2与其他周期蛋白(如Cyclin D、Cyclin E)协同工作,但其独特之处在于更侧重于转录调控而非直接的细胞周期驱动。研究表明CCNL2还参与DNA损伤应答,其表达水平变化可能影响基因组稳定性。在胚胎发育过程中,CCNL2对特定组织分化具有调控作用。由于其在细胞增殖和转录调控中的双重功能,CCNL2成为潜在的癌症治疗靶点,但其具体机制仍需进一步研究。

The protein encoded by this gene belongs to the cyclin family. Through its interaction with several proteins, such as RNA polymerase II, splicing factors, and cyclin-dependent kinases, this protein functions as a regulator of the pre-mRNA splicing process, as well as in inducing apoptosis by modulating the expression of apoptotic and antiapoptotic proteins. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2011]

由该基因编码的蛋白质属于细胞周期蛋白家族。通过其与几种蛋白质,例如RNA聚合酶II,剪接因子,和细胞周期蛋白依赖性激酶,该蛋白作为前mRNA剪接过程的调节器,以及在通过调节凋亡和抗凋亡的表达诱导凋亡相互作用蛋白质。编码不同同种型的可变剪接转录物变体已被用于这个基因说明。 [由RefSeq的,2011年8月提供]

CCNL2基因的碱基序列:[NCBI]
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CCNL2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1240707       rs1240708       rs1240743       rs1240744       rs1240745       rs1240746       rs1240747       rs1240748       rs2291889       rs2291890       rs2298286       rs3831366       rs3835458       rs4970444       rs9661288       rs9726836       rs11485864      

CCNL2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGAATTACATGAACGACAGC
58
GATTGGGCAAAGGGATCTC
58
GAATTACATGAACGACAGCCT
59
GATTGGGCAAAGGGATCTC
58
ACTCCATGGAGCATGTGTC
60
GGTGAAACACATTGATGACGT
60
GACTGGTGGAATTACATGAACG
60
CAGCAAGATAAATGCAGGCA
59
ACTCCATGGAGCATGTGTC
60
GGTGAAACACATTGATGACGT
60
GAATTACATGAACGACAGCCT
59
GATTGGGCAAAGGGATCTC
58
CAAGCTGGCTTGTCATCTG
59
GCATCACACTGAACTCTAGGT
60
GATTACAGCCTGGAGTGCA
60
GCTGAGGCACAAGAATCAC
59
GAATTACATGAACGACAGCCT
59
GATTGGGCAAAGGGATCTC
58
GATAATCGTTATGTACCTTCAGGTG
60
TCATGTAATTCCCTCAGAGGC
60
      尚未收录相关数据

CCNL2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CCNL2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
A0A0A0MSF3 (UniProtKB)
IEA
GO:0000079
J3QSH2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
J3QSH2 (UniProtKB)
IEA
GO:0019901
J3QSH2 (UniProtKB)
IEA
GO:0000307
Q96S94 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
Q96S94 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q96S94 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q96S94 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q96S94 (UniProtKB)
IEA
GO:0016538
Q96S94 (UniProtKB)
IBA
GO:0016607
Q96S94 (UniProtKB)
IEA
GO:0019901
Q96S94 (UniProtKB)
IEA
GO:0043231
Q96S94 (UniProtKB)
IDA
GO:0045737
Q96S94 (UniProtKB)
IBA
GO:0045944
Q96S94 (UniProtKB)
IBA
GO:1901409
Q96S94 (UniProtKB)
IBA

可能调控 CCNL2基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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