CCL13 (C-C motif chemokine ligand 13)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CCL13
locus group:
protein-coding gene
location:
17q12
gene_family:
Chemokine ligands|Endogenous ligands
alias symbol:
MCP-4|NCC-1|SCYL1|CKb10|MGC17134
alias name:
None
entrez id:
6357
ensembl gene id:
ENSG00000181374
ucsc gene id:
uc002hic.3
refseq accession:
NM_005408
hgnc_id:
HGNC:10611
approved reserved:
1997-02-11

基因染色体位置

基因染色体位置

17q12
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CCL13（Chemokine (C-C motif) ligand 13）是一种趋化因子，属于CC亚家族（β-趋化因子家族），其基因家族成员均含有两个相邻的半胱氨酸残基（C-C motif）。CCL13也被称为单核细胞趋化蛋白-4（MCP-4），主要通过与受体CCR2、CCR3和CCR5结合，招募免疫细胞（如单核细胞、嗜酸性粒细胞、T细胞）到炎症或感染部位，参与免疫调节和炎症反应。其表达产物为分泌型蛋白，由76个氨基酸组成，具有趋化活性和促炎作用。CCL13在肺部、肠道和皮肤等组织中表达较高，尤其在过敏性疾病（如哮喘）或寄生虫感染时表达显著上调。基因突变可能导致其趋化功能异常，例如受体结合能力下降，从而削弱免疫细胞招募，影响炎症控制，或与慢性炎症性疾病（如动脉粥样硬化）相关。过表达CCL13会加剧炎症反应，可能促进自身免疫病（如类风湿关节炎）或肿瘤微环境中免疫细胞的异常浸润；而表达降低可能导致免疫防御缺陷，增加感染风险。该基因家族（CC亚家族）的共性是通过CCR受体介导白细胞迁移，在炎症、感染和组织修复中起核心作用。目前CCL13的中文译名较统一，无显著争议。

This antimicrobial gene is one of several Cys-Cys (CC) cytokine genes clustered on the q-arm of chromosome 17. Cytokines are a family of secreted proteins involved in immunoregulatory and inflammatory processes. The CC cytokines are proteins characterized by two adjacent cysteines. The cytokine encoded by this gene displays chemotactic activity for monocytes, lymphocytes, basophils and eosinophils, but not neutrophils. This chemokine plays a role in accumulation of leukocytes during inflammation. It may also be involved in the recruitment of monocytes into the arterial wall during artherosclerosis. [provided by RefSeq, Sep 2014]

此抗微生物基因是聚集在染色体的q臂17细胞因子是参与免疫调节和炎症过程的分泌蛋白的一个家族几个半胱氨酸 - 半胱氨酸（CC）的细胞因子基因之一。在CC细胞因子是蛋白质特征在于两个相邻的半胱氨酸。由该基因编码的细胞因子显示单核细胞，淋巴细胞，嗜碱性粒细胞和嗜酸性粒细胞，但不是嗜中性粒细胞趋化活性。该趋化因子在炎症期间起着白细胞积累的作用。它也可能涉及在单核细胞进入血管壁的动脉粥样硬化过程中招聘。 [由RefSeq的，2014年9月提供]

OMIM数据库中对CCL13基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCL13基因的介绍

基因序列

基因序列

CCL13基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CCL13基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs159313       rs159314       rs1431991       rs2072069       rs2072070       rs3136674       rs3136675       rs3136676       rs3136677       rs11575023       rs34566308       rs35880803       rs72827014       rs72827015       rs72827017       rs73288078       rs73988388      

基因表达

基因表达

CCL13基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGATCTCCTTGCAGAGGC
60
TTTGGTTCTGAAGATGACAGC
59
TGCTGCTTCACATTTAGCA
58
GTTTGGTTCTGAAGCTGCT
59
TGCTGCTTCACATTTAGCAG
59
TTTGGTTCTGAAGCTGCTG
59
CAGAAGGCTGTCATCTTCAG
58
CATATAATTCTGGACCCACTTCTC
59
TAAGAAGATCTCCTTGCAGAG
57
GTTCTGAAGATGACAGCCT
57
TGCTGCTTCACATTTAGCA
58
TTTGGTTCTGAAGCTGCTG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
NFKB1
CCL13
Unknown
10049733
RELA
CCL13
Unknown
10049733
YY1
CCL13
Unknown
12805085

基因本体信息

CCL13基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CCL13基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
J3QLQ9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006955
J3QLQ9 (UniProtKB)
IEA
GO:0008009
J3QLQ9 (UniProtKB)
IEA
GO:0060326
J3QLQ9 (UniProtKB)
IEA
GO:0002548
Q99616 (UniProtKB)
IBA
GO:0005102
Q99616 (UniProtKB)
TAS
GO:0005102
Q99616 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
Q99616 (UniProtKB)
IEA
GO:0005623
Q99616 (UniProtKB)
IEA
GO:0006874
Q99616 (UniProtKB)
TAS
GO:0006935
Q99616 (UniProtKB)
TAS
GO:0006954
Q99616 (UniProtKB)
IEA
GO:0007010
Q99616 (UniProtKB)
IDA
GO:0007165
Q99616 (UniProtKB)
TAS
GO:0007165
Q99616 (UniProtKB)
TAS
GO:0007186
Q99616 (UniProtKB)
IBA
GO:0007267
Q99616 (UniProtKB)
TAS
GO:0008009
Q99616 (UniProtKB)
IDA
GO:0008360
Q99616 (UniProtKB)
IDA
GO:0030593
Q99616 (UniProtKB)
IBA
GO:0043547
Q99616 (UniProtKB)
IBA
GO:0048020
Q99616 (UniProtKB)
IBA
GO:0048245
Q99616 (UniProtKB)
IDA
GO:0048247
Q99616 (UniProtKB)
IBA
GO:0050729
Q99616 (UniProtKB)
IBA
GO:0070098
Q99616 (UniProtKB)
IBA
GO:0070374
Q99616 (UniProtKB)
IBA
GO:0071346
Q99616 (UniProtKB)
IBA
GO:0071347
Q99616 (UniProtKB)
IBA
GO:0071356
Q99616 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CCL13基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Macular Degeneration, Age-Related, 2 0.08 0 0 MGD
Asthma 0.003724241 6 0 BeFree_GAD
Dermatitis, Atopic 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Nephrosis 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Nasal Polyps 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Inflammation 0.00272435 1 0 LHGDN
Bronchiolitis, Viral 0.002367032 1 0 GAD
Respiratory Syncytial Virus Infections 0.002367032 1 0 GAD
Multiple Sclerosis 0.002367032 1 0 GAD
HIV Infections 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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