CCDC68 (coiled-coil domain containing 68)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CCDC68
locus group:
protein-coding gene
location:
18q21.2
gene_family:
alias symbol:
SE57-1
alias name:
cutaneous T-cell lymphoma associat…
entrez id:
80323
ensembl gene id:
ENSG00000166510
ucsc gene id:
uc002lft.3
refseq accession:
NM_025214
hgnc_id:
HGNC:24350
approved reserved:
2006-02-06

基因染色体位置

基因染色体位置

18q21.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

CCDC68（Coiled-Coil Domain Containing 68）是一种编码含有卷曲螺旋结构域的蛋白质的基因，属于CCDC基因家族。该家族成员通常具有卷曲螺旋结构域，参与蛋白质相互作用、细胞骨架组织、信号转导等生物学过程。CCDC68蛋白在细胞核中表达，与染色质重塑复合物相互作用，可能在转录调控、DNA修复和细胞周期进程中发挥作用。研究表明，CCDC68与组蛋白去乙酰化酶（HDAC）复合物相关，可能通过调节染色质结构影响基因表达。CCDC68的突变或表达异常可能与某些疾病相关，例如有研究发现其在某些癌症中表达异常，可能影响肿瘤的发生发展。CCDC68过表达可能导致细胞周期紊乱或转录调控异常，而降低表达可能影响DNA修复或染色质稳定性。此外，CCDC68可能与其他基因或蛋白协同作用，参与更广泛的细胞功能网络。由于研究尚在进展中，其具体机制和疾病关联仍需进一步探索。

None

无

OMIM数据库中对CCDC68基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCDC68基因的介绍

基因序列

基因序列

CCDC68基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CCDC68基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1344011       rs1893802       rs1893803       rs1944354       rs1944355       rs1944360       rs1944362       rs1944363       rs1944365       rs1944367       rs1944368       rs1944376       rs1944379       rs1944380       rs1944381       rs1944382       rs2000835      

基因表达

基因表达

CCDC68基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTAGATGCAAAGCACTGTGG
59
GTTCATTTCTAAGAGCTGTAGGTC
59
CCTTGTTGAAGAGGGAAGC
59
CTGTTGTCATTGTGAATTCTGG
58
CAATTACTCCAGGTTAACAAGC
58
TTCTCTGTACAAGGTTCTCCA
59
TTCTCCAGGAGCAGATCTC
58
TTAATCCTTCCATCTCCTGGA
58
AAATCAAGCTGCAAGCCTC
59
ACTTCTTCAGATTGCGTTTGG
60
CAATTACTCCAGGTTAACAAGC
58
TTCTCTGTACAAGGTTCTCCA
59
AAATCAAGCTGCAAGCCTC
59
ACTTCTTCAGATTGCGTTTGG
60
AAATCAAGCTGCAAGCCTC
59
ACTTCTTCAGATTGCGTTTGG
60
AAATCAAGCTGCAAGCCTC
59
CTTCTTCAGATTGCGTTTGGT
60
TAGATGCAAAGCACTGTGGA
60
GTTCATTTCTAAGAGCTGTAGGTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CCDC68基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CCDC68基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q9H2F9 (UniProtKB)
IPI
GO:0005622
Q9H2F9 (UniProtKB)
IBA
GO:0035556
Q9H2F9 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CCDC68基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Psychotic symptom 0.000271442 1 0 BeFree
Pancreatic Ductal Adenocarcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Schizophrenia 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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