CCDC62 (coiled-coil domain containing 62)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CCDC62
locus group:
protein-coding gene
location:
12q24.31
gene_family:
alias symbol:
TSP-NY|FLJ40344|CT109|ERAP75
alias name:
cancer/testis antigen 109
entrez id:
84660
ensembl gene id:
ENSG00000130783
ucsc gene id:
uc001udc.4
refseq accession:
NM_032573
hgnc_id:
HGNC:30723
approved reserved:
2006-01-23

基因染色体位置

基因染色体位置

12q24.31
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CCDC62基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs701484       rs839352       rs839353       rs839354       rs839355       rs839358       rs839359       rs839360       rs839361       rs839362       rs839363       rs858349       rs897393       rs937520       rs967281       rs1612324       rs1619142      

基因表达

基因表达

CCDC62基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTGTCCGCCTCAAATCTG
58
TGGCAATTAGCTCACTTGC
59
GAAACACCTATGAACCCTCC
58
GAGTTTCGTTTCTAGCCTGG
59
ACTACAGCTTCAGGAAATGG
58
AGAGTTTCGTTTCTAGCCTC
57
ACTACAGCTTCAGGAAATGG
58
AGAGTTTCGTTTCTAGCCTC
57
AATCTCGTCAGATGGTGAC
57
CCTCTGACTTATTTGTGGCA
58
AATCTCGTCAGATGGTGAC
57
CCTCTGACTTATTTGTGGCA
58
ATTGTCCGCCTCAAATCTG
58
TGGCAATTAGCTCACTTGC
58
ACCTTGAGGCTAGAAACGA
58
GTTCTCGAGCTTGTAGCTG
58
AATTGTCCGCCTCAAATCTG
59
GGCAATTAGCTCACTTGCC
60
AATTGTCCGCCTCAAATCTG
59
GGCAATTAGCTCACTTGCC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CCDC62基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CCDC62基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005654
A0A024RBT8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
A0A024RBT8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q6P9F0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q6P9F0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q6P9F0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q6P9F0 (UniProtKB)
IDA
GO:0030331
Q6P9F0 (UniProtKB)
IPI
GO:0030374
Q6P9F0 (UniProtKB)
IPI
GO:0045944
Q6P9F0 (UniProtKB)
IDA
GO:0071392
Q6P9F0 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CCDC62基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Parkinson Disease 0.122638474 3 3 BeFree_GAD_GWASCAT
Spastic paraplegia 10, autosomal dominant 0.000542884 2 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Neurodegenerative Disorders 0.000271442 1 0 BeFree
Infantile Refsum Disease (disorder) 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of testis 0.000271442 1 0 BeFree
Dystonia 0.000271442 1 0 BeFree
Essential Tremor 0.000271442 1 0 BeFree
Dystonia Disorders 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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