CCDC169-SOHLH2 (CCDC169-SOHLH2 readthrough)

symbol:
CCDC169-SOHLH2
locus group:
other
location:
13q13.3
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100526761
ensembl gene id:
ENSG00000250709
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uc010tei.3
refseq accession:
NM_001198910.1
hgnc_id:
HGNC:38866
approved reserved:
2011-02-21
13q13.3
基因染色体位置图

CCDC169-SOHLH2是一个融合基因,由CCDC169(卷曲螺旋结构域蛋白169)和SOHLH2(精子发生和卵子发生基本螺旋-环-螺旋转录因子2)基因的部分序列组成。SOHLH2属于bHLH(基本螺旋-环-螺旋)转录因子家族,该家族成员通常通过形成二聚体结合DNA来调控基因表达,在细胞分化、发育和肿瘤发生中起重要作用。SOHLH2主要在生殖细胞中表达,对精子和卵子的形成至关重要,它通过调控其他生殖相关基因(如NOBOX和FIGLA)的表达来维持生殖细胞的正常发育。CCDC169的功能目前研究较少,可能参与细胞骨架组织或信号转导。当SOHLH2发生突变时,可能导致生殖细胞发育异常,引起不育症或生殖系统肿瘤。SOHLH2过表达可能干扰正常生殖细胞分化程序,导致生殖细胞发育停滞或肿瘤发生;而表达降低则可能导致生殖细胞减少或消失,引发不育。该基因与卵巢早衰、非梗阻性无精症等生殖系统疾病密切相关。作为bHLH家族成员,SOHLH2具有典型的DNA结合和二聚化结构域,能够识别特定的DNA序列(E-box)来调控靶基因转录。bHLH家族基因广泛参与神经发生、肌生成和血细胞分化等多种发育过程,其异常表达常导致发育缺陷或癌症。目前对CCDC169-SOHLH2融合基因的具体功能尚不清楚,需要进一步研究来阐明其在生理和病理过程中的作用机制。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring C13orf38 (chromosome 13 open reading frame 38) and SOHLH2 (spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2) genes. The read-through transcript encodes a fusion protein that shares sequence identity with the products of each individual gene. [provided by RefSeq, Nov 2010]

此轨迹表示天然存在的相邻C13orf38(染色体13开放阅读框38)和SOHLH2(精子和卵子发生特异性的碱性螺旋 - 环 - 螺旋2)基因之间通读转录。的通读转录物编码共享与每个基因的产物的序列同一性的融合蛋白。 [由RefSeq的,2010年11月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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CCDC169-SOHLH2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs748983       rs748984       rs748985       rs748986       rs751518       rs751519       rs872720       rs872721       rs872722       rs912927       rs912928       rs912929       rs912930       rs932782       rs943893       rs943894       rs943895      

CCDC169-SOHLH2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGAAGCTGTGAGAGTTCCA
59
GCTGCACTGGAAATGTGAG
60
GTCCCTCAAACACTGTTAAGAC
59
GTTCGCTGTAGGACCTCTG
60
GACTAATACGTGCTGGAATGG
59
GAGCTTGATGGAACTCTCAC
58
      尚未收录相关数据

CCDC169-SOHLH2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CCDC169-SOHLH2基因的本体(GO)信息:

可能调控 CCDC169-SOHLH2基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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