CCAT2 (colon cancer associated transcript 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CCAT2
locus group:
non-coding RNA
location:
8q24.21
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
NCCP1|LINC00873
alias name:
long intergenic non-protein coding…
entrez id:
101805488
ensembl gene id:
ENSG00000280997
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_109834
hgnc_id:
HGNC:47044
approved reserved:
2013-06-22

基因染色体位置

基因染色体位置

8q24.21
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

CCAT2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3847137       rs6983267       rs7008058       rs7013278       rs10447996       rs10505475       rs10808556       rs12682374       rs17467139       rs34835043       rs60354025       rs67180956       rs67219047       rs67491583       rs68053148       rs72550838       rs72550839      

基因表达

基因表达

CCAT2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATCAACTTTCCCAGCCTC
58
TAATCATTTGGACGACGCCT
59
GATTTCCCTTCCAGCTCCA
59
GAGGTTAAGCAATTTGACCAG
57
CCTACGTAAGTTCTACCAGCA
59
TCAGGAATCAGGAGACACAG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CCAT2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CCAT2基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CCAT2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Colorectal Cancer 0.120271442 6 1 BeFree_GWASCAT
Malignant neoplasm of prostate 0.12 5 1 GWASCAT
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000814326 3 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Squamous cell carcinoma of esophagus 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Squamous cell carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备13024435号-2