CASC9 (cancer susceptibility 9)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC9
locus group:
non-coding RNA
location:
8q21.13
gene_family:
alias symbol:
LINC00981|ESCCAL-1|linc-JPH1
alias name:
long intergenic non-protein coding…
entrez id:
101805492
ensembl gene id:
ENSG00000249395
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_103848
hgnc_id:
HGNC:48906
approved reserved:
2013-07-01

基因染色体位置

基因染色体位置

8q21.13
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC9基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs967844       rs978598       rs978599       rs1072919       rs1074807       rs1351224       rs1351225       rs1382665       rs1382666       rs1382667       rs1382668       rs1600283       rs1817418       rs1842139       rs1871335       rs1904292       rs1912709      

基因表达

基因表达

CASC9基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTGCAGTTTGATCTCAGACTG
59
AAATCACATTCTGGTTCAGAGG
59
CCTCTTTAAAGTGATTGCTCAC
58
CAAACACCAAGACCATCCA
58
CTCTCCCTCTTTAAAGTGAATGTG
60
TCAACACCATGAATGTGGC
59
CAGAAATCACCCGTCTTCTG
59
AAATCACATTCGGAGGAGC
58
CCCTCTGAACCAGAATGTG
58
TCTCAACACCATGAATGTGG
58
CTCTCCCTCTTTAAAGTGAATGTG
60
CAACACCATGAATGTGGCT
59
GGCATTGAGAAGTTAGAATGTG
58
CAACACCATGAATGTGGCT
59
AGAAATCACCCGTCTTCTG
57
AAATCACATTCGGAGGAGC
58
CCCTCTTTAAAGTGATTGCTC
57
AAACACCAAGACCATCCAG
58
GAAATCACCCGTCTTCTGC
59
AATCACATTCGGAGGAGCC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC9基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC9基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC9基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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