CASC8 (cancer susceptibility 8)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC8
locus group:
non-coding RNA
location:
8q24.21
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
LINC00860|CARLo-1
alias name:
long intergenic non-protein coding…
entrez id:
727677
ensembl gene id:
ENSG00000246228
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_024393
hgnc_id:
HGNC:45129
approved reserved:
2013-07-01

基因染色体位置

基因染色体位置

8q24.21
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC8基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs283703       rs283704       rs283705       rs283706       rs283707       rs283714       rs283715       rs283716       rs283717       rs283718       rs283719       rs283720       rs283721       rs283722       rs283723       rs283724       rs283725      

基因表达

基因表达

CASC8基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTGACCTGAACTGTACCTG
59
TTTCTTGCAACCTGCACAG
59
AGCCAAGGAGCAATGAGAG
59
CTGGTGTATACCAGCAAGGA
59
TGACCTGAACTGTACCTGG
58
TTTCTTGCAACCTGCACAG
59
TCCTCCTTGCTGGTATACAC
58
GATGGAATTCTGTCACTTCCAC
59
GAGCTTCTTCTCTGGATCAC
57
CTTTCTTGCAACGTCAGTC
57
GACCTGAACTGTACCTGGG
59
TTTCTTGCAACCTGCACAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC8基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC8基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC8基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of prostate 0.12 4 1 GWASCAT
Colorectal Cancer 0.000271442 1 2 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 2 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 2 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 2 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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