CASC3 (CASC3 exon junction complex subunit)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC3
locus group:
protein-coding gene
location:
17q21.1
gene_family:
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MLN51|BTZ
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None
entrez id:
22794
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ENSG00000108349
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NM_007359
hgnc_id:
HGNC:17040
approved reserved:
2004-02-11

基因染色体位置

基因染色体位置

17q21.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

The product of this gene is a core component of the exon junction complex (EJC), a protein complex that is deposited on spliced mRNAs at exon-exon junctions and functions in nonsense-mediated mRNA decay (NMD). The encoded protein binds RNA and interacts with two other EJC core components. It is predominantly located in the cytoplasm, but shuttles into the nucleus where it localizes to nuclear speckles. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因的产物是外显子连接复合物（EJC），即在无义介导的mRNA降解（NMD）沉积在剪接的mRNA外显子 - 外显子接点和功能的蛋白质复合物的核心组件。所编码的蛋白质结合的RNA，并与其他两个EJC核心组件进行交互。它主要位于细胞质中，但是穿梭进入它定位于核斑点细胞核。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1107651       rs2030381       rs3923166       rs3923170       rs4496216       rs7206995       rs7212098       rs7213016       rs7214000       rs8076176       rs9894364       rs9896339       rs9898419       rs9898500       rs9899647       rs9901506       rs9904120      

基因表达

基因表达

CASC3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGTGAAGATGGCATTGAAGG
58
GTATTCACCTTCTTCACCTTCC
58
CTTCTTTCCTGCAACCACG
60
TGCAAAGTGAGCATTTCTTCC
60
AGTGAAGATGGCATTGAAGG
58
GTATTCACCTTCTTCACCTTCC
59
AGTGAAGATGGCATTGAAGG
58
GTATTCACCTTCTTCACCTTCC
59
CCTCATCTGTATCCTAATACACAG
58
GGTTATAGTAGGTCACTCCTCC
59
GAGGAAGTCAGACCCAAGG
59
CATAAAGAGCAATGAGCTCCTG
60
GAGGAAGTCAGACCCAAGG
59
CATAAAGAGCAATGAGCTCCTG
59
CATCTGTATCCTAATACACAGGC
58
GGTTATAGTAGGTCACTCCTCC
59
AAACAAGTCTCATCGCCAC
59
ATTTCTTCTCAATGGGCCTG
58
AAGAAATGGGTGTCCAGGG
60
TACTGATATGCACTGGAGGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003723
J3KSY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006397
J3KSY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0035145
J3KSY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0003723
J3QSC4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006397
J3QSC4 (UniProtKB)
IEA
GO:0035145
J3QSC4 (UniProtKB)
IEA
GO:0000184
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0000398
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O15234 (UniProtKB)
IPI
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O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O15234 (UniProtKB)
TAS
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O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
O15234 (UniProtKB)
TAS
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O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0006405
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0006406
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0006406
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0006406
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0006417
O15234 (UniProtKB)
IEA
GO:0008150
O15234 (UniProtKB)
ND
GO:0008298
O15234 (UniProtKB)
IEA
GO:0016070
O15234 (UniProtKB)
IBA
GO:0016607
O15234 (UniProtKB)
IEA
GO:0019899
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0019899
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0030529
O15234 (UniProtKB)
IEA
GO:0031124
O15234 (UniProtKB)
TAS
GO:0031625
O15234 (UniProtKB)
IPI
GO:0035145
O15234 (UniProtKB)
IDA
GO:0042802
O15234 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
O15234 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
O15234 (UniProtKB)
IDA
GO:0048471
O15234 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Rheumatoid Arthritis 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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