CASC22 (cancer susceptibility 22)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC22
locus group:
non-coding RNA
location:
16q12.1
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
TCONS_00024290|LincRNA-ENST00000515084
alias name:
None
entrez id:
283854
ensembl gene id:
ENSG00000260887
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_135281
hgnc_id:
HGNC:50627
approved reserved:
2014-05-30

基因染色体位置

基因染色体位置

16q12.1
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC22基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1362378       rs1477013       rs1894879       rs2387550       rs6498798       rs10521262       rs10521263       rs12325489       rs12930480       rs12932996       rs13332714       rs13336284       rs13336616       rs13339280       rs16951003       rs28480332       rs34296884      

基因表达

基因表达

CASC22基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCTCCTGAAACTAGATCCCA
59
CATTGGTCCTGAATTCCGC
59
ATACTGCAGAGATCCCAGAC
59
GCTCATTGGTCCTGAATTCC
59
TCCTGAAACTAGATCCCAGAC
59
CTCATTGGTCCTGAATTCCG
59
AATACTGCAGAGATCCCAGAC
59
CTCATTGGTCCTGAATTCCG
59
AGAAATACTGCAGAGATCCCA
59
ATTGGTCCTGAATTCCGCT
59
AGCTCCTGAAACTAGATCCC
59
ATTGGTCCTGAATTCCGCT
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC22基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC22基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC22基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 1 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 1 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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