CASC2 (cancer susceptibility 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC2
locus group:
non-coding RNA
location:
10q26.11
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
255082
ensembl gene id:
ENSG00000177640
ucsc gene id:
uc001ldm.5
refseq accession:
NR_026939
hgnc_id:
HGNC:22933
approved reserved:
2003-07-23

基因染色体位置

基因染色体位置

10q26.11
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1369       rs703422       rs703423       rs703424       rs703425       rs853565       rs853566       rs853567       rs853569       rs853575       rs853576       rs853577       rs853578       rs853579       rs853580       rs853581       rs853582      

基因表达

基因表达

CASC2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTGCATGAATTTCTAAGAGCC
58
CAGATGAGGGTACATCTTCTCC
60
CCTATTCCGAGTAAGAAGTGTG
58
CCAGCTTTAGAAATGTCCAGTG
60
AGCTTCTAAGGGTACATAAGAC
57
TCTTCTCCTGTGTCATGCA
59
GATGGAGATTCAGAAACATAAGGAC
60
ACACTTCTTACTCGGAATAGGG
59
GCATGAATTTCTAAGGTCTCTG
57
GATCCGAAATGCTTCATGC
58
CCAGTCCAATAAAGGTTGGA
58
TTTCTGGCTAATAGGTCTCAC
57
GCATGAATTTCTAAGAGCCAG
57
CATCTCCAGTGAATAAGTTGC
57
GTTGCATGAATTTCTAAGAGCC
58
CTGTGTTGATGTTGATTTGCAC
59
TCTGGAGAAACACAGAGGC
59
GTTTCTGAATCTCCATCGGG
59
CCTATTCCGAGTAAGAAGTGTG
58
CCCATCTCCAGACTTGTGAG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC2基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Endometrial Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Endometrial Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Uterine Corpus Cancer 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of endometrium 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Glioma 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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