CASC18 (cancer susceptibility 18)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC18
locus group:
non-coding RNA
location:
12q23.3
gene_family:
alias symbol:
LOC101929110
alias name:
None
entrez id:
101929110
ensembl gene id:
ENSG00000257859
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_110108
hgnc_id:
HGNC:49463
approved reserved:
2013-12-03

基因染色体位置

基因染色体位置

12q23.3
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

CASC18基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1819502       rs1962255       rs2374530       rs2374531       rs2374532       rs2374542       rs2374543       rs2374544       rs2374548       rs2888873       rs3741635       rs3741636       rs3741637       rs3863380       rs3863381       rs4130169       rs4132336      

基因表达

基因表达

CASC18基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGAGGGCAAAGAAGAAAGTG
59
CAGTCAGCATTGATAACTAACTCTG
60
ATTAGAGTCTGTAGTTAAGGCCC
60
CAGTCAGCATTGATAACTAACTCTG
60
GAGGGCAAAGAAGAAAGTGC
60
CAGTCAGCATTGATAACTAACTCTG
60
TTAGAGTCTGTAGTTAAGGCCC
59
CAGTCAGCATTGATAACTAACTCTG
60
CCCAATTAGAGTCTGTAGTTAAGG
59
GCATTGATAACTAACTCTGCTG
58
GCAAAGAAGAAAGTGCTTTGG
59
CAGTCAGCATTGATAACTAACTCTG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC18基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC18基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC18基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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