CASC16 (cancer susceptibility 16)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
CASC16
locus group:
non-coding RNA
location:
16q12.1-q12.2
gene_family:
alias symbol:
LOC643714
alias name:
None
entrez id:
643714
ensembl gene id:
ENSG00000249231
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_033920
hgnc_id:
HGNC:48608
approved reserved:
2013-05-24

基因染色体位置

基因染色体位置

16q12.1-q12.2
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

CASC16基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2335       rs3481       rs1109951       rs1112135       rs3104743       rs3104744       rs3104745       rs3104746       rs3104747       rs3104748       rs3104749       rs3104750       rs3104751       rs3104752       rs3104753       rs3104754       rs3104755      

基因表达

基因表达

CASC16基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACGGAGTAGTGCTCTTCTC
59
TGAAGGCTCTGTACCTCTG
58
AAGGGAAGCTGTCTCTTAGC
60
TGAACAATGAAAGCTGAAGACC
60
CTAGAGACGGTGGAAACCA
59
GACTTCAAAGTCCTGACTCC
58
AAGGGAAGCTGTCTCTTAGC
60
AACAATGAAAGCTGAAGACCC
59
TCTAGAGACGGTGGAAACC
58
ACTTCAAAGTCCTGACTCCA
59
CGGAGTAGTGCTCTTCTCC
59
TGAAGGCTCTGTACCTCTG
58
AAGGGAAGCTGTCTCTTAGC
60
CAATGAAAGCTGAAGACCCAG
60
TTCTAGAGACGGTGGAAACC
59
CTTCAAAGTCCTGACTCCAC
58
CGGAGTAGTGCTCTTCTCC
59
GAAGGCTCTGTACCTCTGC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

CASC16基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

CASC16基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 CASC16基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0.127915422 17 4 BeFree_GAD_GWASCAT
Restless Legs Syndrome 0.12 1 1 GWASCAT
Malignant neoplasm of ovary 0.002367032 1 0 GAD
Breast Carcinoma 0.000814326 3 1 BeFree
Mammographic Density 0.000271442 1 3 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备13024435号-2